MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_013158	CGC	2	6	2546332	2546337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053536
54502	NC_013158	AAC	2	6	2546357	2546362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053536
54503	NC_013158	GAT	2	6	2546386	2546391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053536
54504	NC_013158	CGA	2	6	2546409	2546414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053536
54505	NC_013158	TC	3	6	2546518	2546523	0 %	50 %	0 %	50 %	257053536
54506	NC_013158	GTG	2	6	2546529	2546534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053536
54507	NC_013158	CGG	2	6	2546640	2546645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053536
54508	NC_013158	CCT	3	9	2546647	2546655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053536
54509	NC_013158	GCC	2	6	2546675	2546680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053536
54510	NC_013158	ATGG	2	8	2546791	2546798	25 %	25 %	50 %	0 %	257053536
54511	NC_013158	CGA	2	6	2546836	2546841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053536
54512	NC_013158	ACG	2	6	2546865	2546870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053536
54513	NC_013158	ACG	3	9	2546922	2546930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053536
54514	NC_013158	GC	3	6	2546971	2546976	0 %	0 %	50 %	50 %	257053536
54515	NC_013158	GGGCC	2	10	2547008	2547017	0 %	0 %	60 %	40 %	257053536
54516	NC_013158	AGG	2	6	2547060	2547065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053536
54517	NC_013158	GC	3	6	2547075	2547080	0 %	0 %	50 %	50 %	257053536
54518	NC_013158	CTG	2	6	2547089	2547094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053536
54519	NC_013158	TGAC	2	8	2547105	2547112	25 %	25 %	25 %	25 %	257053536
54520	NC_013158	GCC	2	6	2547161	2547166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053536
54521	NC_013158	CGGCG	2	10	2547172	2547181	0 %	0 %	60 %	40 %	257053536
54522	NC_013158	GGC	2	6	2547250	2547255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053536
54523	NC_013158	CGC	2	6	2547265	2547270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053536
54524	NC_013158	GCC	2	6	2547287	2547292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053536
54525	NC_013158	GAC	2	6	2547317	2547322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053536
54526	NC_013158	CCGA	2	8	2547384	2547391	25 %	0 %	25 %	50 %	257053536
54527	NC_013158	GGA	2	6	2547421	2547426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053536
54528	NC_013158	TG	3	6	2547456	2547461	0 %	50 %	50 %	0 %	257053536
54529	NC_013158	GAG	2	6	2547509	2547514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053536
54530	NC_013158	GCC	2	6	2547574	2547579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053536
54531	NC_013158	TG	3	6	2547627	2547632	0 %	50 %	50 %	0 %	257053536
54532	NC_013158	CGA	2	6	2547661	2547666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053536
54533	NC_013158	GTT	2	6	2547881	2547886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053537
54534	NC_013158	CGG	2	6	2547913	2547918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053537
54535	NC_013158	GTC	3	9	2547926	2547934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053537
54536	NC_013158	GTC	2	6	2547952	2547957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053537
54537	NC_013158	CGA	2	6	2547976	2547981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053537
54538	NC_013158	CGA	2	6	2547991	2547996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053537
54539	NC_013158	CGATC	2	10	2548087	2548096	20 %	20 %	20 %	40 %	257053537
54540	NC_013158	CGT	2	6	2548114	2548119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053537
54541	NC_013158	GTC	2	6	2548131	2548136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053537
54542	NC_013158	CGT	3	9	2548225	2548233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053537
54543	NC_013158	CGG	2	6	2548245	2548250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053537
54544	NC_013158	GAG	2	6	2548280	2548285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053537
54545	NC_013158	GTC	3	9	2548341	2548349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053538
54546	NC_013158	GAC	2	6	2548400	2548405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053538
54547	NC_013158	CGT	2	6	2548456	2548461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053538
54548	NC_013158	TCCG	2	8	2548473	2548480	0 %	25 %	25 %	50 %	257053538
54549	NC_013158	CCG	2	6	2548706	2548711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053539
54550	NC_013158	GCA	2	6	2548808	2548813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053539
54551	NC_013158	CGG	2	6	2548853	2548858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053539
54552	NC_013158	CCA	2	6	2548878	2548883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053539
54553	NC_013158	CG	3	6	2548924	2548929	0 %	0 %	50 %	50 %	257053539
54554	NC_013158	CGC	2	6	2548949	2548954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053539
54555	NC_013158	GTCG	2	8	2549008	2549015	0 %	25 %	50 %	25 %	257053539
54556	NC_013158	CTGG	2	8	2549016	2549023	0 %	25 %	50 %	25 %	257053539
54557	NC_013158	CCG	2	6	2549047	2549052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053539
54558	NC_013158	GAA	2	6	2549086	2549091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053539
54559	NC_013158	GAG	2	6	2549125	2549130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053539
54560	NC_013158	CGTCGA	2	12	2549217	2549228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257053540
54561	NC_013158	CTT	2	6	2549307	2549312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053540
54562	NC_013158	CAC	2	6	2549344	2549349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053540
54563	NC_013158	CG	3	6	2549359	2549364	0 %	0 %	50 %	50 %	257053540
54564	NC_013158	ATC	2	6	2549401	2549406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053540
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54566	NC_013158	CGA	2	6	2549433	2549438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053540
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54569	NC_013158	CGA	2	6	2549547	2549552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053540
54570	NC_013158	CGT	2	6	2549565	2549570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053540
54571	NC_013158	CGAAG	2	10	2549589	2549598	40 %	0 %	40 %	20 %	257053540
54572	NC_013158	CGT	2	6	2549601	2549606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053540
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54582	NC_013158	CG	3	6	2550004	2550009	0 %	0 %	50 %	50 %	257053540
54583	NC_013158	GGC	2	6	2550010	2550015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053540
54584	NC_013158	GTC	2	6	2550022	2550027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053540
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54587	NC_013158	TCGG	2	8	2550080	2550087	0 %	25 %	50 %	25 %	257053540
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54590	NC_013158	CGC	2	6	2550201	2550206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053540
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54605	NC_013158	TGG	2	6	2550686	2550691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053541
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54614	NC_013158	GAT	3	9	2551264	2551272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053541
54615	NC_013158	CGA	2	6	2551296	2551301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053541
54616	NC_013158	GAC	2	6	2551303	2551308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053541
54617	NC_013158	GCC	2	6	2551327	2551332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053541
54618	NC_013158	GCCA	2	8	2551364	2551371	25 %	0 %	25 %	50 %	257053541
54619	NC_013158	GTC	2	6	2551388	2551393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053541
54620	NC_013158	GTC	2	6	2551450	2551455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053541
54621	NC_013158	GGT	2	6	2551576	2551581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053541
54622	NC_013158	C	6	6	2551704	2551709	0 %	0 %	0 %	100 %	257053541
54623	NC_013158	ACG	2	6	2551722	2551727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053541
54624	NC_013158	CGA	2	6	2551731	2551736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053541
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54626	NC_013158	CGA	3	9	2551833	2551841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053541
54627	NC_013158	GCG	2	6	2551868	2551873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053541
54628	NC_013158	CGC	2	6	2552091	2552096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053542
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54630	NC_013158	ACG	2	6	2552115	2552120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053542
54631	NC_013158	ACC	2	6	2552155	2552160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053542
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54633	NC_013158	CGCGGT	2	12	2552254	2552265	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257053542
54634	NC_013158	CGA	2	6	2552266	2552271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053542
54635	NC_013158	CGT	3	9	2552401	2552409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053542
54636	NC_013158	GCGG	2	8	2552414	2552421	0 %	0 %	75 %	25 %	257053542
54637	NC_013158	CG	3	6	2552429	2552434	0 %	0 %	50 %	50 %	257053542
54638	NC_013158	GAG	2	6	2552513	2552518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053542
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54642	NC_013158	CGA	2	6	2552724	2552729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053542
54643	NC_013158	GAG	2	6	2552807	2552812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053542
54644	NC_013158	CGC	2	6	2553085	2553090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053543
54645	NC_013158	GA	4	8	2553104	2553111	50 %	0 %	50 %	0 %	257053543
54646	NC_013158	CGA	2	6	2553112	2553117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053543
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54650	NC_013158	GGCC	2	8	2553303	2553310	0 %	0 %	50 %	50 %	257053543
54651	NC_013158	CGC	3	9	2553358	2553366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053543
54652	NC_013158	CGACGC	2	12	2553367	2553378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257053543
54653	NC_013158	GAC	2	6	2553388	2553393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053543
54654	NC_013158	CG	3	6	2553408	2553413	0 %	0 %	50 %	50 %	257053543
54655	NC_013158	GACC	2	8	2553543	2553550	25 %	0 %	25 %	50 %	257053544
54656	NC_013158	GTCACG	2	12	2553616	2553627	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257053544
54657	NC_013158	GC	5	10	2553648	2553657	0 %	0 %	50 %	50 %	257053544
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54659	NC_013158	TG	3	6	2553673	2553678	0 %	50 %	50 %	0 %	257053544
54660	NC_013158	CGG	2	6	2553690	2553695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053544
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54662	NC_013158	GAG	2	6	2553793	2553798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053544
54663	NC_013158	GGA	2	6	2553960	2553965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053544
54664	NC_013158	GC	4	8	2554053	2554060	0 %	0 %	50 %	50 %	257053544
54665	NC_013158	GCTG	2	8	2554065	2554072	0 %	25 %	50 %	25 %	257053544
54666	NC_013158	GCC	2	6	2554107	2554112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053544
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54668	NC_013158	CGG	3	9	2554244	2554252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053544
54669	NC_013158	GCT	2	6	2554311	2554316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053544
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54673	NC_013158	GA	4	8	2554450	2554457	50 %	0 %	50 %	0 %	257053544
54674	NC_013158	GAC	2	6	2554465	2554470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053544
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54676	NC_013158	TCTCG	2	10	2554599	2554608	0 %	40 %	20 %	40 %	257053544
54677	NC_013158	CG	3	6	2554657	2554662	0 %	0 %	50 %	50 %	257053544
54678	NC_013158	CGGG	2	8	2554670	2554677	0 %	0 %	75 %	25 %	257053544
54679	NC_013158	GC	3	6	2554688	2554693	0 %	0 %	50 %	50 %	257053544
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54682	NC_013158	GCA	2	6	2554757	2554762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053544
54683	NC_013158	CGA	2	6	2554779	2554784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053544
54684	NC_013158	CGA	2	6	2554790	2554795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053544
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54687	NC_013158	ACG	2	6	2554892	2554897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053544
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54700	NC_013158	TCG	2	6	2555235	2555240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053545
54701	NC_013158	TG	3	6	2555343	2555348	0 %	50 %	50 %	0 %	257053545
54702	NC_013158	CGG	2	6	2555379	2555384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053545
54703	NC_013158	ACG	2	6	2555415	2555420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053545
54704	NC_013158	CGC	2	6	2555434	2555439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053545
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54706	NC_013158	CGA	3	9	2555530	2555538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053545
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54728	NC_013158	GAC	2	6	2556845	2556850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053547
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54846	NC_013158	TCG	2	6	2561230	2561235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053551
54847	NC_013158	GACG	2	8	2561551	2561558	25 %	0 %	50 %	25 %	257053552
54848	NC_013158	AGCG	2	8	2561578	2561585	25 %	0 %	50 %	25 %	257053552
54849	NC_013158	TCGA	2	8	2561612	2561619	25 %	25 %	25 %	25 %	257053552
54850	NC_013158	GGC	2	6	2561620	2561625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053552
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54852	NC_013158	CGG	2	6	2561647	2561652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053552
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54899	NC_013158	TCG	2	6	2563656	2563661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053553
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54950	NC_013158	CGC	2	6	2566604	2566609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053556
54951	NC_013158	GGACGT	2	12	2566616	2566627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053556
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54953	NC_013158	GGCC	2	8	2566719	2566726	0 %	0 %	50 %	50 %	257053556
54954	NC_013158	GCC	2	6	2566816	2566821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053556
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54958	NC_013158	CGGT	2	8	2566922	2566929	0 %	25 %	50 %	25 %	257053556
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