MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_013158	TGGGA	2	10	2686329	2686338	20 %	20 %	60 %	0 %	257053685
57502	NC_013158	CGG	2	6	2686408	2686413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053685
57503	NC_013158	GC	3	6	2686448	2686453	0 %	0 %	50 %	50 %	257053685
57504	NC_013158	CGC	2	6	2686466	2686471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57505	NC_013158	GCCGG	2	10	2686518	2686527	0 %	0 %	60 %	40 %	257053685
57506	NC_013158	GTC	2	6	2686538	2686543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57507	NC_013158	CCAG	2	8	2686586	2686593	25 %	0 %	25 %	50 %	257053685
57508	NC_013158	GAC	2	6	2686640	2686645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57509	NC_013158	AGG	2	6	2686684	2686689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053685
57510	NC_013158	GCT	2	6	2686724	2686729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57511	NC_013158	CGA	2	6	2686778	2686783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57512	NC_013158	CTG	2	6	2686815	2686820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57513	NC_013158	ACG	3	9	2686900	2686908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57514	NC_013158	CCG	2	6	2686995	2687000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57515	NC_013158	CCG	2	6	2687053	2687058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57516	NC_013158	GACC	2	8	2687077	2687084	25 %	0 %	25 %	50 %	257053685
57517	NC_013158	CCG	2	6	2687160	2687165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57518	NC_013158	GCCG	2	8	2687204	2687211	0 %	0 %	50 %	50 %	257053685
57519	NC_013158	CGG	2	6	2687251	2687256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053685
57520	NC_013158	CCG	2	6	2687281	2687286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57521	NC_013158	GCG	2	6	2687344	2687349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053685
57522	NC_013158	CCG	2	6	2687386	2687391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57523	NC_013158	CCA	2	6	2687417	2687422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053685
57524	NC_013158	CGA	2	6	2687441	2687446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57525	NC_013158	GCC	2	6	2687453	2687458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57526	NC_013158	TAC	2	6	2687595	2687600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053685
57527	NC_013158	GCCG	2	8	2687696	2687703	0 %	0 %	50 %	50 %	257053685
57528	NC_013158	GCG	2	6	2687766	2687771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053685
57529	NC_013158	ACCG	2	8	2687806	2687813	25 %	0 %	25 %	50 %	257053685
57530	NC_013158	GCCG	2	8	2687872	2687879	0 %	0 %	50 %	50 %	257053685
57531	NC_013158	CGA	2	6	2687905	2687910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57532	NC_013158	CGC	2	6	2687921	2687926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57533	NC_013158	TCC	2	6	2687939	2687944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053685
57534	NC_013158	CCG	2	6	2687976	2687981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57535	NC_013158	GGGA	2	8	2687989	2687996	25 %	0 %	75 %	0 %	257053685
57536	NC_013158	ACG	2	6	2688078	2688083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57537	NC_013158	CGGG	2	8	2688089	2688096	0 %	0 %	75 %	25 %	257053685
57538	NC_013158	ACTCGA	2	12	2688131	2688142	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257053685
57539	NC_013158	TGA	2	6	2688167	2688172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053685
57540	NC_013158	ACG	2	6	2688304	2688309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57541	NC_013158	CGC	2	6	2688317	2688322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57542	NC_013158	GAC	2	6	2688368	2688373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57543	NC_013158	CATCCC	2	12	2688374	2688385	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	257053685
57544	NC_013158	CCGA	2	8	2688402	2688409	25 %	0 %	25 %	50 %	257053685
57545	NC_013158	CGAG	2	8	2688421	2688428	25 %	0 %	50 %	25 %	257053685
57546	NC_013158	CGAC	2	8	2688470	2688477	25 %	0 %	25 %	50 %	257053685
57547	NC_013158	GC	3	6	2688499	2688504	0 %	0 %	50 %	50 %	257053685
57548	NC_013158	CG	3	6	2688517	2688522	0 %	0 %	50 %	50 %	257053685
57549	NC_013158	TCGA	2	8	2688570	2688577	25 %	25 %	25 %	25 %	257053685
57550	NC_013158	ACGCC	2	10	2688580	2688589	20 %	0 %	20 %	60 %	257053685
57551	NC_013158	ACG	2	6	2688598	2688603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
57552	NC_013158	CGC	2	6	2688648	2688653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57553	NC_013158	CCG	2	6	2688704	2688709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57554	NC_013158	GGCG	2	8	2688713	2688720	0 %	0 %	75 %	25 %	257053685
57555	NC_013158	CCG	2	6	2688762	2688767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
57556	NC_013158	CGT	2	6	2688771	2688776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053685
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57558	NC_013158	GAG	2	6	2688801	2688806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053685
57559	NC_013158	CGAG	2	8	2688844	2688851	25 %	0 %	50 %	25 %	257053685
57560	NC_013158	CGC	2	6	2688935	2688940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
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57562	NC_013158	CGA	2	6	2688974	2688979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
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57564	NC_013158	G	6	6	2689070	2689075	0 %	0 %	100 %	0 %	257053685
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57578	NC_013158	GGT	2	6	2689478	2689483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053685
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57582	NC_013158	CGG	2	6	2689601	2689606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053685
57583	NC_013158	GAGATC	2	12	2689611	2689622	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053685
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57587	NC_013158	CGGC	2	8	2689747	2689754	0 %	0 %	50 %	50 %	257053685
57588	NC_013158	GC	3	6	2689769	2689774	0 %	0 %	50 %	50 %	257053685
57589	NC_013158	ACC	2	6	2689812	2689817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053685
57590	NC_013158	GAC	2	6	2689883	2689888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053686
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57599	NC_013158	GAG	2	6	2690336	2690341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053686
57600	NC_013158	TGT	2	6	2690360	2690365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053686
57601	NC_013158	TCG	2	6	2690409	2690414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053686
57602	NC_013158	TCG	2	6	2690436	2690441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053686
57603	NC_013158	CGC	2	6	2690479	2690484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053686
57604	NC_013158	ACG	2	6	2690556	2690561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053686
57605	NC_013158	GAAC	2	8	2690578	2690585	50 %	0 %	25 %	25 %	257053686
57606	NC_013158	TCGG	2	8	2690612	2690619	0 %	25 %	50 %	25 %	257053686
57607	NC_013158	CAC	2	6	2690699	2690704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053686
57608	NC_013158	CAATT	2	10	2690729	2690738	40 %	40 %	0 %	20 %	257053686
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57612	NC_013158	GCT	2	6	2691091	2691096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053686
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57614	NC_013158	TG	3	6	2691170	2691175	0 %	50 %	50 %	0 %	257053686
57615	NC_013158	ACA	2	6	2691303	2691308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053686
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