MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61002	NC_013158	CGG	2	6	2852192	2852197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053840
61003	NC_013158	AGTC	2	8	2852227	2852234	25 %	25 %	25 %	25 %	257053840
61004	NC_013158	CTC	2	6	2852291	2852296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053840
61005	NC_013158	CAACG	2	10	2852315	2852324	40 %	0 %	20 %	40 %	257053840
61006	NC_013158	CGT	2	6	2852353	2852358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053840
61007	NC_013158	CAC	2	6	2852366	2852371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053840
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61009	NC_013158	TCA	2	6	2852437	2852442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053840
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61013	NC_013158	GGGT	2	8	2853316	2853323	0 %	25 %	75 %	0 %	257053842
61014	NC_013158	CGG	2	6	2853353	2853358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053842
61015	NC_013158	GCA	2	6	2853385	2853390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053842
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61017	NC_013158	CGG	2	6	2853470	2853475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053842
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61019	NC_013158	CCGA	2	8	2853526	2853533	25 %	0 %	25 %	50 %	257053842
61020	NC_013158	ACGTTC	2	12	2853553	2853564	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257053842
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61041	NC_013158	CGT	2	6	2855113	2855118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053844
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61045	NC_013158	TGA	2	6	2855359	2855364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053844
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61050	NC_013158	GAC	2	6	2855600	2855605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053844
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61052	NC_013158	GAG	2	6	2855798	2855803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053844
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61054	NC_013158	CGC	2	6	2855823	2855828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053844
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61057	NC_013158	CGA	2	6	2856424	2856429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053845
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61063	NC_013158	CGA	2	6	2856658	2856663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053845
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61114	NC_013158	GCG	2	6	2858742	2858747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053846
61115	NC_013158	CCT	2	6	2858758	2858763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053846
61116	NC_013158	CGT	2	6	2858823	2858828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053846
61117	NC_013158	C	6	6	2858843	2858848	0 %	0 %	0 %	100 %	257053846
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61141	NC_013158	CGG	2	6	2860741	2860746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053847
61142	NC_013158	CGA	2	6	2860772	2860777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053847
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61332	NC_013158	ACG	2	6	2869055	2869060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053858
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61339	NC_013158	GC	3	6	2869245	2869250	0 %	0 %	50 %	50 %	257053858
61340	NC_013158	AC	3	6	2869277	2869282	50 %	0 %	0 %	50 %	257053858
61341	NC_013158	CGC	2	6	2869300	2869305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053858
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61343	NC_013158	CGGG	2	8	2869360	2869367	0 %	0 %	75 %	25 %	257053858
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61456	NC_013158	CGGAT	2	10	2874845	2874854	20 %	20 %	40 %	20 %	257053864
61457	NC_013158	CGT	2	6	2874907	2874912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
61458	NC_013158	TCG	2	6	2874916	2874921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
61459	NC_013158	TCG	2	6	2874924	2874929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
61460	NC_013158	GACC	2	8	2874952	2874959	25 %	0 %	25 %	50 %	257053864
61461	NC_013158	GTC	3	9	2874988	2874996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
61462	NC_013158	TCTG	2	8	2875026	2875033	0 %	50 %	25 %	25 %	257053864
61463	NC_013158	CG	3	6	2875358	2875363	0 %	0 %	50 %	50 %	257053865
61464	NC_013158	GC	3	6	2875391	2875396	0 %	0 %	50 %	50 %	257053865
61465	NC_013158	CGA	2	6	2875398	2875403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053865
61466	NC_013158	CGA	2	6	2875431	2875436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053865
61467	NC_013158	ACA	2	6	2875451	2875456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053865
61468	NC_013158	CAT	2	6	2875465	2875470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053865
61469	NC_013158	GGA	2	6	2875482	2875487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053865
61470	NC_013158	CGA	2	6	2875509	2875514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053865
61471	NC_013158	CGAG	3	12	2875538	2875549	25 %	0 %	50 %	25 %	257053865
61472	NC_013158	CGA	2	6	2875552	2875557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053865
61473	NC_013158	CAT	2	6	2875578	2875583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053865
61474	NC_013158	CAT	2	6	2875699	2875704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053866
61475	NC_013158	GC	3	6	2875713	2875718	0 %	0 %	50 %	50 %	257053866
61476	NC_013158	AGATC	2	10	2875749	2875758	40 %	20 %	20 %	20 %	257053866
61477	NC_013158	ATG	2	6	2875874	2875879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053866
61478	NC_013158	GCT	2	6	2875915	2875920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053866
61479	NC_013158	GATAT	2	10	2876012	2876021	40 %	40 %	20 %	0 %	257053867
61480	NC_013158	GAC	2	6	2876114	2876119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053867
61481	NC_013158	CGC	2	6	2876146	2876151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053867
61482	NC_013158	CG	3	6	2876175	2876180	0 %	0 %	50 %	50 %	257053867
61483	NC_013158	CCGC	2	8	2876185	2876192	0 %	0 %	25 %	75 %	257053867
61484	NC_013158	GAC	2	6	2876221	2876226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053867
61485	NC_013158	CCG	2	6	2876280	2876285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053867
61486	NC_013158	GAC	2	6	2876366	2876371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053867
61487	NC_013158	CCGGA	2	10	2876384	2876393	20 %	0 %	40 %	40 %	257053867
61488	NC_013158	GGA	2	6	2876407	2876412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053867
61489	NC_013158	GATC	2	8	2876425	2876432	25 %	25 %	25 %	25 %	257053867
61490	NC_013158	CGA	2	6	2876458	2876463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053867
61491	NC_013158	CGA	2	6	2876503	2876508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053867
61492	NC_013158	C	6	6	2876530	2876535	0 %	0 %	0 %	100 %	257053867
61493	NC_013158	GTG	2	6	2876685	2876690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053867
61494	NC_013158	CAT	2	6	2876704	2876709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053867
61495	NC_013158	GAC	2	6	2876720	2876725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053867
61496	NC_013158	TCGA	2	8	2876823	2876830	25 %	25 %	25 %	25 %	257053868
61497	NC_013158	ATC	2	6	2876891	2876896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053868
61498	NC_013158	TCTG	2	8	2876925	2876932	0 %	50 %	25 %	25 %	257053868
61499	NC_013158	CGC	2	6	2876968	2876973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053868
61500	NC_013158	TCC	2	6	2877061	2877066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053868

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