MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_012029	GTC	2	6	2119428	2119433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480537
52502	NC_012029	CGG	2	6	2119471	2119476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480537
52503	NC_012029	ACG	2	6	2119480	2119485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480537
52504	NC_012029	AGC	2	6	2119646	2119651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480537
52505	NC_012029	GTC	2	6	2119778	2119783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480538
52506	NC_012029	CGG	2	6	2119876	2119881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480538
52507	NC_012029	CGG	2	6	2119921	2119926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480538
52508	NC_012029	GGC	2	6	2119997	2120002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480538
52509	NC_012029	ACG	2	6	2120070	2120075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480538
52510	NC_012029	GGT	2	6	2120095	2120100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480538
52511	NC_012029	CGA	2	6	2120107	2120112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480538
52512	NC_012029	CGC	3	9	2120116	2120124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480538
52513	NC_012029	CGACGC	2	12	2120137	2120148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222480538
52514	NC_012029	GAC	2	6	2120150	2120155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480538
52515	NC_012029	CGA	2	6	2120158	2120163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480538
52516	NC_012029	CGA	3	9	2120201	2120209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480539
52517	NC_012029	TCGC	2	8	2120232	2120239	0 %	25 %	25 %	50 %	222480539
52518	NC_012029	GCG	2	6	2120245	2120250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480539
52519	NC_012029	ACG	3	9	2120281	2120289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480539
52520	NC_012029	GTCGCT	2	12	2120324	2120335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480539
52521	NC_012029	CGC	2	6	2120336	2120341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480539
52522	NC_012029	GAG	2	6	2120373	2120378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480539
52523	NC_012029	ATC	2	6	2120415	2120420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480539
52524	NC_012029	CG	4	8	2120447	2120454	0 %	0 %	50 %	50 %	222480539
52525	NC_012029	CGA	2	6	2120492	2120497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480539
52526	NC_012029	GTC	2	6	2120535	2120540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480539
52527	NC_012029	GTC	2	6	2120612	2120617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480539
52528	NC_012029	TCGC	2	8	2120629	2120636	0 %	25 %	25 %	50 %	222480539
52529	NC_012029	ATC	2	6	2120781	2120786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480540
52530	NC_012029	CGGCCG	2	12	2120833	2120844	0 %	0 %	50 %	50 %	222480540
52531	NC_012029	CGA	2	6	2120906	2120911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480540
52532	NC_012029	GAG	2	6	2120952	2120957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480540
52533	NC_012029	CGG	2	6	2120960	2120965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480540
52534	NC_012029	CTCG	2	8	2120972	2120979	0 %	25 %	25 %	50 %	222480540
52535	NC_012029	GAG	2	6	2121009	2121014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480540
52536	NC_012029	TCG	2	6	2121091	2121096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480540
52537	NC_012029	ACC	2	6	2121109	2121114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480540
52538	NC_012029	CGA	2	6	2121146	2121151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480540
52539	NC_012029	TCG	2	6	2121238	2121243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480540
52540	NC_012029	CGA	2	6	2121326	2121331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480540
52541	NC_012029	TCG	3	9	2121340	2121348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480540
52542	NC_012029	GGC	2	6	2121395	2121400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480540
52543	NC_012029	CGA	2	6	2121554	2121559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480540
52544	NC_012029	GTC	2	6	2121570	2121575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480540
52545	NC_012029	CTT	2	6	2121641	2121646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222480540
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52548	NC_012029	GAA	2	6	2121773	2121778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222480540
52549	NC_012029	CGG	3	9	2121868	2121876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480541
52550	NC_012029	CGA	2	6	2121910	2121915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480541
52551	NC_012029	GTC	3	9	2121923	2121931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480541
52552	NC_012029	CGA	2	6	2121946	2121951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480541
52553	NC_012029	TCG	3	9	2122059	2122067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480541
52554	NC_012029	GAC	2	6	2122076	2122081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480541
52555	NC_012029	GGC	2	6	2122105	2122110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480541
52556	NC_012029	GC	3	6	2122125	2122130	0 %	0 %	50 %	50 %	222480541
52557	NC_012029	GGC	2	6	2122169	2122174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480541
52558	NC_012029	CGT	3	9	2122189	2122197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480541
52559	NC_012029	CGA	2	6	2122203	2122208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480541
52560	NC_012029	GAC	2	6	2122214	2122219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480541
52561	NC_012029	CGGCGC	2	12	2122303	2122314	0 %	0 %	50 %	50 %	222480541
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52563	NC_012029	CCG	2	6	2122393	2122398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480541
52564	NC_012029	CGT	2	6	2122399	2122404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480541
52565	NC_012029	CGGC	2	8	2122450	2122457	0 %	0 %	50 %	50 %	222480541
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52568	NC_012029	CGA	2	6	2122551	2122556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480542
52569	NC_012029	GCGG	2	8	2122567	2122574	0 %	0 %	75 %	25 %	222480542
52570	NC_012029	CG	4	8	2122608	2122615	0 %	0 %	50 %	50 %	222480542
52571	NC_012029	GAG	2	6	2122624	2122629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480542
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52573	NC_012029	ACCG	2	8	2122675	2122682	25 %	0 %	25 %	50 %	222480542
52574	NC_012029	CGG	2	6	2122731	2122736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480542
52575	NC_012029	TCGAC	2	10	2122746	2122755	20 %	20 %	20 %	40 %	222480542
52576	NC_012029	GAG	2	6	2122759	2122764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480542
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52581	NC_012029	GTC	2	6	2122963	2122968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480542
52582	NC_012029	GCC	2	6	2122996	2123001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480542
52583	NC_012029	CTG	2	6	2123027	2123032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480542
52584	NC_012029	GA	3	6	2123048	2123053	50 %	0 %	50 %	0 %	222480542
52585	NC_012029	CGA	2	6	2123079	2123084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480542
52586	NC_012029	TCG	2	6	2123102	2123107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480542
52587	NC_012029	TCG	2	6	2123138	2123143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480542
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52589	NC_012029	CTG	2	6	2123162	2123167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480542
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52596	NC_012029	CGGC	2	8	2123672	2123679	0 %	0 %	50 %	50 %	222480542
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52598	NC_012029	GAGC	2	8	2123756	2123763	25 %	0 %	50 %	25 %	222480542
52599	NC_012029	ACG	2	6	2123774	2123779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480542
52600	NC_012029	CCCG	2	8	2123802	2123809	0 %	0 %	25 %	75 %	222480542
52601	NC_012029	CGA	2	6	2123829	2123834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480542
52602	NC_012029	CGG	2	6	2123951	2123956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480543
52603	NC_012029	CGAG	2	8	2123969	2123976	25 %	0 %	50 %	25 %	222480543
52604	NC_012029	CCG	2	6	2123993	2123998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480543
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52607	NC_012029	CGA	2	6	2124068	2124073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480543
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52610	NC_012029	CGA	2	6	2124122	2124127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480543
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52613	NC_012029	CGA	2	6	2124251	2124256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480543
52614	NC_012029	GAG	2	6	2124261	2124266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480543
52615	NC_012029	CAG	2	6	2124375	2124380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480543
52616	NC_012029	GAC	2	6	2124394	2124399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480543
52617	NC_012029	ATC	2	6	2124400	2124405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480543
52618	NC_012029	GAC	2	6	2124465	2124470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480543
52619	NC_012029	GCC	2	6	2124514	2124519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480543
52620	NC_012029	AGG	3	9	2124550	2124558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480543
52621	NC_012029	ACGA	2	8	2124577	2124584	50 %	0 %	25 %	25 %	222480543
52622	NC_012029	CGA	2	6	2124611	2124616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480543
52623	NC_012029	GAT	2	6	2124678	2124683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480543
52624	NC_012029	GCC	3	9	2124702	2124710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480543
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52626	NC_012029	CCG	2	6	2124766	2124771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480543
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52630	NC_012029	ACC	2	6	2124805	2124810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480543
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52644	NC_012029	GTA	2	6	2125290	2125295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480543
52645	NC_012029	CGG	2	6	2125301	2125306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480543
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52651	NC_012029	CGA	2	6	2125549	2125554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480544
52652	NC_012029	CGA	2	6	2125594	2125599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480544
52653	NC_012029	TC	3	6	2125629	2125634	0 %	50 %	0 %	50 %	222480544
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52684	NC_012029	CGG	2	6	2126789	2126794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480545
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52689	NC_012029	CGA	2	6	2126981	2126986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480545
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52721	NC_012029	GATCGC	2	12	2128091	2128102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222480546
52722	NC_012029	CCG	2	6	2128125	2128130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480546
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52844	NC_012029	TGA	2	6	2132258	2132263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480551
52845	NC_012029	CGG	2	6	2132289	2132294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480551
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52957	NC_012029	TCGAAG	2	12	2136964	2136975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222480559
52958	NC_012029	TCG	2	6	2136997	2137002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480559
52959	NC_012029	GTT	2	6	2137011	2137016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222480559
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52981	NC_012029	TG	3	6	2137841	2137846	0 %	50 %	50 %	0 %	222480559
52982	NC_012029	CCG	2	6	2137867	2137872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480559
52983	NC_012029	TCG	2	6	2137873	2137878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480559
52984	NC_012029	CCG	2	6	2137879	2137884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480559
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52986	NC_012029	CCGC	2	8	2137915	2137922	0 %	0 %	25 %	75 %	222480559
52987	NC_012029	CGA	2	6	2138394	2138399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480560
52988	NC_012029	CGA	2	6	2138403	2138408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480560
52989	NC_012029	GTC	2	6	2138440	2138445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480560
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52992	NC_012029	CG	3	6	2138526	2138531	0 %	0 %	50 %	50 %	222480560
52993	NC_012029	TGC	2	6	2138555	2138560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480560
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