MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012029	GAGTC	2	10	558652	558661	20 %	20 %	40 %	20 %	222478972
14002	NC_012029	CTA	2	6	558662	558667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478972
14003	NC_012029	GGCC	2	8	558841	558848	0 %	0 %	50 %	50 %	222478972
14004	NC_012029	CGA	3	9	558881	558889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478972
14005	NC_012029	CGACCG	2	12	558899	558910	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478972
14006	NC_012029	GCG	3	9	558945	558953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478973
14007	NC_012029	GTC	2	6	558968	558973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14008	NC_012029	CGG	3	9	559003	559011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478973
14009	NC_012029	GCT	2	6	559020	559025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14010	NC_012029	GCC	2	6	559028	559033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478973
14011	NC_012029	GGTC	2	8	559079	559086	0 %	25 %	50 %	25 %	222478973
14012	NC_012029	CG	3	6	559093	559098	0 %	0 %	50 %	50 %	222478973
14013	NC_012029	CGG	2	6	559132	559137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478973
14014	NC_012029	GC	3	6	559183	559188	0 %	0 %	50 %	50 %	222478973
14015	NC_012029	TCG	2	6	559200	559205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14016	NC_012029	TCG	2	6	559212	559217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14017	NC_012029	AGTC	2	8	559218	559225	25 %	25 %	25 %	25 %	222478973
14018	NC_012029	GAC	2	6	559241	559246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14019	NC_012029	GGA	2	6	559249	559254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478973
14020	NC_012029	GC	3	6	559256	559261	0 %	0 %	50 %	50 %	222478973
14021	NC_012029	AGG	2	6	559278	559283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478973
14022	NC_012029	GCG	2	6	559313	559318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478973
14023	NC_012029	ACG	2	6	559326	559331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14024	NC_012029	CGA	3	9	559351	559359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14025	NC_012029	CGG	2	6	559387	559392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478973
14026	NC_012029	ACG	2	6	559439	559444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14027	NC_012029	TCGCC	2	10	559464	559473	0 %	20 %	20 %	60 %	222478973
14028	NC_012029	CCGA	2	8	559482	559489	25 %	0 %	25 %	50 %	222478973
14029	NC_012029	CGG	2	6	559500	559505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478973
14030	NC_012029	GTC	2	6	559535	559540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14031	NC_012029	CG	3	6	559546	559551	0 %	0 %	50 %	50 %	222478973
14032	NC_012029	CGA	2	6	559555	559560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14033	NC_012029	TGG	2	6	559565	559570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478973
14034	NC_012029	CGG	2	6	559575	559580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478973
14035	NC_012029	GAG	3	9	559619	559627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478973
14036	NC_012029	CG	4	8	559708	559715	0 %	0 %	50 %	50 %	222478973
14037	NC_012029	CGA	2	6	559732	559737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14038	NC_012029	CGT	2	6	559746	559751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14039	NC_012029	CGA	2	6	559762	559767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478973
14040	NC_012029	GC	4	8	559795	559802	0 %	0 %	50 %	50 %	222478973
14041	NC_012029	CG	3	6	559821	559826	0 %	0 %	50 %	50 %	222478973
14042	NC_012029	CGT	2	6	559828	559833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478973
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14044	NC_012029	GTCG	2	8	559923	559930	0 %	25 %	50 %	25 %	222478974
14045	NC_012029	CGG	2	6	559932	559937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478974
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14048	NC_012029	TCG	2	6	559954	559959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478974
14049	NC_012029	GTC	4	12	560023	560034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478974
14050	NC_012029	CGGT	2	8	560075	560082	0 %	25 %	50 %	25 %	222478974
14051	NC_012029	GC	3	6	560091	560096	0 %	0 %	50 %	50 %	222478974
14052	NC_012029	TCC	2	6	560114	560119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478974
14053	NC_012029	GCTG	2	8	560129	560136	0 %	25 %	50 %	25 %	222478974
14054	NC_012029	CTT	2	6	560142	560147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478974
14055	NC_012029	TCG	2	6	560252	560257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478974
14056	NC_012029	TCG	2	6	560264	560269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478974
14057	NC_012029	TGA	2	6	560366	560371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478974
14058	NC_012029	GTG	2	6	560386	560391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478974
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14060	NC_012029	CGG	2	6	560433	560438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478974
14061	NC_012029	GTC	2	6	560455	560460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478974
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14063	NC_012029	TCG	2	6	560519	560524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478974
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14065	NC_012029	TTC	3	9	560557	560565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478974
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14084	NC_012029	GCGA	2	8	561139	561146	25 %	0 %	50 %	25 %	222478975
14085	NC_012029	TCGG	2	8	561157	561164	0 %	25 %	50 %	25 %	222478975
14086	NC_012029	TCG	2	6	561281	561286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478975
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14089	NC_012029	CGGT	2	8	561480	561487	0 %	25 %	50 %	25 %	222478975
14090	NC_012029	TTC	2	6	561502	561507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478975
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14101	NC_012029	CGT	4	12	561756	561767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478975
14102	NC_012029	GCC	2	6	561787	561792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478975
14103	NC_012029	CGGAT	2	10	561800	561809	20 %	20 %	40 %	20 %	222478975
14104	NC_012029	GAG	2	6	561853	561858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478975
14105	NC_012029	CG	3	6	561929	561934	0 %	0 %	50 %	50 %	222478975
14106	NC_012029	GAC	2	6	562120	562125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478976
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14109	NC_012029	CGG	3	9	562212	562220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478976
14110	NC_012029	CGAC	2	8	562259	562266	25 %	0 %	25 %	50 %	222478976
14111	NC_012029	CGAC	2	8	562274	562281	25 %	0 %	25 %	50 %	222478976
14112	NC_012029	GAC	3	9	562279	562287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478976
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14116	NC_012029	ACT	2	6	562466	562471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478976
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14118	NC_012029	CTC	2	6	562539	562544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478976
14119	NC_012029	CGA	2	6	562647	562652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478976
14120	NC_012029	GAG	2	6	562717	562722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478976
14121	NC_012029	TAC	2	6	562741	562746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478976
14122	NC_012029	TCG	2	6	562769	562774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478976
14123	NC_012029	GAGCGC	2	12	562789	562800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478976
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14125	NC_012029	GCC	2	6	562857	562862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478976
14126	NC_012029	GGA	3	9	562863	562871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478976
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14129	NC_012029	CGT	2	6	563013	563018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478976
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14133	NC_012029	CGG	2	6	563144	563149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478976
14134	NC_012029	TCCA	2	8	563165	563172	25 %	25 %	0 %	50 %	222478976
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14154	NC_012029	CGGC	3	12	564140	564151	0 %	0 %	50 %	50 %	222478977
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14218	NC_012029	CGA	2	6	565966	565971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478979
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14221	NC_012029	GCTCGC	2	12	566026	566037	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478979
14222	NC_012029	GCG	2	6	566043	566048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478979
14223	NC_012029	CGT	2	6	566083	566088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478979
14224	NC_012029	ATC	2	6	566142	566147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478979
14225	NC_012029	GC	3	6	566149	566154	0 %	0 %	50 %	50 %	222478979
14226	NC_012029	CGG	2	6	566176	566181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478979
14227	NC_012029	CCCG	2	8	566197	566204	0 %	0 %	25 %	75 %	222478979
14228	NC_012029	CTC	2	6	566222	566227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478979
14229	NC_012029	GTC	2	6	566264	566269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478979
14230	NC_012029	CGCC	2	8	566326	566333	0 %	0 %	25 %	75 %	222478979
14231	NC_012029	CGT	2	6	566350	566355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478979
14232	NC_012029	TCG	2	6	566421	566426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478979
14233	NC_012029	AGG	2	6	566430	566435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478979
14234	NC_012029	GTC	2	6	566438	566443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478979
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14356	NC_012029	CGA	3	9	570218	570226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478980
14357	NC_012029	ACCG	2	8	570240	570247	25 %	0 %	25 %	50 %	222478980
14358	NC_012029	CGA	2	6	570257	570262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478980
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14471	NC_012029	GTC	2	6	575062	575067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478987
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