MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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68002	NC_012029	GCG	2	6	2722655	2722660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481135
68003	NC_012029	CG	3	6	2722659	2722664	0 %	0 %	50 %	50 %	222481135
68004	NC_012029	CGATCG	2	12	2722666	2722677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481135
68005	NC_012029	TCG	2	6	2722684	2722689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481135
68006	NC_012029	ACG	2	6	2722707	2722712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481135
68007	NC_012029	CTT	2	6	2722808	2722813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481135
68008	NC_012029	CGT	2	6	2722826	2722831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481135
68009	NC_012029	CGT	2	6	2722913	2722918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481135
68010	NC_012029	GAT	2	6	2722931	2722936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481135
68011	NC_012029	CTGG	2	8	2722949	2722956	0 %	25 %	50 %	25 %	222481135
68012	NC_012029	CGT	2	6	2722969	2722974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481135
68013	NC_012029	CGG	2	6	2722985	2722990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481135
68014	NC_012029	CGT	2	6	2723012	2723017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481135
68015	NC_012029	CGG	3	9	2723036	2723044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481135
68016	NC_012029	CGC	2	6	2723059	2723064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481135
68017	NC_012029	CGC	2	6	2723075	2723080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481135
68018	NC_012029	CT	3	6	2723148	2723153	0 %	50 %	0 %	50 %	222481135
68019	NC_012029	GAG	2	6	2723196	2723201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481135
68020	NC_012029	CTT	2	6	2723207	2723212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481135
68021	NC_012029	CGGC	2	8	2723218	2723225	0 %	0 %	50 %	50 %	222481135
68022	NC_012029	TGA	2	6	2723227	2723232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481135
68023	NC_012029	CGC	2	6	2723280	2723285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481135
68024	NC_012029	CGAC	2	8	2723289	2723296	25 %	0 %	25 %	50 %	222481135
68025	NC_012029	CGG	2	6	2723378	2723383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481136
68026	NC_012029	ACG	2	6	2723395	2723400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481136
68027	NC_012029	CGA	2	6	2723412	2723417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481136
68028	NC_012029	CGG	2	6	2723429	2723434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481136
68029	NC_012029	GGT	2	6	2723441	2723446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481136
68030	NC_012029	CGC	2	6	2723472	2723477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481136
68031	NC_012029	GCT	2	6	2723478	2723483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481136
68032	NC_012029	ACC	2	6	2723582	2723587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481136
68033	NC_012029	GCGG	2	8	2723598	2723605	0 %	0 %	75 %	25 %	222481136
68034	NC_012029	CGG	2	6	2723623	2723628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481136
68035	NC_012029	GTC	2	6	2723638	2723643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481136
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68037	NC_012029	GTC	2	6	2723674	2723679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481136
68038	NC_012029	GCG	2	6	2723680	2723685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481136
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68041	NC_012029	CGG	2	6	2723801	2723806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481136
68042	NC_012029	GCTG	2	8	2723810	2723817	0 %	25 %	50 %	25 %	222481136
68043	NC_012029	TCG	2	6	2723822	2723827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481136
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68047	NC_012029	TCG	3	9	2723912	2723920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481136
68048	NC_012029	GACCGC	2	12	2723928	2723939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222481136
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68050	NC_012029	TCG	2	6	2723996	2724001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481136
68051	NC_012029	GTCG	2	8	2724012	2724019	0 %	25 %	50 %	25 %	222481136
68052	NC_012029	GGCT	2	8	2724061	2724068	0 %	25 %	50 %	25 %	222481136
68053	NC_012029	CGC	2	6	2724114	2724119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481136
68054	NC_012029	GTCG	2	8	2724172	2724179	0 %	25 %	50 %	25 %	222481136
68055	NC_012029	TCG	2	6	2724188	2724193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481136
68056	NC_012029	CGG	2	6	2724203	2724208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481136
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68059	NC_012029	TCG	2	6	2724287	2724292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481136
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68061	NC_012029	TCGCC	2	10	2724329	2724338	0 %	20 %	20 %	60 %	222481136
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68088	NC_012029	GAC	2	6	2725314	2725319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481138
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68095	NC_012029	GC	3	6	2725569	2725574	0 %	0 %	50 %	50 %	222481139
68096	NC_012029	CGC	3	9	2725572	2725580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481139
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68099	NC_012029	CGCC	2	8	2725635	2725642	0 %	0 %	25 %	75 %	222481139
68100	NC_012029	CGGTCG	2	12	2725690	2725701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222481139
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68102	NC_012029	GTC	2	6	2725755	2725760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481139
68103	NC_012029	GCCG	2	8	2725839	2725846	0 %	0 %	50 %	50 %	222481139
68104	NC_012029	GCG	2	6	2725865	2725870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481139
68105	NC_012029	GTC	2	6	2725875	2725880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481139
68106	NC_012029	CGT	2	6	2725889	2725894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481139
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68109	NC_012029	TCG	2	6	2726002	2726007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481139
68110	NC_012029	GGTCG	2	10	2726031	2726040	0 %	20 %	60 %	20 %	222481139
68111	NC_012029	TCG	2	6	2726071	2726076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481139
68112	NC_012029	G	6	6	2726100	2726105	0 %	0 %	100 %	0 %	222481139
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68114	NC_012029	CGT	2	6	2726231	2726236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481139
68115	NC_012029	CGA	2	6	2726237	2726242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481139
68116	NC_012029	TCG	2	6	2726254	2726259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481139
68117	NC_012029	CG	3	6	2726258	2726263	0 %	0 %	50 %	50 %	222481139
68118	NC_012029	CGT	2	6	2726285	2726290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481139
68119	NC_012029	CGA	2	6	2726302	2726307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481139
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68153	NC_012029	CCCG	2	8	2727869	2727876	0 %	0 %	25 %	75 %	222481141
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68212	NC_012029	CGA	2	6	2729885	2729890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481144
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68215	NC_012029	GAGG	2	8	2730019	2730026	25 %	0 %	75 %	0 %	222481144
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68217	NC_012029	CGCGGT	2	12	2730110	2730121	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222481145
68218	NC_012029	CGC	2	6	2730123	2730128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481145
68219	NC_012029	GCAG	2	8	2730151	2730158	25 %	0 %	50 %	25 %	222481145
68220	NC_012029	CCG	2	6	2730176	2730181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481145
68221	NC_012029	GCC	2	6	2730251	2730256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481145
68222	NC_012029	CTCCC	2	10	2730307	2730316	0 %	20 %	0 %	80 %	222481145
68223	NC_012029	GTCGGG	2	12	2730423	2730434	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222481145
68224	NC_012029	GGA	2	6	2730482	2730487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481145
68225	NC_012029	GTC	2	6	2730516	2730521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481145
68226	NC_012029	AACC	2	8	2730558	2730565	50 %	0 %	0 %	50 %	222481145
68227	NC_012029	GTC	2	6	2730591	2730596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481145
68228	NC_012029	GAC	2	6	2730657	2730662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481145
68229	NC_012029	TCG	2	6	2730730	2730735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481145
68230	NC_012029	ACG	2	6	2730755	2730760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481145
68231	NC_012029	TCC	2	6	2730793	2730798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481145
68232	NC_012029	GCG	2	6	2730799	2730804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481145
68233	NC_012029	GGAG	2	8	2730808	2730815	25 %	0 %	75 %	0 %	222481145
68234	NC_012029	CGTCGA	2	12	2730830	2730841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481145
68235	NC_012029	GTC	3	9	2730885	2730893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481145
68236	NC_012029	GTA	2	6	2731109	2731114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481146
68237	NC_012029	GGCGAC	2	12	2731155	2731166	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222481146
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68240	NC_012029	CGA	2	6	2731332	2731337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481146
68241	NC_012029	GAG	2	6	2731360	2731365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481146
68242	NC_012029	CGG	2	6	2731369	2731374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481146
68243	NC_012029	CG	3	6	2731377	2731382	0 %	0 %	50 %	50 %	222481146
68244	NC_012029	GGGA	2	8	2731385	2731392	25 %	0 %	75 %	0 %	222481146
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68254	NC_012029	CGA	2	6	2731800	2731805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481147
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68301	NC_012029	TCG	2	6	2733770	2733775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481148
68302	NC_012029	TCG	2	6	2733785	2733790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481148
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68322	NC_012029	GACG	2	8	2734736	2734743	25 %	0 %	50 %	25 %	222481150
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68325	NC_012029	CGA	2	6	2734814	2734819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481150
68326	NC_012029	GC	3	6	2734872	2734877	0 %	0 %	50 %	50 %	222481150
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68328	NC_012029	TCG	2	6	2735005	2735010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481150

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