MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_013158	ACG	3	9	2613851	2613859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56002	NC_013158	TCG	2	6	2613866	2613871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56003	NC_013158	ACG	2	6	2613878	2613883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56004	NC_013158	GTC	2	6	2613976	2613981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56005	NC_013158	GAC	2	6	2614036	2614041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56006	NC_013158	CGAA	2	8	2614081	2614088	50 %	0 %	25 %	25 %	257053612
56007	NC_013158	CCGCC	2	10	2614139	2614148	0 %	0 %	20 %	80 %	257053612
56008	NC_013158	ACG	3	9	2614190	2614198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56009	NC_013158	ACG	2	6	2614202	2614207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56010	NC_013158	CGT	2	6	2614215	2614220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56011	NC_013158	CCG	2	6	2614223	2614228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053612
56012	NC_013158	CCT	2	6	2614229	2614234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053612
56013	NC_013158	CGC	2	6	2614253	2614258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053612
56014	NC_013158	CTG	2	6	2614270	2614275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56015	NC_013158	GAG	2	6	2614276	2614281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053612
56016	NC_013158	TCG	2	6	2614340	2614345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56017	NC_013158	GCC	2	6	2614381	2614386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053612
56018	NC_013158	CGA	3	9	2614400	2614408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56019	NC_013158	GGCGAT	2	12	2614464	2614475	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053612
56020	NC_013158	GTCCCG	2	12	2614480	2614491	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257053612
56021	NC_013158	TCG	3	9	2614511	2614519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56022	NC_013158	CGC	2	6	2614554	2614559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053612
56023	NC_013158	GAG	2	6	2614564	2614569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053612
56024	NC_013158	CGGC	2	8	2614574	2614581	0 %	0 %	50 %	50 %	257053612
56025	NC_013158	CGA	2	6	2614608	2614613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56026	NC_013158	CAG	2	6	2614642	2614647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56027	NC_013158	GTC	2	6	2614657	2614662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053612
56028	NC_013158	GAT	2	6	2614749	2614754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053612
56029	NC_013158	AC	3	6	2614854	2614859	50 %	0 %	0 %	50 %	257053613
56030	NC_013158	TGA	2	6	2614861	2614866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053613
56031	NC_013158	CGT	2	6	2614927	2614932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56032	NC_013158	ACC	2	6	2614941	2614946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053613
56033	NC_013158	ACA	2	6	2614992	2614997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053613
56034	NC_013158	CCA	2	6	2615014	2615019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053613
56035	NC_013158	CCGGC	2	10	2615023	2615032	0 %	0 %	40 %	60 %	257053613
56036	NC_013158	CGA	2	6	2615035	2615040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56037	NC_013158	CGA	2	6	2615122	2615127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56038	NC_013158	CGA	3	9	2615194	2615202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56039	NC_013158	ACG	2	6	2615283	2615288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56040	NC_013158	CGG	2	6	2615295	2615300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053613
56041	NC_013158	CGAGTA	2	12	2615374	2615385	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053613
56042	NC_013158	GC	3	6	2615404	2615409	0 %	0 %	50 %	50 %	257053613
56043	NC_013158	CAA	2	6	2615449	2615454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053613
56044	NC_013158	TCA	2	6	2615466	2615471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053613
56045	NC_013158	CGT	2	6	2615473	2615478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56046	NC_013158	CAA	2	6	2615479	2615484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053613
56047	NC_013158	CGG	2	6	2615515	2615520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053613
56048	NC_013158	TCC	2	6	2615538	2615543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053613
56049	NC_013158	GGA	2	6	2615605	2615610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053613
56050	NC_013158	TCG	2	6	2615634	2615639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56051	NC_013158	CGA	2	6	2615650	2615655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56052	NC_013158	CGA	2	6	2615728	2615733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56053	NC_013158	ATC	2	6	2615789	2615794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053613
56054	NC_013158	GAG	2	6	2615795	2615800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053613
56055	NC_013158	GGT	2	6	2615908	2615913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053613
56056	NC_013158	CGG	3	9	2615914	2615922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053613
56057	NC_013158	GAC	2	6	2615963	2615968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053613
56058	NC_013158	CGG	2	6	2615989	2615994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053613
56059	NC_013158	GCC	2	6	2616032	2616037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053613
56060	NC_013158	TC	3	6	2616462	2616467	0 %	50 %	0 %	50 %	257053614
56061	NC_013158	AAAC	2	8	2616469	2616476	75 %	0 %	0 %	25 %	257053614
56062	NC_013158	TCA	2	6	2616531	2616536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053614
56063	NC_013158	CTG	2	6	2616544	2616549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053614
56064	NC_013158	GCG	2	6	2616588	2616593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053614
56065	NC_013158	CAGC	2	8	2616689	2616696	25 %	0 %	25 %	50 %	257053614
56066	NC_013158	TCA	2	6	2616771	2616776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053614
56067	NC_013158	TCG	2	6	2616807	2616812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053614
56068	NC_013158	CCT	2	6	2617040	2617045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053614
56069	NC_013158	TGG	2	6	2617056	2617061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053614
56070	NC_013158	AGAAAC	2	12	2617072	2617083	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	257053614
56071	NC_013158	AAGG	2	8	2617103	2617110	50 %	0 %	50 %	0 %	257053614
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56074	NC_013158	TC	3	6	2617378	2617383	0 %	50 %	0 %	50 %	257053615
56075	NC_013158	GTC	2	6	2617419	2617424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053615
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56080	NC_013158	GTC	2	6	2617707	2617712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053615
56081	NC_013158	GGT	2	6	2617730	2617735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053615
56082	NC_013158	AGA	2	6	2617996	2618001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053615
56083	NC_013158	CGG	2	6	2618007	2618012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053615
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56086	NC_013158	CT	3	6	2618332	2618337	0 %	50 %	0 %	50 %	257053616
56087	NC_013158	CCT	2	6	2618409	2618414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053616
56088	NC_013158	TCG	2	6	2618429	2618434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053616
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56097	NC_013158	GC	3	6	2618675	2618680	0 %	0 %	50 %	50 %	257053616
56098	NC_013158	CGA	2	6	2618682	2618687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053616
56099	NC_013158	GCG	2	6	2618690	2618695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053616
56100	NC_013158	GTC	2	6	2618701	2618706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053616
56101	NC_013158	TCG	2	6	2618756	2618761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053616
56102	NC_013158	TGCG	2	8	2618765	2618772	0 %	25 %	50 %	25 %	257053616
56103	NC_013158	TCGC	2	8	2618803	2618810	0 %	25 %	25 %	50 %	257053616
56104	NC_013158	CGG	2	6	2618919	2618924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053616
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56111	NC_013158	CGA	2	6	2619504	2619509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053617
56112	NC_013158	GA	3	6	2619528	2619533	50 %	0 %	50 %	0 %	257053617
56113	NC_013158	GCA	2	6	2619558	2619563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053617
56114	NC_013158	CGA	2	6	2619576	2619581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053617
56115	NC_013158	TCG	2	6	2619632	2619637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053617
56116	NC_013158	CCG	2	6	2619665	2619670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053617
56117	NC_013158	CCG	2	6	2619679	2619684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053617
56118	NC_013158	GCC	2	6	2619693	2619698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053617
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56120	NC_013158	GCT	2	6	2619756	2619761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053617
56121	NC_013158	TCG	2	6	2619787	2619792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053617
56122	NC_013158	ACG	2	6	2619923	2619928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053617
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56125	NC_013158	GTGCTG	2	12	2620069	2620080	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257053617
56126	NC_013158	TCG	2	6	2620121	2620126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053617
56127	NC_013158	GGATCG	2	12	2620127	2620138	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053617
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56132	NC_013158	GAC	2	6	2620308	2620313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053617
56133	NC_013158	ATCC	2	8	2620329	2620336	25 %	25 %	0 %	50 %	257053617
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56141	NC_013158	CTCGG	2	10	2620624	2620633	0 %	20 %	40 %	40 %	257053617
56142	NC_013158	GC	3	6	2620641	2620646	0 %	0 %	50 %	50 %	257053617
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56145	NC_013158	CTG	2	6	2620675	2620680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053617
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56152	NC_013158	CCGG	2	8	2620968	2620975	0 %	0 %	50 %	50 %	257053617
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56175	NC_013158	CGT	2	6	2621787	2621792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053617
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56178	NC_013158	CGA	2	6	2621964	2621969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053618
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56181	NC_013158	CGA	2	6	2622192	2622197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053618
56182	NC_013158	CT	4	8	2622219	2622226	0 %	50 %	0 %	50 %	257053618
56183	NC_013158	ATCT	2	8	2622257	2622264	25 %	50 %	0 %	25 %	257053619
56184	NC_013158	TCGA	2	8	2622273	2622280	25 %	25 %	25 %	25 %	257053619
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56188	NC_013158	GC	3	6	2622391	2622396	0 %	0 %	50 %	50 %	257053619
56189	NC_013158	GAC	2	6	2622404	2622409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053619
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56192	NC_013158	CCT	2	6	2622441	2622446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053619
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56202	NC_013158	TCG	2	6	2622883	2622888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053620
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56206	NC_013158	ACCT	2	8	2623032	2623039	25 %	25 %	0 %	50 %	257053620
56207	NC_013158	GGA	2	6	2623040	2623045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053620
56208	NC_013158	TCG	2	6	2623108	2623113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053620
56209	NC_013158	TCC	2	6	2623147	2623152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053620
56210	NC_013158	ACGA	2	8	2623165	2623172	50 %	0 %	25 %	25 %	257053620
56211	NC_013158	GACGG	2	10	2623188	2623197	20 %	0 %	60 %	20 %	257053620
56212	NC_013158	CGG	2	6	2623211	2623216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053620
56213	NC_013158	CCG	2	6	2623242	2623247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053620
56214	NC_013158	TCG	3	9	2623255	2623263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053620
56215	NC_013158	CGA	3	9	2623455	2623463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053621
56216	NC_013158	GCCG	2	8	2623466	2623473	0 %	0 %	50 %	50 %	257053621
56217	NC_013158	GAC	2	6	2623506	2623511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053621
56218	NC_013158	GAC	2	6	2623513	2623518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053621
56219	NC_013158	GAT	2	6	2623521	2623526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053621
56220	NC_013158	CCG	2	6	2623537	2623542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053621
56221	NC_013158	CCG	2	6	2623564	2623569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053621
56222	NC_013158	CGA	2	6	2623616	2623621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053621
56223	NC_013158	CGAC	2	8	2623658	2623665	25 %	0 %	25 %	50 %	257053621
56224	NC_013158	GAG	2	6	2623702	2623707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053621
56225	NC_013158	CGC	2	6	2623785	2623790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053621
56226	NC_013158	GCT	2	6	2623980	2623985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053621
56227	NC_013158	TACGT	2	10	2624026	2624035	20 %	40 %	20 %	20 %	257053621
56228	NC_013158	CGA	3	9	2624040	2624048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053621
56229	NC_013158	CCG	3	9	2624072	2624080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053621
56230	NC_013158	AGG	2	6	2624081	2624086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053621
56231	NC_013158	GTC	2	6	2624140	2624145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053621
56232	NC_013158	TCG	2	6	2624150	2624155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053621
56233	NC_013158	CGG	2	6	2624181	2624186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053621
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56235	NC_013158	CGG	2	6	2624223	2624228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053621
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56240	NC_013158	GAG	2	6	2624553	2624558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053622
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56257	NC_013158	CGA	2	6	2625126	2625131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053623
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56335	NC_013158	CGA	3	9	2629407	2629415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053628
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56337	NC_013158	CGT	2	6	2629643	2629648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053629
56338	NC_013158	CACC	2	8	2629704	2629711	25 %	0 %	0 %	75 %	257053629
56339	NC_013158	AG	3	6	2629732	2629737	50 %	0 %	50 %	0 %	257053629
56340	NC_013158	TCTCGA	2	12	2629748	2629759	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257053629
56341	NC_013158	TCG	2	6	2629777	2629782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053629
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56343	NC_013158	GC	3	6	2629814	2629819	0 %	0 %	50 %	50 %	257053629
56344	NC_013158	TTG	2	6	2629825	2629830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053629
56345	NC_013158	GTC	2	6	2629854	2629859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053629
56346	NC_013158	CGT	2	6	2629874	2629879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053629
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56351	NC_013158	CGA	3	9	2630036	2630044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053629
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56445	NC_013158	GA	3	6	2634698	2634703	50 %	0 %	50 %	0 %	257053633
56446	NC_013158	CGA	2	6	2634705	2634710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053633
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56449	NC_013158	CGC	2	6	2635125	2635130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053634
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56455	NC_013158	CTC	3	9	2635425	2635433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053634
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56457	NC_013158	CGT	2	6	2635502	2635507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053634
56458	NC_013158	GAAC	2	8	2635565	2635572	50 %	0 %	25 %	25 %	257053634
56459	NC_013158	GAT	2	6	2635584	2635589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053634
56460	NC_013158	GCCGTG	2	12	2635620	2635631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257053634
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56462	NC_013158	GAA	2	6	2635707	2635712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053634
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56464	NC_013158	TCG	2	6	2635747	2635752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053634
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56473	NC_013158	CGG	2	6	2638337	2638342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053635
56474	NC_013158	CGAT	2	8	2638426	2638433	25 %	25 %	25 %	25 %	257053635
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56485	NC_013158	G	6	6	2638880	2638885	0 %	0 %	100 %	0 %	257053635
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