MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012029	AGCC	2	8	539156	539163	25 %	0 %	25 %	50 %	222478953
13502	NC_012029	CGT	2	6	539164	539169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478953
13503	NC_012029	GTG	2	6	539198	539203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478953
13504	NC_012029	GAC	2	6	539219	539224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478953
13505	NC_012029	CCG	4	12	539275	539286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478953
13506	NC_012029	GTC	3	9	539300	539308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478953
13507	NC_012029	TCG	2	6	539328	539333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478953
13508	NC_012029	GCG	2	6	539337	539342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478953
13509	NC_012029	GGT	2	6	539413	539418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478953
13510	NC_012029	GAG	3	9	539445	539453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478953
13511	NC_012029	CCGA	2	8	539457	539464	25 %	0 %	25 %	50 %	222478953
13512	NC_012029	GAA	2	6	539486	539491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478953
13513	NC_012029	GAC	2	6	539543	539548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478953
13514	NC_012029	GCC	3	9	539593	539601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478953
13515	NC_012029	GGC	2	6	539638	539643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478953
13516	NC_012029	CTGT	2	8	539764	539771	0 %	50 %	25 %	25 %	222478954
13517	NC_012029	CGC	2	6	539803	539808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13518	NC_012029	CGT	2	6	539842	539847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13519	NC_012029	CGC	2	6	539878	539883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13520	NC_012029	CGT	2	6	539898	539903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13521	NC_012029	CGG	2	6	539928	539933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478954
13522	NC_012029	CGC	2	6	539940	539945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13523	NC_012029	GTG	2	6	539948	539953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478954
13524	NC_012029	CGC	2	6	539968	539973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13525	NC_012029	CGCTCG	2	12	540033	540044	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478954
13526	NC_012029	CGA	2	6	540049	540054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13527	NC_012029	TGG	2	6	540066	540071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478954
13528	NC_012029	CGC	2	6	540117	540122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13529	NC_012029	CGC	2	6	540137	540142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13530	NC_012029	CTC	2	6	540152	540157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478954
13531	NC_012029	TCGGC	2	10	540166	540175	0 %	20 %	40 %	40 %	222478954
13532	NC_012029	ACGCCC	2	12	540192	540203	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222478954
13533	NC_012029	ACG	2	6	540267	540272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13534	NC_012029	GCT	2	6	540292	540297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13535	NC_012029	CGA	2	6	540371	540376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13536	NC_012029	CGG	2	6	540417	540422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478954
13537	NC_012029	CGA	2	6	540499	540504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13538	NC_012029	GC	3	6	540591	540596	0 %	0 %	50 %	50 %	222478954
13539	NC_012029	GAG	2	6	540611	540616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478954
13540	NC_012029	CGC	2	6	540649	540654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13541	NC_012029	CGG	2	6	540685	540690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478954
13542	NC_012029	CCG	2	6	540691	540696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13543	NC_012029	CGT	2	6	540706	540711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13544	NC_012029	GGC	2	6	540733	540738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478954
13545	NC_012029	GTC	3	9	540758	540766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13546	NC_012029	GAC	2	6	540767	540772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478954
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13549	NC_012029	GTC	2	6	540806	540811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13550	NC_012029	CGA	2	6	540819	540824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13551	NC_012029	GCT	2	6	540903	540908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13552	NC_012029	CCT	2	6	540979	540984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478954
13553	NC_012029	CCG	2	6	540990	540995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13554	NC_012029	GAAC	2	8	541006	541013	50 %	0 %	25 %	25 %	222478954
13555	NC_012029	GCT	2	6	541027	541032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13556	NC_012029	CGC	2	6	541033	541038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13557	NC_012029	GC	3	6	541044	541049	0 %	0 %	50 %	50 %	222478954
13558	NC_012029	TCC	2	6	541068	541073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478954
13559	NC_012029	GGCGT	2	10	541081	541090	0 %	20 %	60 %	20 %	222478954
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13561	NC_012029	CGC	2	6	541117	541122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
13562	NC_012029	GAG	2	6	541139	541144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478954
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13564	NC_012029	TCG	2	6	541473	541478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13565	NC_012029	CGGG	2	8	541489	541496	0 %	0 %	75 %	25 %	222478954
13566	NC_012029	CGT	2	6	541504	541509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
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13570	NC_012029	GTC	2	6	541598	541603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
13571	NC_012029	GTC	2	6	541628	541633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
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13573	NC_012029	CGT	2	6	541663	541668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
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13577	NC_012029	CG	3	6	541714	541719	0 %	0 %	50 %	50 %	222478954
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13579	NC_012029	GCA	2	6	541843	541848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478955
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13583	NC_012029	CGG	2	6	541999	542004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478955
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13585	NC_012029	GC	3	6	542035	542040	0 %	0 %	50 %	50 %	222478955
13586	NC_012029	TCA	2	6	542094	542099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478955
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13590	NC_012029	CCT	2	6	542370	542375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478956
13591	NC_012029	CGA	2	6	542399	542404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478956
13592	NC_012029	GTC	2	6	542428	542433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478956
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13598	NC_012029	CGT	2	6	542568	542573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478956
13599	NC_012029	TCG	3	9	542582	542590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478956
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13601	NC_012029	CGGT	2	8	542681	542688	0 %	25 %	50 %	25 %	222478956
13602	NC_012029	GCC	2	6	542705	542710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478956
13603	NC_012029	TCG	3	9	542741	542749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478956
13604	NC_012029	CGC	2	6	542750	542755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478956
13605	NC_012029	TGC	2	6	542777	542782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478956
13606	NC_012029	CCG	2	6	542804	542809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478956
13607	NC_012029	GCG	2	6	542841	542846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478956
13608	NC_012029	TCGCCC	2	12	542930	542941	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222478956
13609	NC_012029	GCGG	2	8	543032	543039	0 %	0 %	75 %	25 %	222478956
13610	NC_012029	CGA	2	6	543054	543059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478956
13611	NC_012029	ACTC	2	8	543069	543076	25 %	25 %	0 %	50 %	222478956
13612	NC_012029	CGT	2	6	543100	543105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478957
13613	NC_012029	AGC	2	6	543120	543125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478957
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13615	NC_012029	GGTG	2	8	543160	543167	0 %	25 %	75 %	0 %	222478957
13616	NC_012029	TCG	2	6	543174	543179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478957
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13618	NC_012029	CGCC	2	8	543306	543313	0 %	0 %	25 %	75 %	222478957
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13971	NC_012029	TCG	2	6	557169	557174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478971
13972	NC_012029	GCC	2	6	557178	557183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478971
13973	NC_012029	GTG	2	6	557252	557257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478971
13974	NC_012029	TGG	2	6	557268	557273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478971
13975	NC_012029	GAT	2	6	557315	557320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478971
13976	NC_012029	GC	3	6	557373	557378	0 %	0 %	50 %	50 %	222478971
13977	NC_012029	GC	3	6	557680	557685	0 %	0 %	50 %	50 %	222478972
13978	NC_012029	TCGC	2	8	557736	557743	0 %	25 %	25 %	50 %	222478972
13979	NC_012029	GAC	2	6	557811	557816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478972
13980	NC_012029	CGAGGA	2	12	557843	557854	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222478972
13981	NC_012029	GACG	2	8	557855	557862	25 %	0 %	50 %	25 %	222478972
13982	NC_012029	CGG	2	6	557864	557869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478972
13983	NC_012029	CTG	2	6	557955	557960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478972
13984	NC_012029	CGG	2	6	558029	558034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478972
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13997	NC_012029	GCT	2	6	558503	558508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478972
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