MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_013158	TCG	2	6	2391495	2391500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053413
51002	NC_013158	CGT	2	6	2391526	2391531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053413
51003	NC_013158	GCG	2	6	2391586	2391591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053413
51004	NC_013158	TCG	2	6	2391606	2391611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053413
51005	NC_013158	CG	3	6	2391620	2391625	0 %	0 %	50 %	50 %	257053413
51006	NC_013158	GTC	2	6	2391710	2391715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053413
51007	NC_013158	GCGACG	2	12	2391901	2391912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257053414
51008	NC_013158	CGA	2	6	2391927	2391932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053414
51009	NC_013158	GTT	2	6	2392098	2392103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053414
51010	NC_013158	ACG	2	6	2392175	2392180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053414
51011	NC_013158	TGC	2	6	2392185	2392190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053414
51012	NC_013158	CAG	2	6	2392258	2392263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053414
51013	NC_013158	CGG	2	6	2392275	2392280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053414
51014	NC_013158	GGT	2	6	2392296	2392301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053414
51015	NC_013158	GCTGG	2	10	2392480	2392489	0 %	20 %	60 %	20 %	257053415
51016	NC_013158	TCG	3	9	2392529	2392537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053415
51017	NC_013158	CGT	2	6	2392539	2392544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053415
51018	NC_013158	GTTC	2	8	2392595	2392602	0 %	50 %	25 %	25 %	257053415
51019	NC_013158	GTC	2	6	2392610	2392615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053415
51020	NC_013158	GATC	2	8	2392617	2392624	25 %	25 %	25 %	25 %	257053415
51021	NC_013158	CCG	2	6	2392640	2392645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053415
51022	NC_013158	CGA	2	6	2392717	2392722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053415
51023	NC_013158	CGGCGT	2	12	2392758	2392769	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257053415
51024	NC_013158	GAT	2	6	2392888	2392893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053415
51025	NC_013158	CGT	2	6	2392903	2392908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053415
51026	NC_013158	CCG	2	6	2392927	2392932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053415
51027	NC_013158	GAG	2	6	2392942	2392947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053415
51028	NC_013158	TCG	2	6	2392965	2392970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053415
51029	NC_013158	TCCC	2	8	2393001	2393008	0 %	25 %	0 %	75 %	257053415
51030	NC_013158	GAC	2	6	2393023	2393028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053415
51031	NC_013158	CCT	2	6	2393150	2393155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053416
51032	NC_013158	GCC	2	6	2393212	2393217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053416
51033	NC_013158	TCG	3	9	2393263	2393271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053416
51034	NC_013158	TGA	2	6	2393309	2393314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053416
51035	NC_013158	TGAG	2	8	2393351	2393358	25 %	25 %	50 %	0 %	257053416
51036	NC_013158	CTC	2	6	2393418	2393423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053416
51037	NC_013158	TGA	2	6	2393519	2393524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053416
51038	NC_013158	GGC	2	6	2393556	2393561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053416
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51040	NC_013158	GTC	2	6	2393604	2393609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053416
51041	NC_013158	GCG	2	6	2393629	2393634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053416
51042	NC_013158	CTC	2	6	2393718	2393723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053416
51043	NC_013158	CAC	2	6	2393762	2393767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053416
51044	NC_013158	CCCGT	2	10	2393866	2393875	0 %	20 %	20 %	60 %	257053416
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51047	NC_013158	CGA	2	6	2393957	2393962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053416
51048	NC_013158	CGA	3	9	2394242	2394250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053417
51049	NC_013158	CGG	2	6	2394262	2394267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053417
51050	NC_013158	GAC	2	6	2394294	2394299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053417
51051	NC_013158	CGA	2	6	2394329	2394334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053417
51052	NC_013158	TCGA	2	8	2394360	2394367	25 %	25 %	25 %	25 %	257053417
51053	NC_013158	CGGG	2	8	2394597	2394604	0 %	0 %	75 %	25 %	257053417
51054	NC_013158	AGC	2	6	2394625	2394630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053417
51055	NC_013158	ATCG	2	8	2394634	2394641	25 %	25 %	25 %	25 %	257053417
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51057	NC_013158	GCG	2	6	2394666	2394671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053417
51058	NC_013158	GGCG	2	8	2394692	2394699	0 %	0 %	75 %	25 %	257053417
51059	NC_013158	ATC	2	6	2394717	2394722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053417
51060	NC_013158	ACG	2	6	2394799	2394804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053417
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51062	NC_013158	CCG	2	6	2394813	2394818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053417
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51064	NC_013158	GA	3	6	2394923	2394928	50 %	0 %	50 %	0 %	257053417
51065	NC_013158	GA	3	6	2394970	2394975	50 %	0 %	50 %	0 %	257053417
51066	NC_013158	TCG	3	9	2395045	2395053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053417
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51069	NC_013158	GCT	2	6	2395088	2395093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053417
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51074	NC_013158	CTGGGA	2	12	2395427	2395438	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053417
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51076	NC_013158	GAC	2	6	2395548	2395553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053417
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51081	NC_013158	CATCGA	2	12	2395724	2395735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257053417
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51083	NC_013158	CCGACG	2	12	2395813	2395824	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257053417
51084	NC_013158	CA	3	6	2395900	2395905	50 %	0 %	0 %	50 %	257053417
51085	NC_013158	TCC	2	6	2395906	2395911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053417
51086	NC_013158	ACG	2	6	2395924	2395929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053417
51087	NC_013158	ACT	2	6	2395933	2395938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053417
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51089	NC_013158	CGGACG	2	12	2396050	2396061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257053417
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51093	NC_013158	TCGAA	2	10	2396275	2396284	40 %	20 %	20 %	20 %	257053417
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51099	NC_013158	GCG	2	6	2396446	2396451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053417
51100	NC_013158	CGGG	2	8	2396471	2396478	0 %	0 %	75 %	25 %	257053417
51101	NC_013158	GTC	2	6	2396550	2396555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053417
51102	NC_013158	TCG	2	6	2396584	2396589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053417
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51106	NC_013158	CCG	2	6	2396674	2396679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053417
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51109	NC_013158	CGTC	2	8	2396866	2396873	0 %	25 %	25 %	50 %	257053417
51110	NC_013158	CTG	2	6	2396883	2396888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053417
51111	NC_013158	CGC	2	6	2396936	2396941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053417
51112	NC_013158	CAG	2	6	2397024	2397029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053417
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51226	NC_013158	CG	3	6	2402335	2402340	0 %	0 %	50 %	50 %	257053422
51227	NC_013158	CGA	2	6	2402426	2402431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
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51230	NC_013158	CGGCG	2	10	2402534	2402543	0 %	0 %	60 %	40 %	257053422
51231	NC_013158	AGC	2	6	2402554	2402559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
51232	NC_013158	ACGCC	2	10	2402567	2402576	20 %	0 %	20 %	60 %	257053422
51233	NC_013158	CCG	2	6	2402623	2402628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053422
51234	NC_013158	ACG	2	6	2402635	2402640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
51235	NC_013158	GGT	2	6	2402682	2402687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053422
51236	NC_013158	TCG	3	9	2402728	2402736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053422
51237	NC_013158	CGC	2	6	2402797	2402802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053422
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51239	NC_013158	CGA	2	6	2402885	2402890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
51240	NC_013158	TCG	2	6	2402911	2402916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053422
51241	NC_013158	CGA	2	6	2402939	2402944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
51242	NC_013158	CCT	2	6	2402969	2402974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053422
51243	NC_013158	CCG	2	6	2402996	2403001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053422
51244	NC_013158	CGGC	2	8	2403029	2403036	0 %	0 %	50 %	50 %	257053422
51245	NC_013158	CGA	2	6	2403056	2403061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
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51253	NC_013158	TCG	2	6	2403408	2403413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053423
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51258	NC_013158	TCG	2	6	2403558	2403563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053423
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51330	NC_013158	CGA	2	6	2405914	2405919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053424
51331	NC_013158	TCG	2	6	2405934	2405939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053424
51332	NC_013158	CGACG	2	10	2406023	2406032	20 %	0 %	40 %	40 %	257053424
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51334	NC_013158	GTA	2	6	2406158	2406163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053424
51335	NC_013158	GTA	2	6	2406167	2406172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053424
51336	NC_013158	CTC	2	6	2406218	2406223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053424
51337	NC_013158	GCG	2	6	2406234	2406239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053424
51338	NC_013158	TTG	2	6	2406246	2406251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053424
51339	NC_013158	GGGT	2	8	2406265	2406272	0 %	25 %	75 %	0 %	257053424
51340	NC_013158	GAG	2	6	2406332	2406337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053424
51341	NC_013158	GCC	2	6	2406470	2406475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053424
51342	NC_013158	TCG	2	6	2406681	2406686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053425
51343	NC_013158	CAT	2	6	2406769	2406774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053425
51344	NC_013158	CGT	2	6	2406794	2406799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053425
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51457	NC_013158	GCG	2	6	2411698	2411703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053430
51458	NC_013158	GAC	2	6	2411725	2411730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053430
51459	NC_013158	C	6	6	2411769	2411774	0 %	0 %	0 %	100 %	257053430
51460	NC_013158	CGA	2	6	2411799	2411804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053430
51461	NC_013158	TCG	2	6	2411833	2411838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053430
51462	NC_013158	ACC	2	6	2411899	2411904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053430
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51464	NC_013158	GGA	2	6	2411943	2411948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053430
51465	NC_013158	TCGA	2	8	2411954	2411961	25 %	25 %	25 %	25 %	257053430
51466	NC_013158	CGA	3	9	2412042	2412050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053430
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51468	NC_013158	TCG	2	6	2412215	2412220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053430
51469	NC_013158	GTC	3	9	2412253	2412261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053430
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51473	NC_013158	GAT	2	6	2412372	2412377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053431
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51480	NC_013158	GT	3	6	2412544	2412549	0 %	50 %	50 %	0 %	257053431
51481	NC_013158	CCG	2	6	2412610	2412615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053431
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51483	NC_013158	CGCC	2	8	2413261	2413268	0 %	0 %	25 %	75 %	257053432
51484	NC_013158	GC	3	6	2413278	2413283	0 %	0 %	50 %	50 %	257053432
51485	NC_013158	GCC	2	6	2413319	2413324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053432
51486	NC_013158	GTC	2	6	2413435	2413440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053432
51487	NC_013158	TGA	2	6	2413443	2413448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053432
51488	NC_013158	GCGTT	2	10	2413457	2413466	0 %	40 %	40 %	20 %	257053432
51489	NC_013158	TCG	2	6	2413526	2413531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053432
51490	NC_013158	GGC	2	6	2413576	2413581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053432
51491	NC_013158	GAG	3	9	2413663	2413671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053432
51492	NC_013158	GC	3	6	2413704	2413709	0 %	0 %	50 %	50 %	257053432
51493	NC_013158	CGA	2	6	2413719	2413724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053432
51494	NC_013158	TCG	3	9	2413732	2413740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053433
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51496	NC_013158	TCG	2	6	2413774	2413779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053433
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51500	NC_013158	TCG	2	6	2413855	2413860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053433

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