MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_013158	CGA	2	6	2413874	2413879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053433
51502	NC_013158	TCG	2	6	2413897	2413902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053433
51503	NC_013158	TCCG	2	8	2413948	2413955	0 %	25 %	25 %	50 %	257053433
51504	NC_013158	CGG	2	6	2413973	2413978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053433
51505	NC_013158	TG	3	6	2414039	2414044	0 %	50 %	50 %	0 %	257053433
51506	NC_013158	GGC	2	6	2414144	2414149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053434
51507	NC_013158	AGT	2	6	2414243	2414248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053434
51508	NC_013158	CGA	2	6	2414280	2414285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053434
51509	NC_013158	GCC	2	6	2414287	2414292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053434
51510	NC_013158	GCG	2	6	2414330	2414335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053434
51511	NC_013158	CGC	2	6	2414401	2414406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053434
51512	NC_013158	CGA	2	6	2414430	2414435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053434
51513	NC_013158	CGC	2	6	2414464	2414469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053434
51514	NC_013158	TCG	2	6	2414559	2414564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053434
51515	NC_013158	AGGT	2	8	2414591	2414598	25 %	25 %	50 %	0 %	257053434
51516	NC_013158	GAA	2	6	2414614	2414619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053434
51517	NC_013158	CAG	2	6	2414662	2414667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053434
51518	NC_013158	CAC	2	6	2414701	2414706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053434
51519	NC_013158	GA	3	6	2414714	2414719	50 %	0 %	50 %	0 %	257053434
51520	NC_013158	GC	3	6	2414743	2414748	0 %	0 %	50 %	50 %	257053434
51521	NC_013158	CAG	2	6	2414752	2414757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053434
51522	NC_013158	CGGC	2	8	2414834	2414841	0 %	0 %	50 %	50 %	257053435
51523	NC_013158	TCG	3	9	2414845	2414853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053435
51524	NC_013158	GAC	2	6	2414856	2414861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053435
51525	NC_013158	GCG	2	6	2414933	2414938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053435
51526	NC_013158	CGA	2	6	2414942	2414947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053435
51527	NC_013158	CGAGCA	2	12	2415110	2415121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053435
51528	NC_013158	CGAC	2	8	2415149	2415156	25 %	0 %	25 %	50 %	257053435
51529	NC_013158	GA	3	6	2415178	2415183	50 %	0 %	50 %	0 %	257053435
51530	NC_013158	CAGG	2	8	2415231	2415238	25 %	0 %	50 %	25 %	257053435
51531	NC_013158	TTCG	2	8	2415245	2415252	0 %	50 %	25 %	25 %	257053435
51532	NC_013158	TCGCG	2	10	2415287	2415296	0 %	20 %	40 %	40 %	257053435
51533	NC_013158	GAC	2	6	2415333	2415338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053435
51534	NC_013158	TCG	2	6	2415361	2415366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053435
51535	NC_013158	TCG	2	6	2415376	2415381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053435
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51538	NC_013158	CGA	2	6	2415467	2415472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053435
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51540	NC_013158	GGAC	2	8	2415494	2415501	25 %	0 %	50 %	25 %	257053435
51541	NC_013158	GTGG	2	8	2415644	2415651	0 %	25 %	75 %	0 %	257053436
51542	NC_013158	CCT	2	6	2415670	2415675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053436
51543	NC_013158	GCCAG	2	10	2415706	2415715	20 %	0 %	40 %	40 %	257053436
51544	NC_013158	TCG	2	6	2415832	2415837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053436
51545	NC_013158	TC	3	6	2415855	2415860	0 %	50 %	0 %	50 %	257053437
51546	NC_013158	GCA	2	6	2415896	2415901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053437
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51548	NC_013158	AGACGA	2	12	2415932	2415943	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	257053437
51549	NC_013158	CTTG	2	8	2415950	2415957	0 %	50 %	25 %	25 %	257053437
51550	NC_013158	GCG	2	6	2416063	2416068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053437
51551	NC_013158	TCG	2	6	2416093	2416098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053437
51552	NC_013158	GAA	2	6	2416142	2416147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053437
51553	NC_013158	CGA	2	6	2416151	2416156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053437
51554	NC_013158	CGC	2	6	2416163	2416168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053437
51555	NC_013158	AGT	2	6	2416213	2416218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053437
51556	NC_013158	GAT	2	6	2416248	2416253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053437
51557	NC_013158	CGA	3	9	2416498	2416506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053438
51558	NC_013158	CGC	2	6	2416513	2416518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053438
51559	NC_013158	TCG	2	6	2416525	2416530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053438
51560	NC_013158	CAG	2	6	2416559	2416564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053438
51561	NC_013158	CGC	2	6	2416606	2416611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053438
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51565	NC_013158	CAA	2	6	2416757	2416762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053438
51566	NC_013158	GC	3	6	2416799	2416804	0 %	0 %	50 %	50 %	257053438
51567	NC_013158	GAT	2	6	2416883	2416888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053438
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51570	NC_013158	CGA	2	6	2416999	2417004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053438
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51583	NC_013158	CTT	2	6	2417652	2417657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053439
51584	NC_013158	TAC	2	6	2417686	2417691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053439
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51587	NC_013158	CCGT	2	8	2417940	2417947	0 %	25 %	25 %	50 %	257053439
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51600	NC_013158	CCGA	2	8	2418514	2418521	25 %	0 %	25 %	50 %	257053439
51601	NC_013158	CGA	2	6	2418537	2418542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053439
51602	NC_013158	CTA	2	6	2418579	2418584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053439
51603	NC_013158	TG	3	6	2418587	2418592	0 %	50 %	50 %	0 %	257053439
51604	NC_013158	CGA	3	9	2418606	2418614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053439
51605	NC_013158	ATC	2	6	2418712	2418717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053439
51606	NC_013158	TCG	3	9	2418761	2418769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053439
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51614	NC_013158	CG	3	6	2419020	2419025	0 %	0 %	50 %	50 %	257053440
51615	NC_013158	CTG	2	6	2419059	2419064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053440
51616	NC_013158	TC	3	6	2419067	2419072	0 %	50 %	0 %	50 %	257053440
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51845	NC_013158	CGA	2	6	2429670	2429675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053452
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51985	NC_013158	CGGC	2	8	2434793	2434800	0 %	0 %	50 %	50 %	257053454
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51988	NC_013158	CGA	2	6	2434892	2434897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053454
51989	NC_013158	ACG	2	6	2434909	2434914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053454
51990	NC_013158	CGA	2	6	2434923	2434928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053454
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