MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52001	NC_013158	G	6	6	2435566	2435571	0 %	0 %	100 %	0 %	257053455
52002	NC_013158	CGTC	3	12	2435584	2435595	0 %	25 %	25 %	50 %	257053455
52003	NC_013158	CGG	2	6	2435611	2435616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053455
52004	NC_013158	TCC	2	6	2435618	2435623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053455
52005	NC_013158	CGG	2	6	2435681	2435686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053455
52006	NC_013158	GAG	2	6	2435695	2435700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053455
52007	NC_013158	CGA	2	6	2435712	2435717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053455
52008	NC_013158	TCGA	2	8	2435725	2435732	25 %	25 %	25 %	25 %	257053455
52009	NC_013158	TGG	2	6	2435753	2435758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053455
52010	NC_013158	GT	3	6	2435790	2435795	0 %	50 %	50 %	0 %	257053455
52011	NC_013158	ACG	3	9	2435804	2435812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053455
52012	NC_013158	CGC	2	6	2435835	2435840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053455
52013	NC_013158	CGG	2	6	2435982	2435987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053455
52014	NC_013158	GAG	2	6	2436004	2436009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053455
52015	NC_013158	TGG	2	6	2436010	2436015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053455
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52018	NC_013158	GACC	2	8	2436129	2436136	25 %	0 %	25 %	50 %	257053455
52019	NC_013158	GAC	2	6	2436162	2436167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053455
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52029	NC_013158	GACA	2	8	2436549	2436556	50 %	0 %	25 %	25 %	257053455
52030	NC_013158	GAGACG	2	12	2436565	2436576	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257053455
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52041	NC_013158	CGA	2	6	2436873	2436878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053455
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52043	NC_013158	GGC	2	6	2436979	2436984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053455
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52103	NC_013158	GATC	2	8	2439733	2439740	25 %	25 %	25 %	25 %	257053457
52104	NC_013158	CA	3	6	2439786	2439791	50 %	0 %	0 %	50 %	257053457
52105	NC_013158	GCC	2	6	2439794	2439799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053457
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52113	NC_013158	GACT	2	8	2440156	2440163	25 %	25 %	25 %	25 %	257053457
52114	NC_013158	ACG	2	6	2440181	2440186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
52115	NC_013158	GAC	2	6	2440234	2440239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
52116	NC_013158	AGTC	2	8	2440242	2440249	25 %	25 %	25 %	25 %	257053457
52117	NC_013158	ACG	3	9	2440271	2440279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
52118	NC_013158	GAC	2	6	2440316	2440321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
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52120	NC_013158	CGA	2	6	2440341	2440346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
52121	NC_013158	TC	3	6	2440348	2440353	0 %	50 %	0 %	50 %	257053457
52122	NC_013158	CGA	3	9	2440359	2440367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
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52142	NC_013158	CGA	2	6	2440939	2440944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
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52192	NC_013158	CGT	2	6	2442751	2442756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053458
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52197	NC_013158	GATGGC	2	12	2442959	2442970	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053458
52198	NC_013158	GGCGAT	2	12	2442974	2442985	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053458
52199	NC_013158	GAA	2	6	2442989	2442994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053458
52200	NC_013158	TGATC	2	10	2443018	2443027	20 %	40 %	20 %	20 %	257053458
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52202	NC_013158	GAC	2	6	2443174	2443179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053458
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52209	NC_013158	GACGGT	2	12	2443343	2443354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053458
52210	NC_013158	TCG	2	6	2443374	2443379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053458
52211	NC_013158	GATC	2	8	2443384	2443391	25 %	25 %	25 %	25 %	257053458
52212	NC_013158	ACG	2	6	2443397	2443402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053458
52213	NC_013158	GAC	2	6	2443525	2443530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053458
52214	NC_013158	GCC	2	6	2443538	2443543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053458
52215	NC_013158	GACA	2	8	2443570	2443577	50 %	0 %	25 %	25 %	257053458
52216	NC_013158	ACG	3	9	2443578	2443586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053458
52217	NC_013158	GACA	2	8	2443809	2443816	50 %	0 %	25 %	25 %	257053459
52218	NC_013158	ACA	3	9	2443814	2443822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053459
52219	NC_013158	CGA	2	6	2443829	2443834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053459
52220	NC_013158	ACG	2	6	2443858	2443863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053459
52221	NC_013158	AGCGCC	2	12	2443984	2443995	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257053459
52222	NC_013158	CGT	2	6	2444033	2444038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053459
52223	NC_013158	GCTGG	2	10	2444061	2444070	0 %	20 %	60 %	20 %	257053459
52224	NC_013158	TGA	2	6	2444075	2444080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053459
52225	NC_013158	ATCGAG	2	12	2444110	2444121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053459
52226	NC_013158	CGA	2	6	2444133	2444138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053459
52227	NC_013158	CGA	2	6	2444144	2444149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053459
52228	NC_013158	CGA	2	6	2444175	2444180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053459
52229	NC_013158	ATC	2	6	2444216	2444221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053459
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52231	NC_013158	CGCT	2	8	2444297	2444304	0 %	25 %	25 %	50 %	257053459
52232	NC_013158	TGA	2	6	2444330	2444335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053459
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52314	NC_013158	CGT	2	6	2447547	2447552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053460
52315	NC_013158	ATCG	2	8	2447563	2447570	25 %	25 %	25 %	25 %	257053460
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52317	NC_013158	GATCGA	2	12	2447653	2447664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053460
52318	NC_013158	AC	3	6	2447693	2447698	50 %	0 %	0 %	50 %	257053461
52319	NC_013158	GAC	3	9	2447708	2447716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
52320	NC_013158	CGA	2	6	2447726	2447731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
52321	NC_013158	CGG	2	6	2447783	2447788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053461
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52326	NC_013158	CGC	3	9	2447880	2447888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053461
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52328	NC_013158	G	6	6	2447943	2447948	0 %	0 %	100 %	0 %	257053461
52329	NC_013158	GACG	2	8	2448007	2448014	25 %	0 %	50 %	25 %	257053461
52330	NC_013158	CTG	2	6	2448023	2448028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053461
52331	NC_013158	GAC	3	9	2448038	2448046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
52332	NC_013158	GCC	3	9	2448115	2448123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053461
52333	NC_013158	CGA	2	6	2448133	2448138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
52334	NC_013158	GAG	2	6	2448161	2448166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053461
52335	NC_013158	GCGCG	2	10	2448199	2448208	0 %	0 %	60 %	40 %	257053461
52336	NC_013158	CAT	2	6	2448214	2448219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053461
52337	NC_013158	ATC	2	6	2448225	2448230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053461
52338	NC_013158	ACG	2	6	2448252	2448257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
52339	NC_013158	CGC	2	6	2448300	2448305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053461
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52341	NC_013158	CCTGAT	2	12	2448472	2448483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257053461
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52444	NC_013158	CGG	2	6	2451864	2451869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
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52447	NC_013158	GGA	2	6	2452059	2452064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053462
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52450	NC_013158	TCA	2	6	2452133	2452138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053462
52451	NC_013158	CGA	2	6	2452146	2452151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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52453	NC_013158	GAC	2	6	2452164	2452169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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52455	NC_013158	CAC	2	6	2452249	2452254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053462
52456	NC_013158	GT	3	6	2452273	2452278	0 %	50 %	50 %	0 %	257053462
52457	NC_013158	GAC	2	6	2452339	2452344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52458	NC_013158	GTC	2	6	2452345	2452350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52459	NC_013158	CGC	2	6	2452377	2452382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053462
52460	NC_013158	GCT	2	6	2452413	2452418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52461	NC_013158	TCAACG	2	12	2452427	2452438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257053462
52462	NC_013158	ACG	2	6	2452487	2452492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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52467	NC_013158	CTT	2	6	2452676	2452681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053462
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52469	NC_013158	CGA	2	6	2452767	2452772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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52471	NC_013158	GCG	2	6	2452859	2452864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
52472	NC_013158	TCG	2	6	2452922	2452927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
52473	NC_013158	GA	3	6	2452937	2452942	50 %	0 %	50 %	0 %	257053462
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52475	NC_013158	CGA	2	6	2453070	2453075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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52478	NC_013158	CGA	2	6	2453178	2453183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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52483	NC_013158	CGC	3	9	2453349	2453357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053462
52484	NC_013158	GC	3	6	2453356	2453361	0 %	0 %	50 %	50 %	257053462
52485	NC_013158	CGA	2	6	2453364	2453369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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