MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012029	GGA	2	6	522017	522022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478937
13002	NC_012029	CGC	2	6	522026	522031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478937
13003	NC_012029	GCG	2	6	522076	522081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478937
13004	NC_012029	ACT	2	6	522091	522096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478937
13005	NC_012029	CAA	2	6	522119	522124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478937
13006	NC_012029	GCCG	2	8	522130	522137	0 %	0 %	50 %	50 %	222478937
13007	NC_012029	AGG	2	6	522151	522156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478937
13008	NC_012029	GAG	2	6	522165	522170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478937
13009	NC_012029	GACG	2	8	522203	522210	25 %	0 %	50 %	25 %	222478937
13010	NC_012029	TCG	2	6	522220	522225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478937
13011	NC_012029	GAG	2	6	522264	522269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478937
13012	NC_012029	GAG	2	6	522285	522290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478937
13013	NC_012029	CGA	2	6	522320	522325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478937
13014	NC_012029	GAG	2	6	522336	522341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478937
13015	NC_012029	GCC	2	6	522357	522362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478937
13016	NC_012029	ACT	2	6	522382	522387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478937
13017	NC_012029	GGA	2	6	522404	522409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478937
13018	NC_012029	TAC	2	6	522510	522515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478937
13019	NC_012029	CGA	2	6	522551	522556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478937
13020	NC_012029	CGAGC	2	10	522572	522581	20 %	0 %	40 %	40 %	222478937
13021	NC_012029	GCG	2	6	522598	522603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478937
13022	NC_012029	TCGA	2	8	522642	522649	25 %	25 %	25 %	25 %	222478937
13023	NC_012029	CG	3	6	522680	522685	0 %	0 %	50 %	50 %	222478937
13024	NC_012029	TCG	2	6	522691	522696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478937
13025	NC_012029	GAC	2	6	522701	522706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478937
13026	NC_012029	TCG	2	6	522718	522723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478937
13027	NC_012029	GAC	2	6	522920	522925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13028	NC_012029	AGG	2	6	522929	522934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478938
13029	NC_012029	CGG	2	6	522942	522947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478938
13030	NC_012029	CGC	2	6	522954	522959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478938
13031	NC_012029	GCG	2	6	522964	522969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478938
13032	NC_012029	ACG	2	6	522982	522987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13033	NC_012029	GCT	2	6	523005	523010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13034	NC_012029	GGT	2	6	523020	523025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478938
13035	NC_012029	CGGC	2	8	523085	523092	0 %	0 %	50 %	50 %	222478938
13036	NC_012029	CAT	2	6	523110	523115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478938
13037	NC_012029	CTG	2	6	523120	523125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13038	NC_012029	TCG	2	6	523136	523141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13039	NC_012029	CGG	2	6	523151	523156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478938
13040	NC_012029	CG	3	6	523221	523226	0 %	0 %	50 %	50 %	222478938
13041	NC_012029	CGT	2	6	523272	523277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13042	NC_012029	GTC	2	6	523401	523406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13043	NC_012029	CGA	2	6	523437	523442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13044	NC_012029	TCG	2	6	523499	523504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13045	NC_012029	GAT	2	6	523572	523577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478938
13046	NC_012029	CGT	3	9	523578	523586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478938
13047	NC_012029	GC	3	6	523595	523600	0 %	0 %	50 %	50 %	222478938
13048	NC_012029	CGG	2	6	523613	523618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478938
13049	NC_012029	GCC	2	6	523627	523632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478938
13050	NC_012029	CCG	2	6	523655	523660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478938
13051	NC_012029	GCG	2	6	523715	523720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478938
13052	NC_012029	GTG	2	6	523780	523785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478938
13053	NC_012029	GAG	2	6	523834	523839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478938
13054	NC_012029	GGTGA	2	10	523878	523887	20 %	20 %	60 %	0 %	222478939
13055	NC_012029	CTCG	2	8	523919	523926	0 %	25 %	25 %	50 %	222478939
13056	NC_012029	TCG	2	6	523945	523950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13057	NC_012029	CTC	2	6	523962	523967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478939
13058	NC_012029	GCT	2	6	524018	524023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13059	NC_012029	TCG	2	6	524041	524046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13060	NC_012029	CGG	2	6	524086	524091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478939
13061	NC_012029	CGG	3	9	524117	524125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478939
13062	NC_012029	TCG	2	6	524128	524133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13063	NC_012029	TCG	2	6	524167	524172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13064	NC_012029	TCG	3	9	524212	524220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13065	NC_012029	TGG	2	6	524290	524295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478939
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13070	NC_012029	TCG	2	6	524473	524478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13071	NC_012029	GTC	2	6	524481	524486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
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13074	NC_012029	GCG	2	6	524613	524618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478939
13075	NC_012029	CGG	2	6	524627	524632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478939
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13078	NC_012029	CGG	2	6	524672	524677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478939
13079	NC_012029	TGC	2	6	524701	524706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
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13082	NC_012029	TCG	2	6	524776	524781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
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13085	NC_012029	TCG	3	9	524830	524838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13086	NC_012029	G	6	6	524845	524850	0 %	0 %	100 %	0 %	222478939
13087	NC_012029	TCG	2	6	524938	524943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
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13089	NC_012029	TCGT	2	8	524979	524986	0 %	50 %	25 %	25 %	222478939
13090	NC_012029	TCT	2	6	525007	525012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478939
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13093	NC_012029	GCT	2	6	525113	525118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13094	NC_012029	GGACTG	2	12	525120	525131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222478939
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13098	NC_012029	CGGT	2	8	525237	525244	0 %	25 %	50 %	25 %	222478939
13099	NC_012029	GAC	2	6	525249	525254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13100	NC_012029	CGA	2	6	525258	525263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13101	NC_012029	GAC	2	6	525296	525301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13102	NC_012029	GAA	2	6	525302	525307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478939
13103	NC_012029	CGT	2	6	525308	525313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13104	NC_012029	CGGG	2	8	525362	525369	0 %	0 %	75 %	25 %	222478939
13105	NC_012029	CGC	2	6	525385	525390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478939
13106	NC_012029	TCA	2	6	525391	525396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478939
13107	NC_012029	GGC	2	6	525404	525409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478939
13108	NC_012029	GC	3	6	525424	525429	0 %	0 %	50 %	50 %	222478939
13109	NC_012029	CGATGC	2	12	525457	525468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13110	NC_012029	GTC	2	6	525516	525521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13111	NC_012029	CGGC	2	8	525523	525530	0 %	0 %	50 %	50 %	222478939
13112	NC_012029	GCT	2	6	525539	525544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
13113	NC_012029	ATC	2	6	525546	525551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478939
13114	NC_012029	GAACG	2	10	525563	525572	40 %	0 %	40 %	20 %	222478939
13115	NC_012029	CTG	2	6	525579	525584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478939
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13117	NC_012029	TCA	2	6	525641	525646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478940
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13121	NC_012029	CGA	2	6	525750	525755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478940
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13234	NC_012029	CG	3	6	529967	529972	0 %	0 %	50 %	50 %	222478943
13235	NC_012029	CGA	2	6	529995	530000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478943
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13238	NC_012029	GAC	3	9	530110	530118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478943
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13240	NC_012029	CGGT	2	8	530174	530181	0 %	25 %	50 %	25 %	222478943
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13470	NC_012029	CGA	2	6	537807	537812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478951
13471	NC_012029	CGCGA	2	10	537842	537851	20 %	0 %	40 %	40 %	222478951
13472	NC_012029	CGT	2	6	537858	537863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478951
13473	NC_012029	CGG	2	6	537888	537893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478951
13474	NC_012029	CGA	2	6	537900	537905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478951
13475	NC_012029	CGC	2	6	537952	537957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478951
13476	NC_012029	CG	3	6	538006	538011	0 %	0 %	50 %	50 %	222478951
13477	NC_012029	GCTC	2	8	538035	538042	0 %	25 %	25 %	50 %	222478951
13478	NC_012029	GC	3	6	538043	538048	0 %	0 %	50 %	50 %	222478951
13479	NC_012029	GGT	2	6	538050	538055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478951
13480	NC_012029	ACGTCG	2	12	538136	538147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478951
13481	NC_012029	AGC	2	6	538187	538192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478951
13482	NC_012029	CG	3	6	538194	538199	0 %	0 %	50 %	50 %	222478951
13483	NC_012029	CGA	2	6	538221	538226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478951
13484	NC_012029	CCGGC	2	10	538241	538250	0 %	0 %	40 %	60 %	222478951
13485	NC_012029	C	6	6	538285	538290	0 %	0 %	0 %	100 %	222478951
13486	NC_012029	CGG	2	6	538355	538360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478952
13487	NC_012029	CGT	2	6	538364	538369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478952
13488	NC_012029	TCG	2	6	538405	538410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478952
13489	NC_012029	GCC	2	6	538537	538542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478952
13490	NC_012029	CGT	2	6	538547	538552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478952
13491	NC_012029	CGA	2	6	538559	538564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478952
13492	NC_012029	CGT	2	6	538695	538700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478952
13493	NC_012029	CGCTCG	2	12	538803	538814	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478953
13494	NC_012029	GACCC	2	10	538829	538838	20 %	0 %	20 %	60 %	222478953
13495	NC_012029	CGG	2	6	538853	538858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478953
13496	NC_012029	GAG	2	6	538919	538924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478953
13497	NC_012029	GT	3	6	538936	538941	0 %	50 %	50 %	0 %	222478953
13498	NC_012029	CGG	2	6	538990	538995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478953
13499	NC_012029	GAG	2	6	539024	539029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478953
13500	NC_012029	CGT	2	6	539131	539136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478953

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