MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_012029	GAG	2	6	2179223	2179228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480605
54003	NC_012029	CTG	2	6	2179287	2179292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480605
54004	NC_012029	TCG	2	6	2179299	2179304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480605
54005	NC_012029	CG	3	6	2179303	2179308	0 %	0 %	50 %	50 %	222480605
54006	NC_012029	TGCA	2	8	2179324	2179331	25 %	25 %	25 %	25 %	222480605
54007	NC_012029	CGC	3	9	2179336	2179344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480605
54008	NC_012029	GC	3	6	2179363	2179368	0 %	0 %	50 %	50 %	222480605
54009	NC_012029	GACC	2	8	2179405	2179412	25 %	0 %	25 %	50 %	222480605
54010	NC_012029	CCG	2	6	2179413	2179418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480605
54011	NC_012029	CGT	2	6	2179468	2179473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480605
54012	NC_012029	CAC	2	6	2179480	2179485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480605
54013	NC_012029	CGG	2	6	2179492	2179497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480605
54014	NC_012029	CCCG	2	8	2179501	2179508	0 %	0 %	25 %	75 %	222480605
54015	NC_012029	GGC	2	6	2179537	2179542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480605
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54017	NC_012029	CCG	3	9	2179562	2179570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480605
54018	NC_012029	CG	3	6	2179574	2179579	0 %	0 %	50 %	50 %	222480605
54019	NC_012029	GAC	2	6	2179588	2179593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480605
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54053	NC_012029	GCG	2	6	2181045	2181050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480606
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54116	NC_012029	CGC	3	9	2184180	2184188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480610
54117	NC_012029	CGTCGC	2	12	2184239	2184250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222480610
54118	NC_012029	GCAC	2	8	2184260	2184267	25 %	0 %	25 %	50 %	222480610
54119	NC_012029	CGCGG	2	10	2184273	2184282	0 %	0 %	60 %	40 %	222480610
54120	NC_012029	CGG	2	6	2184296	2184301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480610
54121	NC_012029	GAG	2	6	2184346	2184351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480610
54122	NC_012029	CGA	2	6	2184380	2184385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480610
54123	NC_012029	CGT	2	6	2184395	2184400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480610
54124	NC_012029	CGA	2	6	2184401	2184406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480610
54125	NC_012029	GCG	2	6	2184451	2184456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480610
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54127	NC_012029	TCG	2	6	2184560	2184565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480610
54128	NC_012029	CGT	3	9	2184755	2184763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480611
54129	NC_012029	CGC	2	6	2184779	2184784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480611
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54131	NC_012029	TCG	2	6	2184847	2184852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480611
54132	NC_012029	CGG	2	6	2184866	2184871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480611
54133	NC_012029	CGA	2	6	2184911	2184916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480611
54134	NC_012029	CGC	2	6	2184917	2184922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480611
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54191	NC_012029	GAC	2	6	2186775	2186780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480612
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54201	NC_012029	CGA	2	6	2187062	2187067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480612
54202	NC_012029	GAC	2	6	2187075	2187080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480612
54203	NC_012029	GAT	2	6	2187084	2187089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480612
54204	NC_012029	CGA	2	6	2187098	2187103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480612
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54212	NC_012029	GCG	2	6	2187196	2187201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480612
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54214	NC_012029	CGA	2	6	2187236	2187241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480612
54215	NC_012029	AAACG	2	10	2187260	2187269	60 %	0 %	20 %	20 %	222480612
54216	NC_012029	CGG	2	6	2187405	2187410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480613
54217	NC_012029	GAC	2	6	2187460	2187465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480613
54218	NC_012029	CG	3	6	2187468	2187473	0 %	0 %	50 %	50 %	222480613
54219	NC_012029	ACG	3	9	2187477	2187485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480613
54220	NC_012029	AGGACG	2	12	2187486	2187497	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222480613
54221	NC_012029	GTC	2	6	2187515	2187520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480613
54222	NC_012029	CGCC	2	8	2187522	2187529	0 %	0 %	25 %	75 %	222480613
54223	NC_012029	TCG	2	6	2187546	2187551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480613
54224	NC_012029	ACCAGC	2	12	2187552	2187563	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222480613
54225	NC_012029	ACG	2	6	2187570	2187575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480613
54226	NC_012029	TCGG	2	8	2187595	2187602	0 %	25 %	50 %	25 %	222480613
54227	NC_012029	ACG	2	6	2187669	2187674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480613
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54229	NC_012029	GAT	2	6	2187827	2187832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480614
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54343	NC_012029	GAT	2	6	2191560	2191565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480618
54344	NC_012029	CGT	2	6	2191581	2191586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480618
54345	NC_012029	AGG	2	6	2191616	2191621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480618
54346	NC_012029	CGA	2	6	2191650	2191655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480618
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54349	NC_012029	ATC	2	6	2191858	2191863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480618
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54457	NC_012029	GGTC	2	8	2196245	2196252	0 %	25 %	50 %	25 %	222480622
54458	NC_012029	CGT	2	6	2196260	2196265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480622
54459	NC_012029	GTC	2	6	2196300	2196305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480622
54460	NC_012029	TCG	2	6	2196322	2196327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480622
54461	NC_012029	ACG	2	6	2196352	2196357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480622
54462	NC_012029	GAG	3	9	2196400	2196408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480622
54463	NC_012029	GTC	3	9	2196504	2196512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480622
54464	NC_012029	CGG	2	6	2196533	2196538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480622
54465	NC_012029	GCC	2	6	2196542	2196547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480622
54466	NC_012029	GC	3	6	2196556	2196561	0 %	0 %	50 %	50 %	222480622
54467	NC_012029	GGCG	2	8	2196600	2196607	0 %	0 %	75 %	25 %	222480622
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54469	NC_012029	CGG	2	6	2196686	2196691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480622
54470	NC_012029	GAC	2	6	2196723	2196728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480622
54471	NC_012029	CGT	2	6	2196731	2196736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480622
54472	NC_012029	CCG	2	6	2196924	2196929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480623
54473	NC_012029	CCCCG	2	10	2196934	2196943	0 %	0 %	20 %	80 %	222480623
54474	NC_012029	CGC	2	6	2196994	2196999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480623
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54476	NC_012029	CG	3	6	2197054	2197059	0 %	0 %	50 %	50 %	222480623
54477	NC_012029	CAT	2	6	2197063	2197068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480623
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54481	NC_012029	CGA	2	6	2197150	2197155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480623
54482	NC_012029	CGA	2	6	2197177	2197182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480623
54483	NC_012029	TCC	2	6	2197221	2197226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480623
54484	NC_012029	CGTC	2	8	2197264	2197271	0 %	25 %	25 %	50 %	222480623
54485	NC_012029	CGC	2	6	2197348	2197353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480623
54486	NC_012029	CCG	2	6	2197380	2197385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480623
54487	NC_012029	CGA	2	6	2197423	2197428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480623
54488	NC_012029	CGA	2	6	2197464	2197469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480623
54489	NC_012029	GGC	2	6	2197525	2197530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480623
54490	NC_012029	GAG	2	6	2197544	2197549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480623
54491	NC_012029	ACCGC	2	10	2197560	2197569	20 %	0 %	20 %	60 %	222480623
54492	NC_012029	CGC	2	6	2197576	2197581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480623
54493	NC_012029	CCGG	2	8	2197623	2197630	0 %	0 %	50 %	50 %	222480623
54494	NC_012029	GAG	2	6	2197646	2197651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480623
54495	NC_012029	CGA	2	6	2197731	2197736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480623
54496	NC_012029	GTC	2	6	2197742	2197747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480623
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54498	NC_012029	GCT	2	6	2197846	2197851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480623
54499	NC_012029	CCA	2	6	2197857	2197862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480623
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