MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_012029	CGA	2	6	403122	403127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478819
10003	NC_012029	GTC	2	6	403150	403155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478819
10004	NC_012029	ACG	2	6	403160	403165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478819
10005	NC_012029	CGA	2	6	403173	403178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478819
10006	NC_012029	CTC	2	6	403246	403251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478819
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10008	NC_012029	GC	3	6	403359	403364	0 %	0 %	50 %	50 %	222478819
10009	NC_012029	CGCT	2	8	403710	403717	0 %	25 %	25 %	50 %	222478820
10010	NC_012029	CGC	2	6	403762	403767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478820
10011	NC_012029	GAG	2	6	403787	403792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478820
10012	NC_012029	CGCCCG	2	12	403805	403816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478820
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10015	NC_012029	GTC	2	6	403920	403925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478820
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10017	NC_012029	CG	3	6	403949	403954	0 %	0 %	50 %	50 %	222478820
10018	NC_012029	TCG	2	6	403998	404003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478820
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10020	NC_012029	GCG	2	6	404046	404051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478820
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10022	NC_012029	GAT	2	6	404111	404116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478820
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10051	NC_012029	CGA	2	6	405246	405251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478821
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10118	NC_012029	TCC	2	6	407678	407683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478824
10119	NC_012029	GCTTCC	2	12	407684	407695	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222478824
10120	NC_012029	GCC	2	6	407705	407710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478824
10121	NC_012029	CCG	2	6	407714	407719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478824
10122	NC_012029	CCGT	2	8	407782	407789	0 %	25 %	25 %	50 %	222478824
10123	NC_012029	CGC	2	6	407808	407813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478824
10124	NC_012029	TCG	2	6	407828	407833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478824
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10131	NC_012029	TCC	2	6	408116	408121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478824
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10233	NC_012029	ACG	2	6	412052	412057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478828
10234	NC_012029	GGTCG	2	10	412124	412133	0 %	20 %	60 %	20 %	222478828
10235	NC_012029	TCG	2	6	412151	412156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
10236	NC_012029	GAC	2	6	412180	412185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478828
10237	NC_012029	TCC	2	6	412205	412210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478828
10238	NC_012029	CGC	2	6	412215	412220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478828
10239	NC_012029	TCG	2	6	412229	412234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
10240	NC_012029	GTC	2	6	412243	412248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
10241	NC_012029	CGC	2	6	412311	412316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478828
10242	NC_012029	CGG	2	6	412326	412331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478828
10243	NC_012029	GA	4	8	412384	412391	50 %	0 %	50 %	0 %	222478828
10244	NC_012029	GTC	2	6	412431	412436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
10245	NC_012029	CGG	2	6	412523	412528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478829
10246	NC_012029	GTC	2	6	412557	412562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
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10250	NC_012029	GTC	2	6	412608	412613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10251	NC_012029	CGA	2	6	412619	412624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10252	NC_012029	TCC	2	6	412645	412650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478829
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10255	NC_012029	GAC	2	6	412743	412748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10256	NC_012029	TCG	2	6	412759	412764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10257	NC_012029	CGAG	2	8	412768	412775	25 %	0 %	50 %	25 %	222478829
10258	NC_012029	CGTC	2	8	412805	412812	0 %	25 %	25 %	50 %	222478829
10259	NC_012029	TCG	2	6	412855	412860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10260	NC_012029	TCG	2	6	412894	412899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
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10262	NC_012029	CGA	2	6	412922	412927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10263	NC_012029	CG	3	6	412959	412964	0 %	0 %	50 %	50 %	222478829
10264	NC_012029	CGG	2	6	413014	413019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478829
10265	NC_012029	GTC	2	6	413024	413029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10266	NC_012029	CGT	2	6	413048	413053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10267	NC_012029	CGA	2	6	413054	413059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10268	NC_012029	TCG	2	6	413065	413070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
10269	NC_012029	GCAG	2	8	413087	413094	25 %	0 %	50 %	25 %	222478829
10270	NC_012029	AGC	2	6	413101	413106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
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10272	NC_012029	AGT	2	6	413138	413143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478829
10273	NC_012029	GTGACG	2	12	413155	413166	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222478829
10274	NC_012029	CGG	3	9	413174	413182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478829
10275	NC_012029	GAC	2	6	413220	413225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
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10277	NC_012029	TCG	2	6	413254	413259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
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10279	NC_012029	TCG	2	6	413374	413379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
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10281	NC_012029	TCG	3	9	413677	413685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478830
10282	NC_012029	GC	3	6	413686	413691	0 %	0 %	50 %	50 %	222478830
10283	NC_012029	TCC	2	6	413701	413706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478830
10284	NC_012029	GCTG	2	8	413807	413814	0 %	25 %	50 %	25 %	222478830
10285	NC_012029	GCT	2	6	413825	413830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478830
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10287	NC_012029	CGG	2	6	413884	413889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478830
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10289	NC_012029	CGG	2	6	413929	413934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478831
10290	NC_012029	AGG	2	6	413938	413943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478831
10291	NC_012029	TCG	2	6	413952	413957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478831
10292	NC_012029	TCG	2	6	414027	414032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478831
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10300	NC_012029	CGC	2	6	414603	414608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478832
10301	NC_012029	CGC	2	6	414651	414656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478832
10302	NC_012029	GTGCTG	2	12	414670	414681	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222478832
10303	NC_012029	GAT	2	6	414717	414722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478832
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10305	NC_012029	TGG	2	6	414827	414832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478832
10306	NC_012029	GAC	2	6	414845	414850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478833
10307	NC_012029	GTC	2	6	414860	414865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478833
10308	NC_012029	TCGA	2	8	414870	414877	25 %	25 %	25 %	25 %	222478833
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10312	NC_012029	GA	3	6	415020	415025	50 %	0 %	50 %	0 %	222478833
10313	NC_012029	ATC	2	6	415070	415075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478833
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10321	NC_012029	CGG	2	6	415510	415515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478833
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10330	NC_012029	CGT	2	6	415993	415998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478833
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10332	NC_012029	CGA	2	6	416161	416166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478833
10333	NC_012029	CGGG	2	8	416250	416257	0 %	0 %	75 %	25 %	222478833
10334	NC_012029	TC	3	6	416287	416292	0 %	50 %	0 %	50 %	222478833
10335	NC_012029	CGA	2	6	416317	416322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478833
10336	NC_012029	GC	3	6	416356	416361	0 %	0 %	50 %	50 %	222478833
10337	NC_012029	GAC	2	6	416362	416367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478833
10338	NC_012029	CCG	2	6	416374	416379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478833
10339	NC_012029	ACG	2	6	416394	416399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478833
10340	NC_012029	GATC	2	8	416434	416441	25 %	25 %	25 %	25 %	222478833
10341	NC_012029	CACGC	2	10	416492	416501	20 %	0 %	20 %	60 %	222478833
10342	NC_012029	CGC	3	9	416499	416507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478833
10343	NC_012029	CGACG	2	10	416561	416570	20 %	0 %	40 %	40 %	222478833
10344	NC_012029	CAA	2	6	416593	416598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478833
10345	NC_012029	TAC	3	9	416642	416650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478833
10346	NC_012029	GCGTC	2	10	416958	416967	0 %	20 %	40 %	40 %	222478834
10347	NC_012029	ACG	2	6	416969	416974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478834
10348	NC_012029	GAC	2	6	416989	416994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478834
10349	NC_012029	GAG	2	6	417005	417010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478834
10350	NC_012029	GAC	2	6	417047	417052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478834
10351	NC_012029	CGCT	2	8	417152	417159	0 %	25 %	25 %	50 %	222478834
10352	NC_012029	TCC	3	9	417201	417209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478834
10353	NC_012029	CGG	2	6	417216	417221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478834
10354	NC_012029	CGAC	2	8	417314	417321	25 %	0 %	25 %	50 %	222478834
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10358	NC_012029	CTCG	2	8	417440	417447	0 %	25 %	25 %	50 %	222478834
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10472	NC_012029	CGA	2	6	421001	421006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478838
10473	NC_012029	TCC	2	6	421024	421029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478838
10474	NC_012029	GC	3	6	421048	421053	0 %	0 %	50 %	50 %	222478838
10475	NC_012029	TGAG	2	8	421060	421067	25 %	25 %	50 %	0 %	222478838
10476	NC_012029	GAG	2	6	421102	421107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478838
10477	NC_012029	GGC	2	6	421112	421117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478838
10478	NC_012029	CG	3	6	421119	421124	0 %	0 %	50 %	50 %	222478838
10479	NC_012029	TCGG	2	8	421152	421159	0 %	25 %	50 %	25 %	222478838
10480	NC_012029	GGC	2	6	421200	421205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478838
10481	NC_012029	GAC	2	6	421254	421259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478838
10482	NC_012029	GGGGA	2	10	421269	421278	20 %	0 %	80 %	0 %	222478838
10483	NC_012029	CTC	2	6	421308	421313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478838
10484	NC_012029	GAG	2	6	421323	421328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478838
10485	NC_012029	CGC	2	6	421329	421334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478838
10486	NC_012029	CGG	2	6	421344	421349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478838
10487	NC_012029	ACG	2	6	421375	421380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478838
10488	NC_012029	TCG	2	6	421426	421431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478838
10489	NC_012029	CGA	2	6	421589	421594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478838
10490	NC_012029	TCGC	2	8	421614	421621	0 %	25 %	25 %	50 %	222478838
10491	NC_012029	TGC	2	6	421666	421671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478838
10492	NC_012029	TCA	2	6	421889	421894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478839
10493	NC_012029	CGG	2	6	421915	421920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478839
10494	NC_012029	ACG	2	6	421937	421942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478839
10495	NC_012029	GAG	2	6	421945	421950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478839
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10497	NC_012029	GGC	2	6	421978	421983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478839
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10499	NC_012029	CGG	2	6	422192	422197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478840
10500	NC_012029	CGC	2	6	422233	422238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478840

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