MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012029	TCAC	2	8	261650	261657	25 %	25 %	0 %	50 %	222478681
6502	NC_012029	CGT	2	6	261666	261671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6503	NC_012029	TCG	2	6	261716	261721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6504	NC_012029	CGTACA	2	12	261764	261775	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222478681
6505	NC_012029	CTC	2	6	261778	261783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478681
6506	NC_012029	TCCC	2	8	261787	261794	0 %	25 %	0 %	75 %	222478681
6507	NC_012029	GAG	2	6	261799	261804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478681
6508	NC_012029	CGC	2	6	261875	261880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478681
6509	NC_012029	GAG	2	6	261898	261903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478681
6510	NC_012029	GCG	2	6	261911	261916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478681
6511	NC_012029	CAT	2	6	261969	261974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478681
6512	NC_012029	CGA	2	6	262002	262007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6513	NC_012029	TCG	2	6	262049	262054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6514	NC_012029	TAC	2	6	262075	262080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478681
6515	NC_012029	CGA	2	6	262119	262124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6516	NC_012029	TCG	2	6	262187	262192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6517	NC_012029	ACCG	2	8	262248	262255	25 %	0 %	25 %	50 %	222478681
6518	NC_012029	GTG	2	6	262264	262269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478681
6519	NC_012029	GACC	2	8	262278	262285	25 %	0 %	25 %	50 %	222478681
6520	NC_012029	AGC	2	6	262316	262321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6521	NC_012029	GAA	2	6	262323	262328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478681
6522	NC_012029	GAT	2	6	262335	262340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478681
6523	NC_012029	CTC	2	6	262356	262361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478681
6524	NC_012029	CCGAGG	2	12	262448	262459	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478681
6525	NC_012029	CGA	3	9	262503	262511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6526	NC_012029	CGT	2	6	262521	262526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6527	NC_012029	GCG	2	6	262538	262543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478681
6528	NC_012029	ACCG	2	8	262687	262694	25 %	0 %	25 %	50 %	222478681
6529	NC_012029	GGC	3	9	262700	262708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478681
6530	NC_012029	CTG	2	6	262723	262728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6531	NC_012029	CGG	2	6	262782	262787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478681
6532	NC_012029	CCAGCG	2	12	262788	262799	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478681
6533	NC_012029	TCG	2	6	262841	262846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6534	NC_012029	CGA	2	6	262848	262853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6535	NC_012029	GGA	2	6	262905	262910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478681
6536	NC_012029	TC	3	6	262956	262961	0 %	50 %	0 %	50 %	222478681
6537	NC_012029	GGT	2	6	262962	262967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478681
6538	NC_012029	TCG	2	6	263012	263017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6539	NC_012029	GGC	2	6	263022	263027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478681
6540	NC_012029	CGA	2	6	263031	263036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6541	NC_012029	CGA	2	6	263115	263120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6542	NC_012029	C	7	7	263205	263211	0 %	0 %	0 %	100 %	222478681
6543	NC_012029	TGA	2	6	263249	263254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478681
6544	NC_012029	TCGA	2	8	263270	263277	25 %	25 %	25 %	25 %	222478681
6545	NC_012029	GGC	2	6	263307	263312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478681
6546	NC_012029	CGA	2	6	263313	263318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6547	NC_012029	CGG	2	6	263343	263348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478681
6548	NC_012029	CGGA	2	8	263435	263442	25 %	0 %	50 %	25 %	222478681
6549	NC_012029	GTC	2	6	263455	263460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478681
6550	NC_012029	GAG	2	6	263497	263502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478681
6551	NC_012029	GAG	2	6	263518	263523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478681
6552	NC_012029	GAG	2	6	263548	263553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478681
6553	NC_012029	GACT	2	8	263599	263606	25 %	25 %	25 %	25 %	222478681
6554	NC_012029	CGA	2	6	263756	263761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6555	NC_012029	GCC	2	6	263790	263795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478682
6556	NC_012029	CGGT	2	8	263812	263819	0 %	25 %	50 %	25 %	222478682
6557	NC_012029	ACG	2	6	263839	263844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6558	NC_012029	CGG	2	6	263921	263926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478682
6559	NC_012029	CGA	2	6	263927	263932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6560	NC_012029	CCT	2	6	263939	263944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478682
6561	NC_012029	GCG	2	6	263998	264003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478682
6562	NC_012029	TCA	2	6	264040	264045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478682
6563	NC_012029	ACT	2	6	264091	264096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478682
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6565	NC_012029	GAG	2	6	264156	264161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478682
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6567	NC_012029	TCG	2	6	264199	264204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6568	NC_012029	GAGTAC	2	12	264210	264221	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222478682
6569	NC_012029	CGA	2	6	264230	264235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6570	NC_012029	CGA	2	6	264278	264283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6571	NC_012029	GCC	2	6	264387	264392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478682
6572	NC_012029	GAG	2	6	264396	264401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478682
6573	NC_012029	CGA	2	6	264461	264466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6574	NC_012029	ACG	2	6	264496	264501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6575	NC_012029	ACT	2	6	264502	264507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478682
6576	NC_012029	CGA	2	6	264527	264532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6577	NC_012029	TCGC	2	8	264576	264583	0 %	25 %	25 %	50 %	222478682
6578	NC_012029	GC	3	6	264616	264621	0 %	0 %	50 %	50 %	222478682
6579	NC_012029	TCC	2	6	264624	264629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478682
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6583	NC_012029	CCG	2	6	264731	264736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478682
6584	NC_012029	CGTC	2	8	264737	264744	0 %	25 %	25 %	50 %	222478682
6585	NC_012029	GCCA	2	8	264813	264820	25 %	0 %	25 %	50 %	222478682
6586	NC_012029	GCC	2	6	264827	264832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478682
6587	NC_012029	ACG	2	6	264850	264855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6588	NC_012029	CCGTAC	2	12	264864	264875	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222478682
6589	NC_012029	CTG	2	6	264897	264902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6590	NC_012029	CGC	2	6	264976	264981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478682
6591	NC_012029	CAG	2	6	265044	265049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
6592	NC_012029	GCC	2	6	265084	265089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478682
6593	NC_012029	ACG	2	6	265090	265095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
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6599	NC_012029	AG	3	6	265301	265306	50 %	0 %	50 %	0 %	222478682
6600	NC_012029	CG	3	6	265311	265316	0 %	0 %	50 %	50 %	222478682
6601	NC_012029	ACG	2	6	265348	265353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478682
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6604	NC_012029	AGT	2	6	265468	265473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478682
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6608	NC_012029	CG	3	6	265718	265723	0 %	0 %	50 %	50 %	222478683
6609	NC_012029	TCA	2	6	265747	265752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478683
6610	NC_012029	CGTC	2	8	265762	265769	0 %	25 %	25 %	50 %	222478683
6611	NC_012029	ACCAC	2	10	265894	265903	40 %	0 %	0 %	60 %	222478683
6612	NC_012029	GC	3	6	265912	265917	0 %	0 %	50 %	50 %	222478683
6613	NC_012029	TCT	2	6	265939	265944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478683
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6615	NC_012029	GCGG	2	8	266002	266009	0 %	0 %	75 %	25 %	222478683
6616	NC_012029	TCG	2	6	266013	266018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478683
6617	NC_012029	GCT	2	6	266069	266074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478683
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6976	NC_012029	CG	3	6	280267	280272	0 %	0 %	50 %	50 %	222478697
6977	NC_012029	GTC	2	6	280283	280288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478697
6978	NC_012029	AGC	2	6	280302	280307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478697
6979	NC_012029	TCG	2	6	280329	280334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478697
6980	NC_012029	GCCG	2	8	280346	280353	0 %	0 %	50 %	50 %	222478697
6981	NC_012029	ACG	2	6	280401	280406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478697
6982	NC_012029	CGA	2	6	280432	280437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478697
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6984	NC_012029	CGC	2	6	280537	280542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478697
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6988	NC_012029	TCG	2	6	280668	280673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478697
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6994	NC_012029	CG	3	6	280814	280819	0 %	0 %	50 %	50 %	222478697
6995	NC_012029	TCG	2	6	280839	280844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478697
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