MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_012029	GCC	2	6	2058418	2058423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480480
51002	NC_012029	GGGC	3	12	2058424	2058435	0 %	0 %	75 %	25 %	222480480
51003	NC_012029	CGG	2	6	2058459	2058464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480480
51004	NC_012029	CCCGC	2	10	2058549	2058558	0 %	0 %	20 %	80 %	222480480
51005	NC_012029	CCG	2	6	2058636	2058641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480480
51006	NC_012029	CGA	3	9	2058654	2058662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480480
51007	NC_012029	CCG	2	6	2058671	2058676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480480
51008	NC_012029	GACGG	2	10	2058709	2058718	20 %	0 %	60 %	20 %	222480480
51009	NC_012029	GC	4	8	2058738	2058745	0 %	0 %	50 %	50 %	222480480
51010	NC_012029	ACC	2	6	2058749	2058754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480480
51011	NC_012029	CACGTC	2	12	2058763	2058774	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222480480
51012	NC_012029	GCG	2	6	2058791	2058796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480480
51013	NC_012029	TCGACG	2	12	2058818	2058829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222480480
51014	NC_012029	GCG	2	6	2058830	2058835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480480
51015	NC_012029	CG	3	6	2058871	2058876	0 %	0 %	50 %	50 %	222480480
51016	NC_012029	CGC	2	6	2058918	2058923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480480
51017	NC_012029	CGC	2	6	2058975	2058980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480480
51018	NC_012029	GAG	2	6	2058982	2058987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480480
51019	NC_012029	GGA	2	6	2059003	2059008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480480
51020	NC_012029	CGG	2	6	2059050	2059055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480480
51021	NC_012029	CGG	2	6	2059077	2059082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480480
51022	NC_012029	TTACCC	2	12	2059118	2059129	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222480480
51023	NC_012029	GCG	2	6	2059242	2059247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480481
51024	NC_012029	CGCC	2	8	2059270	2059277	0 %	0 %	25 %	75 %	222480481
51025	NC_012029	CGG	2	6	2059315	2059320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480481
51026	NC_012029	CTG	2	6	2059358	2059363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480481
51027	NC_012029	CTT	2	6	2059426	2059431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222480481
51028	NC_012029	GCC	3	9	2059445	2059453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480481
51029	NC_012029	CGCC	2	8	2059515	2059522	0 %	0 %	25 %	75 %	222480481
51030	NC_012029	CGG	2	6	2059537	2059542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480481
51031	NC_012029	TCG	2	6	2059572	2059577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480481
51032	NC_012029	GTC	2	6	2059631	2059636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480481
51033	NC_012029	CGG	2	6	2059656	2059661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480481
51034	NC_012029	CGT	2	6	2059687	2059692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480481
51035	NC_012029	CGA	2	6	2059693	2059698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480481
51036	NC_012029	CG	3	6	2059728	2059733	0 %	0 %	50 %	50 %	222480481
51037	NC_012029	CGAC	2	8	2059749	2059756	25 %	0 %	25 %	50 %	222480481
51038	NC_012029	CGT	3	9	2059801	2059809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480481
51039	NC_012029	GCCGC	2	10	2059866	2059875	0 %	0 %	40 %	60 %	222480481
51040	NC_012029	TCGC	2	8	2059919	2059926	0 %	25 %	25 %	50 %	222480481
51041	NC_012029	CGG	2	6	2059965	2059970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480481
51042	NC_012029	GACG	2	8	2059999	2060006	25 %	0 %	50 %	25 %	222480481
51043	NC_012029	CGC	2	6	2060014	2060019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480481
51044	NC_012029	GTC	2	6	2060021	2060026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480481
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51046	NC_012029	CG	3	6	2060090	2060095	0 %	0 %	50 %	50 %	222480481
51047	NC_012029	CGT	2	6	2060200	2060205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480481
51048	NC_012029	ACC	2	6	2060214	2060219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480481
51049	NC_012029	CG	3	6	2060229	2060234	0 %	0 %	50 %	50 %	222480481
51050	NC_012029	CTCG	2	8	2060239	2060246	0 %	25 %	25 %	50 %	222480481
51051	NC_012029	GCG	2	6	2060262	2060267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480481
51052	NC_012029	TGG	2	6	2060298	2060303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480481
51053	NC_012029	GCG	2	6	2060316	2060321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480481
51054	NC_012029	CGG	2	6	2060332	2060337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480481
51055	NC_012029	CGA	3	9	2060338	2060346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480481
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51058	NC_012029	CGA	3	9	2060561	2060569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480482
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51060	NC_012029	CGT	2	6	2060633	2060638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480482
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51062	NC_012029	CGA	4	12	2060696	2060707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480482
51063	NC_012029	GGCG	2	8	2060723	2060730	0 %	0 %	75 %	25 %	222480482
51064	NC_012029	GAG	2	6	2060781	2060786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480482
51065	NC_012029	GTC	2	6	2060787	2060792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480482
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51071	NC_012029	GTC	2	6	2061297	2061302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480483
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51087	NC_012029	GC	3	6	2061791	2061796	0 %	0 %	50 %	50 %	222480484
51088	NC_012029	GGA	2	6	2061821	2061826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480484
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51099	NC_012029	CG	3	6	2062084	2062089	0 %	0 %	50 %	50 %	222480484
51100	NC_012029	CCT	2	6	2062111	2062116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480484
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51105	NC_012029	GCC	3	9	2062439	2062447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480484
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51115	NC_012029	TCC	2	6	2062731	2062736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480484
51116	NC_012029	TCG	2	6	2062762	2062767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480484
51117	NC_012029	TCG	2	6	2062797	2062802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480484
51118	NC_012029	CTC	2	6	2062826	2062831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480484
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51217	NC_012029	GCC	2	6	2066686	2066691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480490
51218	NC_012029	ACGAG	2	10	2066718	2066727	40 %	0 %	40 %	20 %	222480490
51219	NC_012029	TCG	2	6	2066760	2066765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480490
51220	NC_012029	GCG	2	6	2066780	2066785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480490
51221	NC_012029	AGCGCG	2	12	2066828	2066839	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222480490
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51225	NC_012029	AGT	2	6	2066949	2066954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480490
51226	NC_012029	CGG	2	6	2066970	2066975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480490
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51229	NC_012029	GAGC	2	8	2067015	2067022	25 %	0 %	50 %	25 %	222480490
51230	NC_012029	CGA	2	6	2067039	2067044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480490
51231	NC_012029	CGG	2	6	2067069	2067074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480490
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51233	NC_012029	CGA	2	6	2067354	2067359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480491
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51236	NC_012029	CGA	2	6	2067492	2067497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480491
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51258	NC_012029	CGA	2	6	2068698	2068703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480492
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51326	NC_012029	G	6	6	2071306	2071311	0 %	0 %	100 %	0 %	222480495
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51337	NC_012029	CG	4	8	2071773	2071780	0 %	0 %	50 %	50 %	222480495
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51340	NC_012029	TAC	2	6	2071852	2071857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480495
51341	NC_012029	CGC	2	6	2071901	2071906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480495
51342	NC_012029	CGC	2	6	2071959	2071964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480495
51343	NC_012029	GCT	2	6	2071998	2072003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480495
51344	NC_012029	GTC	2	6	2072050	2072055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480495
51345	NC_012029	GCG	2	6	2072071	2072076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480495
51346	NC_012029	ACC	2	6	2072105	2072110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480495
51347	NC_012029	CGA	2	6	2072211	2072216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480495
51348	NC_012029	GCT	2	6	2072223	2072228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480495
51349	NC_012029	CGG	2	6	2072230	2072235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480495
51350	NC_012029	GCG	2	6	2072250	2072255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480495
51351	NC_012029	GAGC	2	8	2072256	2072263	25 %	0 %	50 %	25 %	222480495
51352	NC_012029	GACC	2	8	2072310	2072317	25 %	0 %	25 %	50 %	222480495
51353	NC_012029	CGG	2	6	2072327	2072332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480495
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51355	NC_012029	CGG	2	6	2072457	2072462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480495
51356	NC_012029	GTC	2	6	2072464	2072469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480495
51357	NC_012029	CGA	2	6	2072478	2072483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480495
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51363	NC_012029	CGA	2	6	2072616	2072621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480495
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51367	NC_012029	CGA	2	6	2072742	2072747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480495
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51372	NC_012029	GTC	3	9	2073085	2073093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480495
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51455	NC_012029	CGA	2	6	2077027	2077032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480498
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51458	NC_012029	CTG	2	6	2077151	2077156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480498
51459	NC_012029	CCG	2	6	2077203	2077208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480498
51460	NC_012029	TC	3	6	2077266	2077271	0 %	50 %	0 %	50 %	222480498
51461	NC_012029	GTA	2	6	2077303	2077308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480498
51462	NC_012029	CGA	2	6	2077335	2077340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480498
51463	NC_012029	TCG	2	6	2077349	2077354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480498
51464	NC_012029	GGT	2	6	2077390	2077395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480498
51465	NC_012029	TCC	2	6	2077466	2077471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480498
51466	NC_012029	CTCG	2	8	2077473	2077480	0 %	25 %	25 %	50 %	222480498
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51476	NC_012029	CTG	2	6	2078352	2078357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480500
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51480	NC_012029	TGA	2	6	2078450	2078455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480500
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