MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_012029	CCG	2	6	2215966	2215971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480640
55002	NC_012029	CG	3	6	2215970	2215975	0 %	0 %	50 %	50 %	222480640
55003	NC_012029	GGT	2	6	2216112	2216117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480640
55004	NC_012029	CGT	2	6	2216126	2216131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480640
55005	NC_012029	CGG	2	6	2216135	2216140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480640
55006	NC_012029	TCG	3	9	2216155	2216163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480640
55007	NC_012029	CGA	2	6	2216231	2216236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480640
55008	NC_012029	CCG	2	6	2216293	2216298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480640
55009	NC_012029	CTC	2	6	2216331	2216336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480640
55010	NC_012029	CTC	2	6	2216370	2216375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480640
55011	NC_012029	CTC	2	6	2216379	2216384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480640
55012	NC_012029	CGCT	2	8	2216419	2216426	0 %	25 %	25 %	50 %	222480640
55013	NC_012029	GAC	2	6	2216430	2216435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480640
55014	NC_012029	CGT	2	6	2216534	2216539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480640
55015	NC_012029	TCG	2	6	2216569	2216574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480640
55016	NC_012029	GCG	2	6	2216610	2216615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480640
55017	NC_012029	CGT	2	6	2216642	2216647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480640
55018	NC_012029	CGAC	2	8	2216660	2216667	25 %	0 %	25 %	50 %	222480640
55019	NC_012029	CAG	2	6	2216676	2216681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480640
55020	NC_012029	CGC	2	6	2216687	2216692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480640
55021	NC_012029	GTCG	2	8	2216726	2216733	0 %	25 %	50 %	25 %	222480640
55022	NC_012029	CCT	2	6	2216762	2216767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480640
55023	NC_012029	CCG	2	6	2217227	2217232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480641
55024	NC_012029	GCC	2	6	2217238	2217243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480641
55025	NC_012029	ACG	2	6	2217259	2217264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480641
55026	NC_012029	CGC	2	6	2217306	2217311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480641
55027	NC_012029	GCG	2	6	2217328	2217333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480641
55028	NC_012029	GAC	2	6	2217335	2217340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480641
55029	NC_012029	GA	3	6	2217370	2217375	50 %	0 %	50 %	0 %	222480641
55030	NC_012029	TCG	2	6	2217421	2217426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480641
55031	NC_012029	GCG	2	6	2217433	2217438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480641
55032	NC_012029	CAC	2	6	2217455	2217460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480641
55033	NC_012029	CGA	3	9	2217656	2217664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480642
55034	NC_012029	AAG	2	6	2217681	2217686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222480642
55035	NC_012029	TCGC	2	8	2217688	2217695	0 %	25 %	25 %	50 %	222480642
55036	NC_012029	CGT	2	6	2217716	2217721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480642
55037	NC_012029	CGA	2	6	2217722	2217727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480642
55038	NC_012029	GGA	2	6	2217728	2217733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480642
55039	NC_012029	CGT	2	6	2217746	2217751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480642
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55041	NC_012029	TCG	2	6	2217826	2217831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480642
55042	NC_012029	TGA	2	6	2217922	2217927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480642
55043	NC_012029	CGA	2	6	2217965	2217970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480642
55044	NC_012029	CGA	2	6	2217992	2217997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480642
55045	NC_012029	GTC	2	6	2218020	2218025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480642
55046	NC_012029	GAC	2	6	2218026	2218031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480642
55047	NC_012029	TCG	2	6	2218042	2218047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480642
55048	NC_012029	CAT	2	6	2218049	2218054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480642
55049	NC_012029	TCG	2	6	2218357	2218362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480643
55050	NC_012029	GCCG	2	8	2218391	2218398	0 %	0 %	50 %	50 %	222480643
55051	NC_012029	GAA	2	6	2218430	2218435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222480643
55052	NC_012029	CCGAGC	2	12	2218470	2218481	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222480643
55053	NC_012029	GC	3	6	2218487	2218492	0 %	0 %	50 %	50 %	222480643
55054	NC_012029	GCC	2	6	2218508	2218513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480643
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55058	NC_012029	GCCC	2	8	2218663	2218670	0 %	0 %	25 %	75 %	222480643
55059	NC_012029	CGC	2	6	2218684	2218689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480643
55060	NC_012029	GCGCC	2	10	2218747	2218756	0 %	0 %	40 %	60 %	222480643
55061	NC_012029	CCG	2	6	2218762	2218767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480643
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55065	NC_012029	GC	3	6	2218928	2218933	0 %	0 %	50 %	50 %	222480643
55066	NC_012029	CCG	2	6	2219034	2219039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480643
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55075	NC_012029	GCTC	2	8	2219274	2219281	0 %	25 %	25 %	50 %	222480643
55076	NC_012029	CGAT	2	8	2219296	2219303	25 %	25 %	25 %	25 %	222480643
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55088	NC_012029	CGA	2	6	2219870	2219875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480644
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55100	NC_012029	CG	4	8	2220368	2220375	0 %	0 %	50 %	50 %	222480644
55101	NC_012029	CGC	2	6	2220377	2220382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480644
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55105	NC_012029	ACGCC	2	10	2220592	2220601	20 %	0 %	20 %	60 %	222480644
55106	NC_012029	CACT	2	8	2221313	2221320	25 %	25 %	0 %	50 %	222480645
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55115	NC_012029	CCG	2	6	2221495	2221500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480645
55116	NC_012029	TCGG	2	8	2221538	2221545	0 %	25 %	50 %	25 %	222480645
55117	NC_012029	GTC	3	9	2221550	2221558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480645
55118	NC_012029	CGC	2	6	2221559	2221564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480645
55119	NC_012029	CTCGC	2	10	2221572	2221581	0 %	20 %	20 %	60 %	222480645
55120	NC_012029	TGA	2	6	2221611	2221616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480645
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55122	NC_012029	CGC	2	6	2221685	2221690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480645
55123	NC_012029	CGA	2	6	2221745	2221750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480645
55124	NC_012029	GCC	2	6	2221770	2221775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480645
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55134	NC_012029	CGACG	2	10	2222605	2222614	20 %	0 %	40 %	40 %	222480646
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55145	NC_012029	AAGC	2	8	2223013	2223020	50 %	0 %	25 %	25 %	222480646
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55230	NC_012029	TCG	2	6	2227097	2227102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480650
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55332	NC_012029	GCTC	2	8	2231148	2231155	0 %	25 %	25 %	50 %	222480653
55333	NC_012029	CGA	2	6	2231172	2231177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480653
55334	NC_012029	CGA	4	12	2231232	2231243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480653
55335	NC_012029	CGA	2	6	2231265	2231270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480653
55336	NC_012029	GC	3	6	2231311	2231316	0 %	0 %	50 %	50 %	222480653
55337	NC_012029	AGCG	2	8	2231362	2231369	25 %	0 %	50 %	25 %	222480653
55338	NC_012029	GCCGGA	2	12	2231457	2231468	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222480653
55339	NC_012029	CGT	2	6	2231475	2231480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480653
55340	NC_012029	ACG	2	6	2231519	2231524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480653
55341	NC_012029	CGAGC	2	10	2231528	2231537	20 %	0 %	40 %	40 %	222480653
55342	NC_012029	TCGG	2	8	2231596	2231603	0 %	25 %	50 %	25 %	222480653
55343	NC_012029	CGTG	2	8	2231606	2231613	0 %	25 %	50 %	25 %	222480653
55344	NC_012029	GTC	2	6	2231626	2231631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480653
55345	NC_012029	GTC	2	6	2231683	2231688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480653
55346	NC_012029	TCGACG	2	12	2231698	2231709	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222480653
55347	NC_012029	ACC	2	6	2231722	2231727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480653
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55351	NC_012029	CTG	2	6	2231785	2231790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480653
55352	NC_012029	GCC	2	6	2231808	2231813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480653
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55447	NC_012029	TCG	2	6	2236144	2236149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480656
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55452	NC_012029	TCG	2	6	2236378	2236383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480657
55453	NC_012029	GA	3	6	2236448	2236453	50 %	0 %	50 %	0 %	222480657
55454	NC_012029	GTC	2	6	2236479	2236484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480657
55455	NC_012029	CTC	2	6	2236503	2236508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480657
55456	NC_012029	ACCGC	2	10	2236583	2236592	20 %	0 %	20 %	60 %	222480657
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55458	NC_012029	CGC	2	6	2236643	2236648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480657
55459	NC_012029	AGG	2	6	2236649	2236654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480657
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55481	NC_012029	TCG	2	6	2237612	2237617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480658
55482	NC_012029	CTG	2	6	2237662	2237667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480658
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55488	NC_012029	GTG	2	6	2237774	2237779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480658
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55492	NC_012029	CGA	2	6	2237937	2237942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480658
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