MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_013158	ACG	2	6	2453638	2453643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52502	NC_013158	GTGACG	2	12	2453731	2453742	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053462
52503	NC_013158	CGA	2	6	2453744	2453749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52504	NC_013158	CGA	3	9	2453760	2453768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52505	NC_013158	CCG	2	6	2453783	2453788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053462
52506	NC_013158	AAC	2	6	2453805	2453810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053462
52507	NC_013158	CT	3	6	2453827	2453832	0 %	50 %	0 %	50 %	257053462
52508	NC_013158	GGC	2	6	2453854	2453859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
52509	NC_013158	CGT	2	6	2453877	2453882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52510	NC_013158	GAC	2	6	2453958	2453963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52511	NC_013158	CGG	2	6	2453981	2453986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
52512	NC_013158	CCG	2	6	2454035	2454040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053462
52513	NC_013158	CGA	2	6	2454045	2454050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52514	NC_013158	GTC	2	6	2454082	2454087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52515	NC_013158	ACG	2	6	2454095	2454100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52516	NC_013158	CGG	2	6	2454168	2454173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
52517	NC_013158	TCG	2	6	2454227	2454232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52518	NC_013158	TCG	2	6	2454275	2454280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52519	NC_013158	GTG	2	6	2454284	2454289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053462
52520	NC_013158	GGC	2	6	2454295	2454300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
52521	NC_013158	TCG	2	6	2454314	2454319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52522	NC_013158	CGG	2	6	2454327	2454332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
52523	NC_013158	TCGA	2	8	2454367	2454374	25 %	25 %	25 %	25 %	257053462
52524	NC_013158	GGGT	2	8	2454462	2454469	0 %	25 %	75 %	0 %	257053462
52525	NC_013158	GAG	2	6	2454493	2454498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053462
52526	NC_013158	CGG	2	6	2454573	2454578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
52527	NC_013158	TGC	2	6	2454580	2454585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
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52531	NC_013158	GGC	2	6	2454767	2454772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
52532	NC_013158	CGAT	2	8	2454820	2454827	25 %	25 %	25 %	25 %	257053463
52533	NC_013158	CGG	2	6	2454830	2454835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
52534	NC_013158	CGA	2	6	2454935	2454940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52535	NC_013158	CGT	2	6	2454944	2454949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52536	NC_013158	CGA	2	6	2455022	2455027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
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52538	NC_013158	TCACG	2	10	2455049	2455058	20 %	20 %	20 %	40 %	257053463
52539	NC_013158	CCT	2	6	2455060	2455065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053463
52540	NC_013158	CGA	2	6	2455073	2455078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52541	NC_013158	TC	3	6	2455082	2455087	0 %	50 %	0 %	50 %	257053463
52542	NC_013158	ACC	2	6	2455101	2455106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053463
52543	NC_013158	ACG	2	6	2455110	2455115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52544	NC_013158	CGT	2	6	2455283	2455288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52545	NC_013158	AAC	2	6	2455293	2455298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053463
52546	NC_013158	CTT	2	6	2455307	2455312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053463
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52548	NC_013158	TCG	2	6	2455354	2455359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52549	NC_013158	GAT	2	6	2455386	2455391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053463
52550	NC_013158	CT	4	8	2455415	2455422	0 %	50 %	0 %	50 %	257053463
52551	NC_013158	CGC	2	6	2455450	2455455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053463
52552	NC_013158	GAG	2	6	2455470	2455475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053463
52553	NC_013158	CCG	2	6	2455498	2455503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053463
52554	NC_013158	CA	3	6	2455537	2455542	50 %	0 %	0 %	50 %	257053463
52555	NC_013158	TC	3	6	2455544	2455549	0 %	50 %	0 %	50 %	257053463
52556	NC_013158	ACG	2	6	2455585	2455590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52557	NC_013158	CCTG	2	8	2455694	2455701	0 %	25 %	25 %	50 %	257053463
52558	NC_013158	GCC	3	9	2455761	2455769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053463
52559	NC_013158	CGG	2	6	2455799	2455804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
52560	NC_013158	CGA	2	6	2455814	2455819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52561	NC_013158	CGA	2	6	2455841	2455846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52562	NC_013158	CGG	2	6	2455865	2455870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
52563	NC_013158	TGA	2	6	2455883	2455888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053463
52564	NC_013158	CGG	2	6	2455949	2455954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
52565	NC_013158	ACG	2	6	2456023	2456028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52566	NC_013158	CGA	2	6	2456033	2456038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52567	NC_013158	ACG	2	6	2456070	2456075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52568	NC_013158	GTC	3	9	2456082	2456090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52569	NC_013158	CGACG	2	10	2456096	2456105	20 %	0 %	40 %	40 %	257053463
52570	NC_013158	TCG	2	6	2456161	2456166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52571	NC_013158	GAC	2	6	2456184	2456189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52572	NC_013158	GACAGC	2	12	2456196	2456207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52573	NC_013158	GTG	3	9	2456236	2456244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053463
52574	NC_013158	GAC	2	6	2456256	2456261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52575	NC_013158	GAT	2	6	2456274	2456279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053463
52576	NC_013158	GAC	2	6	2456303	2456308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
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52580	NC_013158	CGA	2	6	2456497	2456502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
52581	NC_013158	CGTGA	2	10	2456522	2456531	20 %	20 %	40 %	20 %	257053463
52582	NC_013158	GACG	2	8	2456670	2456677	25 %	0 %	50 %	25 %	257053464
52583	NC_013158	GCC	2	6	2456821	2456826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053464
52584	NC_013158	GCC	2	6	2456839	2456844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053464
52585	NC_013158	CGG	2	6	2456894	2456899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053464
52586	NC_013158	ACG	2	6	2456903	2456908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053464
52587	NC_013158	TCGA	2	8	2457052	2457059	25 %	25 %	25 %	25 %	257053464
52588	NC_013158	ACGT	2	8	2457076	2457083	25 %	25 %	25 %	25 %	257053464
52589	NC_013158	TCC	2	6	2457092	2457097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053464
52590	NC_013158	CTG	2	6	2457112	2457117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053464
52591	NC_013158	CG	3	6	2457120	2457125	0 %	0 %	50 %	50 %	257053464
52592	NC_013158	TGG	2	6	2457140	2457145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053464
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52594	NC_013158	AC	3	6	2457167	2457172	50 %	0 %	0 %	50 %	257053464
52595	NC_013158	ACG	3	9	2457203	2457211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053464
52596	NC_013158	CGA	2	6	2457225	2457230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053464
52597	NC_013158	TGA	2	6	2457233	2457238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053464
52598	NC_013158	CGA	2	6	2457333	2457338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053464
52599	NC_013158	CGC	2	6	2457366	2457371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053464
52600	NC_013158	ATC	3	9	2457418	2457426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053464
52601	NC_013158	CGC	2	6	2457431	2457436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053464
52602	NC_013158	GCCC	2	8	2457524	2457531	0 %	0 %	25 %	75 %	257053464
52603	NC_013158	GTC	3	9	2457577	2457585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053464
52604	NC_013158	CAC	2	6	2457630	2457635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053464
52605	NC_013158	GTG	2	6	2457699	2457704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053464
52606	NC_013158	CGA	2	6	2457708	2457713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053464
52607	NC_013158	CTT	2	6	2457729	2457734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053464
52608	NC_013158	GAC	2	6	2457778	2457783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053464
52609	NC_013158	CAGAT	2	10	2457785	2457794	40 %	20 %	20 %	20 %	257053464
52610	NC_013158	G	7	7	2457795	2457801	0 %	0 %	100 %	0 %	257053464
52611	NC_013158	CTGG	2	8	2457813	2457820	0 %	25 %	50 %	25 %	257053464
52612	NC_013158	CGA	3	9	2457858	2457866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053464
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52614	NC_013158	CGA	2	6	2457948	2457953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053464
52615	NC_013158	GGCC	2	8	2457960	2457967	0 %	0 %	50 %	50 %	257053464
52616	NC_013158	GACGG	2	10	2458018	2458027	20 %	0 %	60 %	20 %	257053464
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52642	NC_013158	CGA	2	6	2459084	2459089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053464
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52729	NC_013158	CGA	2	6	2462243	2462248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053465
52730	NC_013158	CGA	2	6	2462259	2462264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053465
52731	NC_013158	GAC	2	6	2462272	2462277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053465
52732	NC_013158	TCG	2	6	2462309	2462314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053465
52733	NC_013158	ACG	2	6	2462324	2462329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053465
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52735	NC_013158	CGT	2	6	2462496	2462501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053465
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52740	NC_013158	G	6	6	2462694	2462699	0 %	0 %	100 %	0 %	257053465
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52762	NC_013158	TAC	2	6	2463621	2463626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053466
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52824	NC_013158	GTC	2	6	2466981	2466986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053469
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52830	NC_013158	GCTCG	2	10	2467286	2467295	0 %	20 %	40 %	40 %	257053469
52831	NC_013158	GTCG	2	8	2467331	2467338	0 %	25 %	50 %	25 %	257053469
52832	NC_013158	GA	3	6	2467444	2467449	50 %	0 %	50 %	0 %	257053469
52833	NC_013158	CGG	2	6	2467460	2467465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053469
52834	NC_013158	CGGA	2	8	2467557	2467564	25 %	0 %	50 %	25 %	257053469
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52840	NC_013158	CTC	2	6	2467935	2467940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053470
52841	NC_013158	TCGC	2	8	2468014	2468021	0 %	25 %	25 %	50 %	257053470
52842	NC_013158	GTC	2	6	2468088	2468093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053470
52843	NC_013158	TCGTC	2	10	2468204	2468213	0 %	40 %	20 %	40 %	257053470
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52851	NC_013158	GTC	2	6	2468782	2468787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053471
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52871	NC_013158	GA	3	6	2469347	2469352	50 %	0 %	50 %	0 %	257053471
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52945	NC_013158	GGC	2	6	2472374	2472379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053475
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52949	NC_013158	C	6	6	2472599	2472604	0 %	0 %	0 %	100 %	257053475
52950	NC_013158	CTTC	2	8	2472691	2472698	0 %	50 %	0 %	50 %	257053475
52951	NC_013158	CG	3	6	2472707	2472712	0 %	0 %	50 %	50 %	257053475
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52954	NC_013158	TCG	2	6	2472816	2472821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053475
52955	NC_013158	CCGTTC	2	12	2472828	2472839	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257053475
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