MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_012029	GAG	2	6	2609821	2609826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481030
65002	NC_012029	GTC	2	6	2609866	2609871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481030
65003	NC_012029	ATCGCG	2	12	2609888	2609899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481030
65004	NC_012029	CGG	2	6	2609958	2609963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481030
65005	NC_012029	TCA	2	6	2610015	2610020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481030
65006	NC_012029	CAT	2	6	2610025	2610030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481030
65007	NC_012029	GCC	2	6	2610046	2610051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481030
65008	NC_012029	CCG	2	6	2610059	2610064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481030
65009	NC_012029	TCG	2	6	2610105	2610110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481030
65010	NC_012029	TTC	2	6	2610334	2610339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481031
65011	NC_012029	GAG	2	6	2610346	2610351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481031
65012	NC_012029	GTC	2	6	2610502	2610507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65013	NC_012029	CCA	2	6	2610522	2610527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481031
65014	NC_012029	TCG	2	6	2610542	2610547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65015	NC_012029	CG	3	6	2610556	2610561	0 %	0 %	50 %	50 %	222481031
65016	NC_012029	CG	3	6	2610583	2610588	0 %	0 %	50 %	50 %	222481031
65017	NC_012029	GTC	2	6	2610606	2610611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65018	NC_012029	ACC	2	6	2610661	2610666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481031
65019	NC_012029	TGG	2	6	2610674	2610679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481031
65020	NC_012029	GCT	2	6	2610723	2610728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65021	NC_012029	GGC	2	6	2610756	2610761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481031
65022	NC_012029	CGA	2	6	2610792	2610797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65023	NC_012029	CGA	2	6	2610813	2610818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65024	NC_012029	ACG	2	6	2610821	2610826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65025	NC_012029	TCG	2	6	2610860	2610865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65026	NC_012029	CGA	2	6	2610873	2610878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65027	NC_012029	TTC	2	6	2610880	2610885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481031
65028	NC_012029	GTACGC	2	12	2610924	2610935	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65029	NC_012029	GCT	2	6	2610963	2610968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65030	NC_012029	AGG	2	6	2610971	2610976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481031
65031	NC_012029	TGG	2	6	2610995	2611000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481031
65032	NC_012029	ACC	3	9	2611010	2611018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481031
65033	NC_012029	TTC	2	6	2611045	2611050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481031
65034	NC_012029	CGA	2	6	2611092	2611097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65035	NC_012029	CGC	2	6	2611116	2611121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481031
65036	NC_012029	CGC	2	6	2611164	2611169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481031
65037	NC_012029	CGA	2	6	2611173	2611178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65038	NC_012029	CGA	2	6	2611191	2611196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65039	NC_012029	CGT	2	6	2611221	2611226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65040	NC_012029	CG	3	6	2611228	2611233	0 %	0 %	50 %	50 %	222481031
65041	NC_012029	CG	3	6	2611256	2611261	0 %	0 %	50 %	50 %	222481031
65042	NC_012029	GGA	2	6	2611308	2611313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481031
65043	NC_012029	ACG	2	6	2611328	2611333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65044	NC_012029	CCG	2	6	2611335	2611340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481031
65045	NC_012029	GAC	2	6	2611342	2611347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65046	NC_012029	TCC	2	6	2611361	2611366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481031
65047	NC_012029	AGGGGA	2	12	2611376	2611387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481031
65048	NC_012029	CGA	2	6	2611431	2611436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65049	NC_012029	GCC	2	6	2611501	2611506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481031
65050	NC_012029	TGGA	2	8	2611522	2611529	25 %	25 %	50 %	0 %	222481031
65051	NC_012029	GTC	2	6	2611558	2611563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65052	NC_012029	GAG	2	6	2611588	2611593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481031
65053	NC_012029	CG	3	6	2611603	2611608	0 %	0 %	50 %	50 %	222481031
65054	NC_012029	CGA	2	6	2611653	2611658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65055	NC_012029	CGC	2	6	2611662	2611667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481031
65056	NC_012029	TGA	2	6	2611676	2611681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481031
65057	NC_012029	GGA	2	6	2611728	2611733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481031
65058	NC_012029	TCGC	2	8	2611741	2611748	0 %	25 %	25 %	50 %	222481031
65059	NC_012029	GGGAT	2	10	2611753	2611762	20 %	20 %	60 %	0 %	222481031
65060	NC_012029	GAG	2	6	2611768	2611773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481031
65061	NC_012029	GACG	2	8	2611778	2611785	25 %	0 %	50 %	25 %	222481031
65062	NC_012029	GCT	2	6	2611857	2611862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65063	NC_012029	CTT	2	6	2611902	2611907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481031
65064	NC_012029	GCCGAG	2	12	2611918	2611929	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222481031
65065	NC_012029	CTA	2	6	2611932	2611937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481031
65066	NC_012029	CGAGGA	2	12	2611989	2612000	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222481031
65067	NC_012029	TCG	2	6	2612018	2612023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65068	NC_012029	CGA	2	6	2612028	2612033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65069	NC_012029	CCTC	2	8	2612048	2612055	0 %	25 %	0 %	75 %	222481031
65070	NC_012029	CGA	2	6	2612091	2612096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65071	NC_012029	GGTCGT	2	12	2612106	2612117	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222481031
65072	NC_012029	TCGGA	2	10	2612140	2612149	20 %	20 %	40 %	20 %	222481031
65073	NC_012029	CGACCG	2	12	2612187	2612198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222481031
65074	NC_012029	CGA	2	6	2612237	2612242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
65075	NC_012029	GAC	2	6	2612287	2612292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
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65078	NC_012029	ACG	2	6	2612447	2612452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481031
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65081	NC_012029	GCCGC	2	10	2612529	2612538	0 %	0 %	40 %	60 %	222481032
65082	NC_012029	AGC	2	6	2612540	2612545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481032
65083	NC_012029	AGC	2	6	2612573	2612578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481032
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65086	NC_012029	CGA	2	6	2612661	2612666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481032
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65089	NC_012029	AG	3	6	2612751	2612756	50 %	0 %	50 %	0 %	222481032
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65098	NC_012029	CGAGCC	2	12	2613144	2613155	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222481033
65099	NC_012029	CGATCG	2	12	2613156	2613167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481033
65100	NC_012029	GTTGAG	2	12	2613169	2613180	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222481033
65101	NC_012029	ATCG	2	8	2613235	2613242	25 %	25 %	25 %	25 %	222481033
65102	NC_012029	TCG	2	6	2613263	2613268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481033
65103	NC_012029	AC	3	6	2613319	2613324	50 %	0 %	0 %	50 %	222481033
65104	NC_012029	CCGGA	2	10	2613332	2613341	20 %	0 %	40 %	40 %	222481033
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65109	NC_012029	CGAC	2	8	2613668	2613675	25 %	0 %	25 %	50 %	222481034
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65114	NC_012029	CGC	3	9	2613822	2613830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481034
65115	NC_012029	CGAC	2	8	2613905	2613912	25 %	0 %	25 %	50 %	222481034
65116	NC_012029	CGA	2	6	2613917	2613922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481034
65117	NC_012029	GGC	2	6	2613943	2613948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481034
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65119	NC_012029	CGA	2	6	2613981	2613986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481034
65120	NC_012029	GC	4	8	2614002	2614009	0 %	0 %	50 %	50 %	222481034
65121	NC_012029	CGGC	2	8	2614016	2614023	0 %	0 %	50 %	50 %	222481034
65122	NC_012029	CGA	2	6	2614029	2614034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481034
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65130	NC_012029	CGGCG	2	10	2614200	2614209	0 %	0 %	60 %	40 %	222481034
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65142	NC_012029	GC	4	8	2614582	2614589	0 %	0 %	50 %	50 %	222481034
65143	NC_012029	CGC	2	6	2614608	2614613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481034
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65145	NC_012029	CGA	2	6	2614920	2614925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481035
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65149	NC_012029	CCTC	2	8	2615206	2615213	0 %	25 %	0 %	75 %	222481035
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65222	NC_012029	ACG	2	6	2617710	2617715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481038
65223	NC_012029	CGTGGT	2	12	2617774	2617785	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222481038
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65226	NC_012029	TCG	2	6	2617830	2617835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481038
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65228	NC_012029	GC	3	6	2617908	2617913	0 %	0 %	50 %	50 %	222481038
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65230	NC_012029	TCG	2	6	2617959	2617964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481038
65231	NC_012029	GC	3	6	2617968	2617973	0 %	0 %	50 %	50 %	222481038
65232	NC_012029	CGG	2	6	2618004	2618009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481038
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65342	NC_012029	TCGA	2	8	2622737	2622744	25 %	25 %	25 %	25 %	222481043
65343	NC_012029	TCG	2	6	2622871	2622876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481044
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65346	NC_012029	GCC	2	6	2622932	2622937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481044
65347	NC_012029	TCG	2	6	2622990	2622995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481044
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65353	NC_012029	CGC	2	6	2623186	2623191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481044
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65458	NC_012029	GCAA	2	8	2626637	2626644	50 %	0 %	25 %	25 %	222481047
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