MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013158	CGCGC	2	10	267780	267789	0 %	0 %	40 %	60 %	257051368
5502	NC_013158	CGA	2	6	267814	267819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051368
5503	NC_013158	TCG	2	6	267843	267848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051368
5504	NC_013158	CTC	2	6	267875	267880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051368
5505	NC_013158	CGT	2	6	267901	267906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051368
5506	NC_013158	CAA	2	6	268069	268074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051369
5507	NC_013158	CTC	2	6	268088	268093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051369
5508	NC_013158	ATC	2	6	268239	268244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051369
5509	NC_013158	GC	3	6	268272	268277	0 %	0 %	50 %	50 %	257051369
5510	NC_013158	CGG	2	6	268369	268374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051369
5511	NC_013158	TCG	2	6	268425	268430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
5512	NC_013158	CTC	2	6	268472	268477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051369
5513	NC_013158	CCT	2	6	268549	268554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051369
5514	NC_013158	CTC	3	9	268565	268573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051369
5515	NC_013158	ATG	2	6	268620	268625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051369
5516	NC_013158	GATGCC	2	12	268727	268738	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051369
5517	NC_013158	CGT	2	6	268747	268752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
5518	NC_013158	TCGTC	2	10	268756	268765	0 %	40 %	20 %	40 %	257051369
5519	NC_013158	CGA	2	6	268783	268788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051369
5520	NC_013158	TCG	2	6	268809	268814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
5521	NC_013158	TCC	2	6	268821	268826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051369
5522	NC_013158	GAGC	2	8	268979	268986	25 %	0 %	50 %	25 %	257051369
5523	NC_013158	CGT	2	6	269006	269011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
5524	NC_013158	TCG	2	6	269040	269045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
5525	NC_013158	TCG	2	6	269076	269081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
5526	NC_013158	GCG	3	9	269148	269156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051369
5527	NC_013158	GCG	2	6	269172	269177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051369
5528	NC_013158	GAT	2	6	269210	269215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051369
5529	NC_013158	TCG	2	6	269259	269264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
5530	NC_013158	CGG	2	6	269431	269436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051370
5531	NC_013158	GAC	2	6	269468	269473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051370
5532	NC_013158	CG	3	6	269474	269479	0 %	0 %	50 %	50 %	257051370
5533	NC_013158	ATCCC	2	10	269541	269550	20 %	20 %	0 %	60 %	257051370
5534	NC_013158	CGGTT	2	10	269568	269577	0 %	40 %	40 %	20 %	257051370
5535	NC_013158	AAG	2	6	269607	269612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051370
5536	NC_013158	CAG	2	6	269666	269671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051370
5537	NC_013158	CGA	3	9	269749	269757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051370
5538	NC_013158	TCGA	2	8	269790	269797	25 %	25 %	25 %	25 %	257051370
5539	NC_013158	ATCC	2	8	269822	269829	25 %	25 %	0 %	50 %	257051370
5540	NC_013158	CGT	2	6	269851	269856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051370
5541	NC_013158	GA	3	6	269898	269903	50 %	0 %	50 %	0 %	257051370
5542	NC_013158	CGG	2	6	269932	269937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051370
5543	NC_013158	CCG	2	6	269991	269996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051370
5544	NC_013158	CTCG	2	8	270009	270016	0 %	25 %	25 %	50 %	257051370
5545	NC_013158	CTC	2	6	270026	270031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051370
5546	NC_013158	CGTCG	2	10	270086	270095	0 %	20 %	40 %	40 %	257051370
5547	NC_013158	TGAC	2	8	270242	270249	25 %	25 %	25 %	25 %	257051371
5548	NC_013158	CTGGC	2	10	270311	270320	0 %	20 %	40 %	40 %	257051371
5549	NC_013158	GTT	2	6	270333	270338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051371
5550	NC_013158	TACG	2	8	270396	270403	25 %	25 %	25 %	25 %	257051371
5551	NC_013158	AGC	2	6	270415	270420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051371
5552	NC_013158	TCG	2	6	270503	270508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051371
5553	NC_013158	CGT	2	6	270641	270646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051371
5554	NC_013158	CGA	2	6	270704	270709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051371
5555	NC_013158	TCGTC	2	10	270714	270723	0 %	40 %	20 %	40 %	257051371
5556	NC_013158	GGGCA	2	10	270825	270834	20 %	0 %	60 %	20 %	257051371
5557	NC_013158	CAA	2	6	270888	270893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051371
5558	NC_013158	CGA	2	6	270915	270920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051371
5559	NC_013158	GTC	2	6	270962	270967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051372
5560	NC_013158	TCC	2	6	270969	270974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051372
5561	NC_013158	CGA	2	6	270997	271002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051372
5562	NC_013158	GAC	2	6	271009	271014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051372
5563	NC_013158	CACGG	2	10	271027	271036	20 %	0 %	40 %	40 %	257051372
5564	NC_013158	ATC	2	6	271055	271060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051372
5565	NC_013158	ACCG	2	8	271106	271113	25 %	0 %	25 %	50 %	257051372
5566	NC_013158	GGGA	2	8	271173	271180	25 %	0 %	75 %	0 %	257051372
5567	NC_013158	GCCA	2	8	271206	271213	25 %	0 %	25 %	50 %	257051372
5568	NC_013158	GCT	2	6	271261	271266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051372
5569	NC_013158	GGT	2	6	271267	271272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051372
5570	NC_013158	ACCA	2	8	271334	271341	50 %	0 %	0 %	50 %	257051372
5571	NC_013158	TGC	2	6	271357	271362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051372
5572	NC_013158	CGT	2	6	271435	271440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051372
5573	NC_013158	AGT	2	6	271476	271481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051372
5574	NC_013158	CGA	2	6	271691	271696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051373
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5577	NC_013158	CCG	2	6	271781	271786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051373
5578	NC_013158	GCTG	2	8	271807	271814	0 %	25 %	50 %	25 %	257051373
5579	NC_013158	ACA	2	6	271840	271845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051373
5580	NC_013158	CGT	2	6	271899	271904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051373
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5587	NC_013158	GC	3	6	272144	272149	0 %	0 %	50 %	50 %	257051374
5588	NC_013158	CTC	2	6	272177	272182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051374
5589	NC_013158	ACG	2	6	272232	272237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051374
5590	NC_013158	CCT	2	6	272287	272292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051374
5591	NC_013158	GAG	2	6	272297	272302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051374
5592	NC_013158	GAG	2	6	272333	272338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051374
5593	NC_013158	ACGT	2	8	272339	272346	25 %	25 %	25 %	25 %	257051374
5594	NC_013158	GAC	3	9	272366	272374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051374
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5598	NC_013158	CGC	2	6	272526	272531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051374
5599	NC_013158	CGA	4	12	272545	272556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051374
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5601	NC_013158	GTC	2	6	272705	272710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051374
5602	NC_013158	GCT	2	6	272737	272742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051374
5603	NC_013158	GTC	2	6	272783	272788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051374
5604	NC_013158	CGT	2	6	272820	272825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051375
5605	NC_013158	TC	3	6	272859	272864	0 %	50 %	0 %	50 %	257051375
5606	NC_013158	GTC	2	6	272962	272967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051375
5607	NC_013158	GTT	2	6	272994	272999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051375
5608	NC_013158	TCGGA	2	10	273014	273023	20 %	20 %	40 %	20 %	257051375
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5610	NC_013158	C	6	6	273130	273135	0 %	0 %	0 %	100 %	257051375
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5615	NC_013158	TAC	2	6	273436	273441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051375
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5740	NC_013158	CGG	2	6	280162	280167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051384
5741	NC_013158	TCG	2	6	280172	280177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051384
5742	NC_013158	CGT	2	6	280227	280232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051384
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5744	NC_013158	CG	4	8	280320	280327	0 %	0 %	50 %	50 %	257051384
5745	NC_013158	CGCC	2	8	280329	280336	0 %	0 %	25 %	75 %	257051384
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5752	NC_013158	GC	3	6	280472	280477	0 %	0 %	50 %	50 %	257051384
5753	NC_013158	GAT	2	6	280491	280496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051384
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5775	NC_013158	CG	3	6	281325	281330	0 %	0 %	50 %	50 %	257051384
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5855	NC_013158	GTC	2	6	284348	284353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051386
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5977	NC_013158	CGA	2	6	290153	290158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051393
5978	NC_013158	GTT	2	6	290165	290170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051393
5979	NC_013158	GGT	3	9	290177	290185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051393
5980	NC_013158	GGT	2	6	290216	290221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051393
5981	NC_013158	TCGGA	2	10	290224	290233	20 %	20 %	40 %	20 %	257051393
5982	NC_013158	CG	3	6	290314	290319	0 %	0 %	50 %	50 %	257051393
5983	NC_013158	CCG	2	6	290373	290378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051393
5984	NC_013158	GTG	2	6	290433	290438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051393
5985	NC_013158	CGA	2	6	290452	290457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051393
5986	NC_013158	ACG	2	6	290461	290466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051393
5987	NC_013158	CGCC	2	8	290479	290486	0 %	0 %	25 %	75 %	257051393
5988	NC_013158	TGG	2	6	290509	290514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051393
5989	NC_013158	CTG	2	6	290535	290540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051393
5990	NC_013158	GCC	2	6	290556	290561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051393
5991	NC_013158	CGC	2	6	290594	290599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051393
5992	NC_013158	CG	3	6	290606	290611	0 %	0 %	50 %	50 %	257051393
5993	NC_013158	AGC	2	6	290616	290621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051393
5994	NC_013158	CGG	2	6	290652	290657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051393
5995	NC_013158	CAC	2	6	290662	290667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051393
5996	NC_013158	ATCGCC	2	12	290673	290684	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051393
5997	NC_013158	CTCG	2	8	290723	290730	0 %	25 %	25 %	50 %	257051393
5998	NC_013158	CGC	2	6	290767	290772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051393
5999	NC_013158	GGT	2	6	290777	290782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051393
6000	NC_013158	CTG	2	6	290847	290852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051393

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