MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 9430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012028	TC	3	6	211572	211577	0 %	50 %	0 %	50 %	222475874
3502	NC_012028	CGC	2	6	211606	211611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475874
3503	NC_012028	GA	3	6	211797	211802	50 %	0 %	50 %	0 %	222475874
3504	NC_012028	GTT	2	6	212004	212009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475874
3505	NC_012028	ACC	2	6	212059	212064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475874
3506	NC_012028	AAC	2	6	212072	212077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475874
3507	NC_012028	GT	3	6	212088	212093	0 %	50 %	50 %	0 %	222475874
3508	NC_012028	CCA	2	6	212112	212117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475874
3509	NC_012028	GA	3	6	212249	212254	50 %	0 %	50 %	0 %	222475874
3510	NC_012028	CCG	2	6	212258	212263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475874
3511	NC_012028	CGG	2	6	212268	212273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475874
3512	NC_012028	CCG	2	6	212301	212306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475874
3513	NC_012028	CGT	2	6	212481	212486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475874
3514	NC_012028	ACCGA	2	10	212528	212537	40 %	0 %	20 %	40 %	222475874
3515	NC_012028	CCGTG	2	10	212538	212547	0 %	20 %	40 %	40 %	222475874
3516	NC_012028	GTC	2	6	213065	213070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475875
3517	NC_012028	GAG	2	6	213128	213133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475875
3518	NC_012028	GGT	2	6	213227	213232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475875
3519	NC_012028	ACT	2	6	213250	213255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475875
3520	NC_012028	CA	3	6	213284	213289	50 %	0 %	0 %	50 %	222475875
3521	NC_012028	ATC	2	6	213365	213370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475875
3522	NC_012028	CT	3	6	213445	213450	0 %	50 %	0 %	50 %	222475875
3523	NC_012028	GATGC	2	10	213455	213464	20 %	20 %	40 %	20 %	222475875
3524	NC_012028	CTT	2	6	213469	213474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475875
3525	NC_012028	GGA	2	6	213524	213529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475875
3526	NC_012028	CTA	2	6	213556	213561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475875
3527	NC_012028	CTG	2	6	213575	213580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475875
3528	NC_012028	CGG	2	6	213898	213903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475875
3529	NC_012028	CGG	2	6	213925	213930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475875
3530	NC_012028	CGA	2	6	213942	213947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475875
3531	NC_012028	GCC	2	6	213950	213955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475875
3532	NC_012028	GCC	2	6	213971	213976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475875
3533	NC_012028	CG	4	8	214006	214013	0 %	0 %	50 %	50 %	222475875
3534	NC_012028	CGA	2	6	214024	214029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475875
3535	NC_012028	AC	3	6	214035	214040	50 %	0 %	0 %	50 %	222475875
3536	NC_012028	CGT	2	6	214041	214046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475875
3537	NC_012028	TCC	2	6	214076	214081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475875
3538	NC_012028	CAT	2	6	214497	214502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475876
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3540	NC_012028	GAG	2	6	214546	214551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475876
3541	NC_012028	TCG	2	6	214583	214588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475876
3542	NC_012028	TCG	2	6	214595	214600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475876
3543	NC_012028	CGG	2	6	214644	214649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475876
3544	NC_012028	GCTCGG	2	12	214650	214661	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222475876
3545	NC_012028	CGTGGA	2	12	214700	214711	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222475876
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3548	NC_012028	ACA	2	6	214946	214951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475876
3549	NC_012028	TCGT	2	8	215052	215059	0 %	50 %	25 %	25 %	222475876
3550	NC_012028	ACG	2	6	215102	215107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475876
3551	NC_012028	GAG	2	6	215146	215151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475876
3552	NC_012028	GA	3	6	215156	215161	50 %	0 %	50 %	0 %	222475876
3553	NC_012028	CAG	2	6	215194	215199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475876
3554	NC_012028	CTA	2	6	215205	215210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475876
3555	NC_012028	GAG	2	6	215260	215265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475876
3556	NC_012028	CGCC	2	8	215267	215274	0 %	0 %	25 %	75 %	222475876
3557	NC_012028	CCG	2	6	215345	215350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475876
3558	NC_012028	GCGCC	2	10	215355	215364	0 %	0 %	40 %	60 %	222475876
3559	NC_012028	GGT	2	6	215432	215437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475876
3560	NC_012028	CCG	2	6	215442	215447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475876
3561	NC_012028	GAC	2	6	215512	215517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475876
3562	NC_012028	GGA	2	6	215565	215570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475876
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3564	NC_012028	AGTGG	2	10	215626	215635	20 %	20 %	60 %	0 %	222475877
3565	NC_012028	GCC	2	6	215663	215668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475877
3566	NC_012028	GTT	2	6	215687	215692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475877
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3569	NC_012028	CGA	2	6	215815	215820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
3570	NC_012028	CA	3	6	215832	215837	50 %	0 %	0 %	50 %	222475877
3571	NC_012028	CACCG	2	10	215845	215854	20 %	0 %	20 %	60 %	222475877
3572	NC_012028	GCC	2	6	215855	215860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475877
3573	NC_012028	AC	3	6	215871	215876	50 %	0 %	0 %	50 %	222475877
3574	NC_012028	GAC	3	9	215902	215910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
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3577	NC_012028	GAAC	2	8	216034	216041	50 %	0 %	25 %	25 %	222475877
3578	NC_012028	TGA	2	6	216055	216060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475877
3579	NC_012028	TACC	2	8	216100	216107	25 %	25 %	0 %	50 %	222475877
3580	NC_012028	GC	3	6	216115	216120	0 %	0 %	50 %	50 %	222475877
3581	NC_012028	GCC	2	6	216128	216133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475877
3582	NC_012028	GC	3	6	216159	216164	0 %	0 %	50 %	50 %	222475877
3583	NC_012028	CGA	2	6	216202	216207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
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3585	NC_012028	TGA	2	6	216256	216261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475877
3586	NC_012028	ATCG	2	8	216355	216362	25 %	25 %	25 %	25 %	222475877
3587	NC_012028	CAC	2	6	216396	216401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475877
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3589	NC_012028	GTC	2	6	216467	216472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475877
3590	NC_012028	TCGA	2	8	216569	216576	25 %	25 %	25 %	25 %	222475877
3591	NC_012028	ATC	2	6	216599	216604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475877
3592	NC_012028	AAC	2	6	216617	216622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475877
3593	NC_012028	CGG	2	6	216667	216672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475877
3594	NC_012028	CTT	2	6	216793	216798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475877
3595	NC_012028	GACG	2	8	216828	216835	25 %	0 %	50 %	25 %	222475877
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3600	NC_012028	CGCCA	2	10	217061	217070	20 %	0 %	20 %	60 %	222475877
3601	NC_012028	ACG	2	6	217101	217106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
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3603	NC_012028	CAG	2	6	217153	217158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
3604	NC_012028	GCT	2	6	217177	217182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475877
3605	NC_012028	CGAG	2	8	217198	217205	25 %	0 %	50 %	25 %	222475877
3606	NC_012028	CAT	2	6	217255	217260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475877
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3608	NC_012028	TTC	2	6	217358	217363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475877
3609	NC_012028	GCC	2	6	217445	217450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475877
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3613	NC_012028	CGA	2	6	218552	218557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475878
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3615	NC_012028	GCCA	2	8	218716	218723	25 %	0 %	25 %	50 %	222475878
3616	NC_012028	ATC	2	6	218725	218730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475878
3617	NC_012028	ACTCG	2	10	218736	218745	20 %	20 %	20 %	40 %	222475878
3618	NC_012028	CA	3	6	218871	218876	50 %	0 %	0 %	50 %	222475878
3619	NC_012028	GTC	2	6	218955	218960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475878
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3621	NC_012028	ACC	2	6	218977	218982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475878
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3730	NC_012028	GTC	2	6	225024	225029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475881
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3732	NC_012028	GTG	2	6	225135	225140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475881
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3736	NC_012028	GTCA	2	8	225803	225810	25 %	25 %	25 %	25 %	222475882
3737	NC_012028	CGGTGA	2	12	225815	225826	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222475882
3738	NC_012028	CGA	2	6	225890	225895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475882
3739	NC_012028	ACT	2	6	225952	225957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475882
3740	NC_012028	GCT	2	6	225971	225976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475882
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3743	NC_012028	ATC	2	6	226089	226094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475882
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3981	NC_012028	GAC	2	6	239482	239487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475889
3982	NC_012028	CG	3	6	239556	239561	0 %	0 %	50 %	50 %	222475889
3983	NC_012028	GAA	2	6	239565	239570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475889
3984	NC_012028	AGT	2	6	239620	239625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475889
3985	NC_012028	TTC	2	6	239638	239643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475889
3986	NC_012028	GCT	2	6	239721	239726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475889
3987	NC_012028	ATC	2	6	239758	239763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475889
3988	NC_012028	GTAC	2	8	239885	239892	25 %	25 %	25 %	25 %	222475889
3989	NC_012028	CGC	2	6	239937	239942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475889
3990	NC_012028	CAC	2	6	239963	239968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475889
3991	NC_012028	ACT	2	6	239984	239989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475889
3992	NC_012028	CGACAA	2	12	240041	240052	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222475889
3993	NC_012028	GCT	2	6	240072	240077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475889
3994	NC_012028	GTG	3	9	240082	240090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475889
3995	NC_012028	GGCG	2	8	240154	240161	0 %	0 %	75 %	25 %	222475889
3996	NC_012028	TGG	3	9	240169	240177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475889
3997	NC_012028	CGA	2	6	240205	240210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475889
3998	NC_012028	GAC	2	6	240265	240270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475889
3999	NC_012028	ACC	2	6	240285	240290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475889
4000	NC_012028	TGG	2	6	240475	240480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475890

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