MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012029	GC	3	6	595390	595395	0 %	0 %	50 %	50 %	222479012
15002	NC_012029	ACG	2	6	595416	595421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479012
15003	NC_012029	GCC	2	6	595447	595452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479012
15004	NC_012029	ACG	2	6	595524	595529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479012
15005	NC_012029	CGC	2	6	595540	595545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479012
15006	NC_012029	GGC	2	6	595585	595590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479012
15007	NC_012029	TCG	2	6	595611	595616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479012
15008	NC_012029	CGCGAT	2	12	595711	595722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222479012
15009	NC_012029	CGC	2	6	595759	595764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479012
15010	NC_012029	TCG	2	6	595791	595796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479012
15011	NC_012029	CTC	2	6	595804	595809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479012
15012	NC_012029	GCT	2	6	595816	595821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479012
15013	NC_012029	GAC	2	6	595823	595828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479012
15014	NC_012029	GCTCGG	2	12	595978	595989	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222479013
15015	NC_012029	ACG	2	6	596001	596006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479013
15016	NC_012029	GGC	2	6	596092	596097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479013
15017	NC_012029	GCC	2	6	596117	596122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479013
15018	NC_012029	GAC	2	6	596135	596140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479013
15019	NC_012029	CGA	2	6	596151	596156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479013
15020	NC_012029	GCC	2	6	596192	596197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479013
15021	NC_012029	CTG	2	6	596243	596248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479013
15022	NC_012029	GGCC	2	8	596259	596266	0 %	0 %	50 %	50 %	222479013
15023	NC_012029	GAG	2	6	596282	596287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479013
15024	NC_012029	CGA	2	6	596314	596319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479013
15025	NC_012029	CGC	2	6	596371	596376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479013
15026	NC_012029	GCT	2	6	596428	596433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479013
15027	NC_012029	GAA	2	6	596441	596446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222479013
15028	NC_012029	TCG	2	6	596481	596486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479013
15029	NC_012029	CGC	2	6	596493	596498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479013
15030	NC_012029	TCGC	2	8	596499	596506	0 %	25 %	25 %	50 %	222479013
15031	NC_012029	CGA	2	6	596518	596523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479013
15032	NC_012029	GAC	2	6	596675	596680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479013
15033	NC_012029	CAA	2	6	596690	596695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222479013
15034	NC_012029	GACC	2	8	596713	596720	25 %	0 %	25 %	50 %	222479013
15035	NC_012029	ACC	2	6	596961	596966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222479014
15036	NC_012029	ACG	2	6	597007	597012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479014
15037	NC_012029	TCC	2	6	597019	597024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479014
15038	NC_012029	CGC	2	6	597045	597050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479014
15039	NC_012029	ACG	2	6	597058	597063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479014
15040	NC_012029	TCC	2	6	597166	597171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479014
15041	NC_012029	ACC	2	6	597239	597244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222479015
15042	NC_012029	GA	3	6	597267	597272	50 %	0 %	50 %	0 %	222479015
15043	NC_012029	TCA	2	6	597419	597424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479015
15044	NC_012029	GTC	2	6	597457	597462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479015
15045	NC_012029	TTC	2	6	597614	597619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222479015
15046	NC_012029	CTTC	2	8	597678	597685	0 %	50 %	0 %	50 %	222479015
15047	NC_012029	AC	3	6	597689	597694	50 %	0 %	0 %	50 %	222479015
15048	NC_012029	CGA	2	6	597699	597704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479015
15049	NC_012029	GAA	2	6	597724	597729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222479015
15050	NC_012029	GCG	2	6	597736	597741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479015
15051	NC_012029	CAC	2	6	597777	597782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222479015
15052	NC_012029	GTC	2	6	597787	597792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479015
15053	NC_012029	AGT	2	6	597816	597821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222479015
15054	NC_012029	CGG	2	6	597882	597887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479015
15055	NC_012029	CTG	2	6	598015	598020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479015
15056	NC_012029	GTT	2	6	598126	598131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222479015
15057	NC_012029	TTC	2	6	598186	598191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222479015
15058	NC_012029	GTC	2	6	598210	598215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479015
15059	NC_012029	GTA	2	6	598216	598221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222479015
15060	NC_012029	TTTC	2	8	598224	598231	0 %	75 %	0 %	25 %	222479015
15061	NC_012029	TCG	3	9	598256	598264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479015
15062	NC_012029	TCC	2	6	598298	598303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479015
15063	NC_012029	GACTG	2	10	598314	598323	20 %	20 %	40 %	20 %	222479015
15064	NC_012029	GTG	2	6	598420	598425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222479015
15065	NC_012029	CGA	2	6	598861	598866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479016
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15067	NC_012029	TCG	3	9	598917	598925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479016
15068	NC_012029	CG	3	6	598957	598962	0 %	0 %	50 %	50 %	222479016
15069	NC_012029	GGA	2	6	599020	599025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479016
15070	NC_012029	GCG	2	6	599032	599037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479016
15071	NC_012029	TGT	2	6	599053	599058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222479016
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15073	NC_012029	CGA	2	6	599179	599184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479016
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15080	NC_012029	CGT	2	6	599356	599361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479016
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15089	NC_012029	CGG	2	6	599618	599623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479016
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15099	NC_012029	GTC	2	6	599957	599962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479016
15100	NC_012029	CTC	2	6	599963	599968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479016
15101	NC_012029	CGGT	2	8	600072	600079	0 %	25 %	50 %	25 %	222479016
15102	NC_012029	CCCTCG	2	12	600093	600104	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222479016
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15118	NC_012029	GAA	2	6	600563	600568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222479016
15119	NC_012029	TCG	2	6	600597	600602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479016
15120	NC_012029	TCCGGT	2	12	600617	600628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479016
15121	NC_012029	AGGA	2	8	600639	600646	50 %	0 %	50 %	0 %	222479016
15122	NC_012029	GCC	2	6	600649	600654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479016
15123	NC_012029	CCG	2	6	600675	600680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479016
15124	NC_012029	ACG	2	6	600966	600971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479017
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15126	NC_012029	GGC	2	6	600998	601003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479017
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15129	NC_012029	CCG	2	6	601050	601055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479017
15130	NC_012029	GCCGTC	2	12	601057	601068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222479017
15131	NC_012029	CGCGG	2	10	601075	601084	0 %	0 %	60 %	40 %	222479017
15132	NC_012029	CCG	2	6	601099	601104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479017
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15134	NC_012029	CGC	2	6	601156	601161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479017
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15136	NC_012029	TCG	2	6	601197	601202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479017
15137	NC_012029	TGG	2	6	601205	601210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222479017
15138	NC_012029	ACC	2	6	601215	601220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222479017
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15146	NC_012029	TCG	2	6	601368	601373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479017
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15148	NC_012029	CGA	2	6	601387	601392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479017
15149	NC_012029	CG	3	6	601411	601416	0 %	0 %	50 %	50 %	222479017
15150	NC_012029	CGCCA	2	10	601427	601436	20 %	0 %	20 %	60 %	222479017
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15154	NC_012029	GC	3	6	601516	601521	0 %	0 %	50 %	50 %	222479017
15155	NC_012029	GCGA	2	8	601538	601545	25 %	0 %	50 %	25 %	222479017
15156	NC_012029	CGA	2	6	601555	601560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479017
15157	NC_012029	GGCGAC	2	12	601633	601644	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222479017
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15171	NC_012029	CTC	2	6	602234	602239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479018
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15174	NC_012029	TG	3	6	602293	602298	0 %	50 %	50 %	0 %	222479018
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15183	NC_012029	GCC	2	6	602537	602542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479018
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15187	NC_012029	CGA	3	9	603151	603159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479019
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15190	NC_012029	GCGG	2	8	603187	603194	0 %	0 %	75 %	25 %	222479019
15191	NC_012029	CGG	2	6	603232	603237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479019
15192	NC_012029	ACT	2	6	603246	603251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479019
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15195	NC_012029	TCGAC	2	10	603466	603475	20 %	20 %	20 %	40 %	222479019
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15205	NC_012029	CTTG	2	8	603792	603799	0 %	50 %	25 %	25 %	222479020
15206	NC_012029	CGG	2	6	603813	603818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479020
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15209	NC_012029	GAC	2	6	603904	603909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479020
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15211	NC_012029	TCGCG	2	10	603985	603994	0 %	20 %	40 %	40 %	222479020
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15215	NC_012029	TCG	2	6	604154	604159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479020
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15218	NC_012029	CGG	2	6	604348	604353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479020
15219	NC_012029	CG	3	6	604354	604359	0 %	0 %	50 %	50 %	222479020
15220	NC_012029	TCG	2	6	604367	604372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479020
15221	NC_012029	ACG	2	6	604379	604384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479020
15222	NC_012029	TCG	2	6	604430	604435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479020
15223	NC_012029	AGG	2	6	604466	604471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479020
15224	NC_012029	CG	4	8	604578	604585	0 %	0 %	50 %	50 %	222479020
15225	NC_012029	TCG	2	6	604646	604651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479020
15226	NC_012029	ACG	2	6	604652	604657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479020
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15229	NC_012029	GCC	3	9	604981	604989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479021
15230	NC_012029	GGC	2	6	605003	605008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479021
15231	NC_012029	GTTG	2	8	605021	605028	0 %	50 %	50 %	0 %	222479021
15232	NC_012029	CGT	2	6	605053	605058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479021
15233	NC_012029	GC	3	6	605074	605079	0 %	0 %	50 %	50 %	222479021
15234	NC_012029	GTC	2	6	605114	605119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479021
15235	NC_012029	CGG	2	6	605131	605136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479021
15236	NC_012029	CGA	3	9	605227	605235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479021
15237	NC_012029	CGA	2	6	605361	605366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479022
15238	NC_012029	CTCG	2	8	605371	605378	0 %	25 %	25 %	50 %	222479022
15239	NC_012029	GACGGG	2	12	605402	605413	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222479022
15240	NC_012029	G	6	6	605415	605420	0 %	0 %	100 %	0 %	222479022
15241	NC_012029	ACC	2	6	605448	605453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222479022
15242	NC_012029	CGA	2	6	605455	605460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479022
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15245	NC_012029	CGA	2	6	605569	605574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479022
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15353	NC_012029	GGCGAC	2	12	609692	609703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222479025
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15356	NC_012029	CGG	2	6	609912	609917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479025
15357	NC_012029	CGG	2	6	609922	609927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479025
15358	NC_012029	CGG	2	6	609933	609938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479025
15359	NC_012029	GCGTC	2	10	609955	609964	0 %	20 %	40 %	40 %	222479025
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15472	NC_012029	CAA	2	6	614411	614416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222479028
15473	NC_012029	GA	3	6	614500	614505	50 %	0 %	50 %	0 %	222479028
15474	NC_012029	CGG	2	6	614548	614553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479028
15475	NC_012029	GCC	2	6	614566	614571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479028
15476	NC_012029	ACCGG	2	10	614581	614590	20 %	0 %	40 %	40 %	222479028
15477	NC_012029	ACCG	2	8	614647	614654	25 %	0 %	25 %	50 %	222479028
15478	NC_012029	AGC	2	6	614661	614666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479028
15479	NC_012029	CGC	2	6	614669	614674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479028
15480	NC_012029	GCC	2	6	614685	614690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479028
15481	NC_012029	GA	3	6	614720	614725	50 %	0 %	50 %	0 %	222479028
15482	NC_012029	CG	3	6	614798	614803	0 %	0 %	50 %	50 %	222479028
15483	NC_012029	CGT	2	6	614946	614951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479029
15484	NC_012029	GCC	2	6	614978	614983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479029
15485	NC_012029	GC	3	6	614989	614994	0 %	0 %	50 %	50 %	222479029
15486	NC_012029	TCG	2	6	615020	615025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479029
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15488	NC_012029	TCG	2	6	615059	615064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479029
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15495	NC_012029	GAC	2	6	615436	615441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479029
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15497	NC_012029	TCG	2	6	615553	615558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479030
15498	NC_012029	CCG	2	6	615588	615593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479030
15499	NC_012029	GCGG	2	8	615597	615604	0 %	0 %	75 %	25 %	222479030
15500	NC_012029	GCTC	2	8	615608	615615	0 %	25 %	25 %	50 %	222479030

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