MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_012029	GGC	2	6	2079911	2079916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480501
51502	NC_012029	CGA	2	6	2079972	2079977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51503	NC_012029	AAC	2	6	2080013	2080018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222480501
51504	NC_012029	TACGAC	2	12	2080076	2080087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222480501
51505	NC_012029	ACT	2	6	2080104	2080109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480501
51506	NC_012029	ACG	2	6	2080137	2080142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51507	NC_012029	CGT	2	6	2080197	2080202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51508	NC_012029	GCG	2	6	2080210	2080215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480501
51509	NC_012029	ACG	2	6	2080245	2080250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51510	NC_012029	GGA	2	6	2080279	2080284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480501
51511	NC_012029	CTG	2	6	2080298	2080303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51512	NC_012029	CGA	3	9	2080312	2080320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51513	NC_012029	CGT	2	6	2080327	2080332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51514	NC_012029	TCG	2	6	2080374	2080379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51515	NC_012029	TCG	2	6	2080415	2080420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51516	NC_012029	ACC	2	6	2080437	2080442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480501
51517	NC_012029	CGA	2	6	2080504	2080509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51518	NC_012029	GAC	2	6	2080511	2080516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51519	NC_012029	TGGG	2	8	2080536	2080543	0 %	25 %	75 %	0 %	222480501
51520	NC_012029	GGT	2	6	2080570	2080575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480501
51521	NC_012029	TCG	2	6	2080584	2080589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51522	NC_012029	CGA	2	6	2080618	2080623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51523	NC_012029	ACG	2	6	2080713	2080718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480501
51524	NC_012029	CCG	2	6	2080730	2080735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480501
51525	NC_012029	CGG	2	6	2080744	2080749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480501
51526	NC_012029	CG	3	6	2080759	2080764	0 %	0 %	50 %	50 %	222480501
51527	NC_012029	TC	3	6	2080780	2080785	0 %	50 %	0 %	50 %	222480501
51528	NC_012029	GGC	2	6	2080786	2080791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480501
51529	NC_012029	GAA	2	6	2081082	2081087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222480502
51530	NC_012029	GCGAC	2	10	2081092	2081101	20 %	0 %	40 %	40 %	222480502
51531	NC_012029	CGGC	2	8	2081121	2081128	0 %	0 %	50 %	50 %	222480502
51532	NC_012029	GCT	2	6	2081145	2081150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480502
51533	NC_012029	CGG	2	6	2081167	2081172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480502
51534	NC_012029	GCG	2	6	2081223	2081228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480502
51535	NC_012029	GCA	2	6	2081259	2081264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480502
51536	NC_012029	GC	3	6	2081265	2081270	0 %	0 %	50 %	50 %	222480502
51537	NC_012029	GTC	2	6	2081285	2081290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480502
51538	NC_012029	CAT	2	6	2081365	2081370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480502
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51540	NC_012029	TTC	2	6	2081474	2081479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222480502
51541	NC_012029	GAG	3	9	2081492	2081500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480502
51542	NC_012029	ACG	2	6	2081538	2081543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480502
51543	NC_012029	CCG	2	6	2081571	2081576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480502
51544	NC_012029	AAC	2	6	2081585	2081590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222480502
51545	NC_012029	CGG	2	6	2081632	2081637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480502
51546	NC_012029	GAG	2	6	2081639	2081644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480502
51547	NC_012029	CGC	2	6	2081683	2081688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480502
51548	NC_012029	CGT	2	6	2081715	2081720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480502
51549	NC_012029	ACG	2	6	2081766	2081771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480502
51550	NC_012029	GA	3	6	2081790	2081795	50 %	0 %	50 %	0 %	222480502
51551	NC_012029	GGA	3	9	2081836	2081844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480502
51552	NC_012029	CGG	3	9	2081856	2081864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480502
51553	NC_012029	GCTC	2	8	2081934	2081941	0 %	25 %	25 %	50 %	222480502
51554	NC_012029	GC	3	6	2081961	2081966	0 %	0 %	50 %	50 %	222480502
51555	NC_012029	CGC	2	6	2081971	2081976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480502
51556	NC_012029	ACG	2	6	2081988	2081993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480502
51557	NC_012029	GGA	2	6	2082025	2082030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480502
51558	NC_012029	TCG	2	6	2082075	2082080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480502
51559	NC_012029	CGT	2	6	2082097	2082102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480502
51560	NC_012029	GCC	2	6	2082110	2082115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480502
51561	NC_012029	TTAG	2	8	2082169	2082176	25 %	50 %	25 %	0 %	222480502
51562	NC_012029	GT	3	6	2082195	2082200	0 %	50 %	50 %	0 %	222480503
51563	NC_012029	CTT	2	6	2082242	2082247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222480503
51564	NC_012029	CTG	2	6	2082312	2082317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480503
51565	NC_012029	TCG	2	6	2082336	2082341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480503
51566	NC_012029	CTA	2	6	2082544	2082549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480503
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51568	NC_012029	CG	3	6	2082634	2082639	0 %	0 %	50 %	50 %	222480503
51569	NC_012029	GAA	2	6	2082643	2082648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222480503
51570	NC_012029	AGT	2	6	2082698	2082703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480503
51571	NC_012029	TTC	2	6	2082716	2082721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222480503
51572	NC_012029	GCT	2	6	2082799	2082804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480503
51573	NC_012029	ATC	2	6	2082836	2082841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480503
51574	NC_012029	GTAC	2	8	2082963	2082970	25 %	25 %	25 %	25 %	222480503
51575	NC_012029	CGC	2	6	2083015	2083020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480503
51576	NC_012029	CAC	2	6	2083041	2083046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480503
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51580	NC_012029	GTG	3	9	2083160	2083168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480503
51581	NC_012029	GGCG	2	8	2083232	2083239	0 %	0 %	75 %	25 %	222480503
51582	NC_012029	TGG	3	9	2083247	2083255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480503
51583	NC_012029	CGA	2	6	2083283	2083288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480503
51584	NC_012029	GAC	2	6	2083343	2083348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480503
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51586	NC_012029	TGG	2	6	2084173	2084178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480504
51587	NC_012029	TCG	2	6	2084218	2084223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480504
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51589	NC_012029	CGTT	2	8	2084248	2084255	0 %	50 %	25 %	25 %	222480504
51590	NC_012029	TCGT	2	8	2084262	2084269	0 %	50 %	25 %	25 %	222480504
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51598	NC_012029	CCT	2	6	2084780	2084785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480504
51599	NC_012029	CTA	2	6	2084798	2084803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480504
51600	NC_012029	CAT	2	6	2084813	2084818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480504
51601	NC_012029	CCGG	2	8	2084823	2084830	0 %	0 %	50 %	50 %	222480504
51602	NC_012029	TCC	2	6	2084851	2084856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480504
51603	NC_012029	CTA	2	6	2084912	2084917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480504
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51611	NC_012029	GTC	2	6	2085150	2085155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480504
51612	NC_012029	TCC	2	6	2085178	2085183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480504
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51614	NC_012029	CGA	2	6	2085205	2085210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480504
51615	NC_012029	CCG	2	6	2085455	2085460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480505
51616	NC_012029	TCG	2	6	2085482	2085487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480505
51617	NC_012029	AGC	2	6	2085491	2085496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480505
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51620	NC_012029	CGATC	2	10	2085624	2085633	20 %	20 %	20 %	40 %	222480505
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51622	NC_012029	TCG	2	6	2085677	2085682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480505
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51626	NC_012029	GGA	2	6	2085783	2085788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480505
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51722	NC_012029	CAG	2	6	2089251	2089256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480508
51723	NC_012029	CGAGC	2	10	2089440	2089449	20 %	0 %	40 %	40 %	222480508
51724	NC_012029	CGAT	2	8	2089450	2089457	25 %	25 %	25 %	25 %	222480508
51725	NC_012029	TCGCC	2	10	2089463	2089472	0 %	20 %	20 %	60 %	222480508
51726	NC_012029	CGA	2	6	2089514	2089519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480508
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51960	NC_012029	GAC	2	6	2097729	2097734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480517
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