MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013158	CGC	2	6	313116	313121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051411
6502	NC_013158	ACG	2	6	313205	313210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6503	NC_013158	CGA	2	6	313251	313256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6504	NC_013158	CGG	2	6	313263	313268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051411
6505	NC_013158	CG	3	6	313273	313278	0 %	0 %	50 %	50 %	257051411
6506	NC_013158	TCG	2	6	313280	313285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6507	NC_013158	GGT	2	6	313299	313304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051411
6508	NC_013158	TCG	2	6	313314	313319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6509	NC_013158	TCG	2	6	313340	313345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6510	NC_013158	CGA	2	6	313398	313403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6511	NC_013158	TCG	2	6	313424	313429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6512	NC_013158	CGT	2	6	313443	313448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6513	NC_013158	CGG	2	6	313455	313460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051411
6514	NC_013158	CGT	2	6	313509	313514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6515	NC_013158	AGG	2	6	313574	313579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051411
6516	NC_013158	CCGG	2	8	313659	313666	0 %	0 %	50 %	50 %	257051411
6517	NC_013158	GTC	2	6	313714	313719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6518	NC_013158	GAC	2	6	313810	313815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6519	NC_013158	GCG	2	6	313836	313841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051411
6520	NC_013158	CGA	2	6	313917	313922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6521	NC_013158	GCTG	2	8	313963	313970	0 %	25 %	50 %	25 %	257051411
6522	NC_013158	CGT	2	6	313997	314002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6523	NC_013158	GAC	2	6	314023	314028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6524	NC_013158	CGT	2	6	314034	314039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6525	NC_013158	GC	3	6	314338	314343	0 %	0 %	50 %	50 %	257051412
6526	NC_013158	GATC	2	8	314365	314372	25 %	25 %	25 %	25 %	257051412
6527	NC_013158	CGC	2	6	314434	314439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051412
6528	NC_013158	CTA	2	6	314445	314450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051412
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6530	NC_013158	GAC	2	6	314649	314654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051413
6531	NC_013158	ATC	2	6	314742	314747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051413
6532	NC_013158	ACG	3	9	314752	314760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051413
6533	NC_013158	CGT	2	6	314762	314767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051413
6534	NC_013158	GCG	2	6	314794	314799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051413
6535	NC_013158	GAA	2	6	314817	314822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051413
6536	NC_013158	CGT	2	6	314877	314882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051414
6537	NC_013158	TCG	2	6	314888	314893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051414
6538	NC_013158	GCG	2	6	314919	314924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051414
6539	NC_013158	TCGA	2	8	314951	314958	25 %	25 %	25 %	25 %	257051414
6540	NC_013158	GC	3	6	314970	314975	0 %	0 %	50 %	50 %	257051414
6541	NC_013158	GAG	2	6	314998	315003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051414
6542	NC_013158	TCG	3	9	315026	315034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051414
6543	NC_013158	TCA	2	6	315083	315088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051414
6544	NC_013158	CGA	2	6	315111	315116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051414
6545	NC_013158	CGT	2	6	315123	315128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051414
6546	NC_013158	TGC	2	6	315133	315138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051414
6547	NC_013158	CAGC	2	8	315144	315151	25 %	0 %	25 %	50 %	257051414
6548	NC_013158	ATGC	2	8	315184	315191	25 %	25 %	25 %	25 %	257051414
6549	NC_013158	TCG	2	6	315197	315202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051414
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6551	NC_013158	CGA	3	9	315303	315311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051414
6552	NC_013158	GCC	2	6	315326	315331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051414
6553	NC_013158	CGC	3	9	315340	315348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051414
6554	NC_013158	CCGCG	2	10	315363	315372	0 %	0 %	40 %	60 %	257051414
6555	NC_013158	CTC	2	6	315394	315399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051414
6556	NC_013158	GAG	2	6	315589	315594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051415
6557	NC_013158	CGA	2	6	315618	315623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051415
6558	NC_013158	TGCT	2	8	315637	315644	0 %	50 %	25 %	25 %	257051415
6559	NC_013158	CAG	2	6	315726	315731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051415
6560	NC_013158	CGG	2	6	315738	315743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051415
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6567	NC_013158	CG	4	8	316131	316138	0 %	0 %	50 %	50 %	257051415
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6588	NC_013158	CG	3	6	317563	317568	0 %	0 %	50 %	50 %	257051417
6589	NC_013158	ATGCC	2	10	317598	317607	20 %	20 %	20 %	40 %	257051417
6590	NC_013158	GGACG	2	10	317632	317641	20 %	0 %	60 %	20 %	257051417
6591	NC_013158	GAC	2	6	317680	317685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051417
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6594	NC_013158	AGAC	2	8	317949	317956	50 %	0 %	25 %	25 %	257051417
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6598	NC_013158	CGA	2	6	318163	318168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051417
6599	NC_013158	AACGC	2	10	318312	318321	40 %	0 %	20 %	40 %	257051417
6600	NC_013158	CGT	2	6	318334	318339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051417
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6602	NC_013158	ACC	2	6	318444	318449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051417
6603	NC_013158	GGTTC	2	10	318460	318469	0 %	40 %	40 %	20 %	257051417
6604	NC_013158	TCC	2	6	318483	318488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051417
6605	NC_013158	TCG	2	6	318597	318602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051417
6606	NC_013158	TCGG	2	8	318717	318724	0 %	25 %	50 %	25 %	257051417
6607	NC_013158	GAAC	2	8	318811	318818	50 %	0 %	25 %	25 %	257051417
6608	NC_013158	CGA	2	6	318967	318972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051417
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6610	NC_013158	CGACG	2	10	319072	319081	20 %	0 %	40 %	40 %	257051417
6611	NC_013158	GACG	2	8	319097	319104	25 %	0 %	50 %	25 %	257051417
6612	NC_013158	GCG	2	6	319110	319115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051417
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6618	NC_013158	GTG	2	6	319380	319385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051417
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6620	NC_013158	CAG	2	6	319470	319475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051418
6621	NC_013158	CGA	2	6	319490	319495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051418
6622	NC_013158	CGGC	2	8	319549	319556	0 %	0 %	50 %	50 %	257051418
6623	NC_013158	CGA	2	6	319562	319567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051418
6624	NC_013158	CCG	3	9	319615	319623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051418
6625	NC_013158	CGA	2	6	319637	319642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051418
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6627	NC_013158	GCCG	2	8	319779	319786	0 %	0 %	50 %	50 %	257051418
6628	NC_013158	CAT	2	6	319815	319820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051418
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6631	NC_013158	CGGA	2	8	319915	319922	25 %	0 %	50 %	25 %	257051418
6632	NC_013158	CGATCG	2	12	319979	319990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051418
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6635	NC_013158	TCG	3	9	320191	320199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051418
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6648	NC_013158	CGA	2	6	320607	320612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051418
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6741	NC_013158	CCG	2	6	325853	325858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051424
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6743	NC_013158	GCG	2	6	325903	325908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051424
6744	NC_013158	CGA	2	6	325944	325949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051424
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6981	NC_013158	CGA	2	6	337237	337242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051437
6982	NC_013158	TCGA	2	8	337251	337258	25 %	25 %	25 %	25 %	257051437
6983	NC_013158	GTC	2	6	337296	337301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051437
6984	NC_013158	TCG	2	6	337317	337322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051437
6985	NC_013158	GC	3	6	337453	337458	0 %	0 %	50 %	50 %	257051437
6986	NC_013158	CCGT	2	8	337480	337487	0 %	25 %	25 %	50 %	257051437
6987	NC_013158	ATC	2	6	337674	337679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051438
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6989	NC_013158	GCC	2	6	337729	337734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051438
6990	NC_013158	CGC	2	6	337834	337839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051438
6991	NC_013158	CCA	2	6	337896	337901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051438
6992	NC_013158	CGG	2	6	338091	338096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051438
6993	NC_013158	CGT	2	6	338097	338102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051438
6994	NC_013158	C	6	6	338185	338190	0 %	0 %	0 %	100 %	257051438
6995	NC_013158	AGCC	2	8	338213	338220	25 %	0 %	25 %	50 %	257051438
6996	NC_013158	ACAGCG	2	12	338235	338246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051438
6997	NC_013158	CGTC	2	8	338296	338303	0 %	25 %	25 %	50 %	257051438
6998	NC_013158	CGG	2	6	338329	338334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051438
6999	NC_013158	GAA	2	6	338371	338376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051438
7000	NC_013158	CGA	2	6	338412	338417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051438

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