MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_013158	GCG	2	6	2663542	2663547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053662
57002	NC_013158	TGC	2	6	2663550	2663555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053662
57003	NC_013158	TCG	2	6	2663587	2663592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053662
57004	NC_013158	CGG	2	6	2663649	2663654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053662
57005	NC_013158	ATC	2	6	2663665	2663670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053662
57006	NC_013158	CCGAC	2	10	2663702	2663711	20 %	0 %	20 %	60 %	257053662
57007	NC_013158	GCA	2	6	2663726	2663731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053662
57008	NC_013158	CGCGA	2	10	2663748	2663757	20 %	0 %	40 %	40 %	257053662
57009	NC_013158	GA	3	6	2663756	2663761	50 %	0 %	50 %	0 %	257053662
57010	NC_013158	CTC	2	6	2663784	2663789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053662
57011	NC_013158	GTC	2	6	2663935	2663940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053663
57012	NC_013158	TCCG	2	8	2663962	2663969	0 %	25 %	25 %	50 %	257053663
57013	NC_013158	CAGC	2	8	2663974	2663981	25 %	0 %	25 %	50 %	257053663
57014	NC_013158	AGTCCC	2	12	2664055	2664066	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257053663
57015	NC_013158	GCC	2	6	2664081	2664086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053663
57016	NC_013158	CG	3	6	2664166	2664171	0 %	0 %	50 %	50 %	257053663
57017	NC_013158	CGC	3	9	2664182	2664190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053663
57018	NC_013158	CCG	2	6	2664214	2664219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053663
57019	NC_013158	GAC	2	6	2664224	2664229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053663
57020	NC_013158	GTCGC	2	10	2664285	2664294	0 %	20 %	40 %	40 %	257053663
57021	NC_013158	GAC	2	6	2664299	2664304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053663
57022	NC_013158	CGA	2	6	2664305	2664310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053663
57023	NC_013158	GCCG	2	8	2664338	2664345	0 %	0 %	50 %	50 %	257053663
57024	NC_013158	GCG	2	6	2664354	2664359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053663
57025	NC_013158	GGC	2	6	2664365	2664370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053663
57026	NC_013158	ATCG	3	12	2664634	2664645	25 %	25 %	25 %	25 %	257053664
57027	NC_013158	CGA	2	6	2664663	2664668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57028	NC_013158	CG	3	6	2664686	2664691	0 %	0 %	50 %	50 %	257053664
57029	NC_013158	CGT	2	6	2664693	2664698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57030	NC_013158	TGAC	2	8	2664707	2664714	25 %	25 %	25 %	25 %	257053664
57031	NC_013158	CGA	2	6	2664750	2664755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57032	NC_013158	GAA	2	6	2664792	2664797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053664
57033	NC_013158	CAT	2	6	2664801	2664806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053664
57034	NC_013158	GTT	2	6	2664822	2664827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053664
57035	NC_013158	TCG	2	6	2664837	2664842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57036	NC_013158	GAC	2	6	2664847	2664852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57037	NC_013158	ATC	2	6	2664889	2664894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053664
57038	NC_013158	GGC	2	6	2664918	2664923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053664
57039	NC_013158	ATCA	2	8	2664925	2664932	50 %	25 %	0 %	25 %	257053664
57040	NC_013158	CCG	2	6	2664975	2664980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053664
57041	NC_013158	TGAC	2	8	2665091	2665098	25 %	25 %	25 %	25 %	257053664
57042	NC_013158	GAG	2	6	2665183	2665188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053664
57043	NC_013158	ATCG	2	8	2665189	2665196	25 %	25 %	25 %	25 %	257053664
57044	NC_013158	GCT	2	6	2665213	2665218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57045	NC_013158	CGG	2	6	2665256	2665261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053664
57046	NC_013158	GCT	2	6	2665272	2665277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57047	NC_013158	GAC	2	6	2665291	2665296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57048	NC_013158	GGA	2	6	2665308	2665313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053664
57049	NC_013158	TC	3	6	2665329	2665334	0 %	50 %	0 %	50 %	257053664
57050	NC_013158	CGT	2	6	2665350	2665355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57051	NC_013158	GT	3	6	2665354	2665359	0 %	50 %	50 %	0 %	257053664
57052	NC_013158	CTG	2	6	2665444	2665449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
57053	NC_013158	GAG	2	6	2665489	2665494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053664
57054	NC_013158	CGA	2	6	2665744	2665749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053665
57055	NC_013158	CG	3	6	2665901	2665906	0 %	0 %	50 %	50 %	257053665
57056	NC_013158	TCGACG	2	12	2665986	2665997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257053665
57057	NC_013158	CCT	2	6	2666014	2666019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053665
57058	NC_013158	CGG	2	6	2666029	2666034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053665
57059	NC_013158	GAC	2	6	2666104	2666109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053665
57060	NC_013158	CCG	2	6	2666130	2666135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053665
57061	NC_013158	GCC	2	6	2666168	2666173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053665
57062	NC_013158	CGA	2	6	2666203	2666208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053665
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57065	NC_013158	GCCC	2	8	2666310	2666317	0 %	0 %	25 %	75 %	257053665
57066	NC_013158	TCA	2	6	2666334	2666339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053665
57067	NC_013158	CGA	2	6	2666365	2666370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053665
57068	NC_013158	GTCT	2	8	2666450	2666457	0 %	50 %	25 %	25 %	257053665
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57071	NC_013158	TCA	2	6	2666582	2666587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053666
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57086	NC_013158	CTG	2	6	2667126	2667131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053666
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57099	NC_013158	GCT	2	6	2667845	2667850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053667
57100	NC_013158	GAG	2	6	2667969	2667974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053667
57101	NC_013158	CGT	2	6	2668058	2668063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053667
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57103	NC_013158	GC	3	6	2668117	2668122	0 %	0 %	50 %	50 %	257053667
57104	NC_013158	CAA	3	9	2668133	2668141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053667
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57107	NC_013158	GTCC	2	8	2668265	2668272	0 %	25 %	25 %	50 %	257053667
57108	NC_013158	CGACC	2	10	2668337	2668346	20 %	0 %	20 %	60 %	257053667
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57111	NC_013158	CGA	2	6	2668501	2668506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053667
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57113	NC_013158	ACC	2	6	2668513	2668518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053667
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57115	NC_013158	CCG	2	6	2668667	2668672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053668
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57459	NC_013158	GTC	3	9	2684328	2684336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053683
57460	NC_013158	CGC	2	6	2684380	2684385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053683
57461	NC_013158	GCC	2	6	2684481	2684486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053683
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57463	NC_013158	CGG	2	6	2684528	2684533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053683
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57465	NC_013158	TA	3	6	2684933	2684938	50 %	50 %	0 %	0 %	257053684
57466	NC_013158	CCG	2	6	2684974	2684979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053684
57467	NC_013158	GGCA	2	8	2684980	2684987	25 %	0 %	50 %	25 %	257053684
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57478	NC_013158	CGG	2	6	2685464	2685469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053685
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57480	NC_013158	GGTCGA	2	12	2685500	2685511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053685
57481	NC_013158	GTGA	2	8	2685552	2685559	25 %	25 %	50 %	0 %	257053685
57482	NC_013158	CAC	2	6	2685560	2685565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053685
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57484	NC_013158	GGT	2	6	2685659	2685664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053685
57485	NC_013158	CCG	2	6	2685715	2685720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053685
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57489	NC_013158	CGAC	2	8	2685967	2685974	25 %	0 %	25 %	50 %	257053685
57490	NC_013158	GGCC	2	8	2685977	2685984	0 %	0 %	50 %	50 %	257053685
57491	NC_013158	CGG	2	6	2685998	2686003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053685
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57493	NC_013158	GTCC	2	8	2686032	2686039	0 %	25 %	25 %	50 %	257053685
57494	NC_013158	CGA	2	6	2686055	2686060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053685
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