MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 9430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_012028	ACT	2	6	147268	147273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475810
2503	NC_012028	GGA	2	6	147302	147307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475810
2504	NC_012028	CGA	2	6	147332	147337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475810
2505	NC_012028	GGC	2	6	147384	147389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475810
2506	NC_012028	TCC	2	6	147406	147411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475810
2507	NC_012028	TCGC	2	8	147414	147421	0 %	25 %	25 %	50 %	222475810
2508	NC_012028	CGAAC	2	10	147431	147440	40 %	0 %	20 %	40 %	222475810
2509	NC_012028	GAA	2	6	147441	147446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475810
2510	NC_012028	CGT	2	6	147506	147511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475810
2511	NC_012028	TCC	2	6	147526	147531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475810
2512	NC_012028	CGA	2	6	147560	147565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475810
2513	NC_012028	TTG	2	6	147654	147659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475811
2514	NC_012028	ACT	2	6	147693	147698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475811
2515	NC_012028	TGC	2	6	147709	147714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475811
2516	NC_012028	GCT	2	6	147793	147798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475811
2517	NC_012028	GTC	2	6	147872	147877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475811
2518	NC_012028	CGA	2	6	147910	147915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475811
2519	NC_012028	TCG	2	6	147918	147923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475811
2520	NC_012028	ACC	2	6	147927	147932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475811
2521	NC_012028	CCA	2	6	147943	147948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475811
2522	NC_012028	TTC	2	6	147956	147961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475811
2523	NC_012028	GTG	2	6	147962	147967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475811
2524	NC_012028	CGA	2	6	147969	147974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475811
2525	NC_012028	GC	3	6	148062	148067	0 %	0 %	50 %	50 %	222475811
2526	NC_012028	ACG	2	6	148086	148091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475811
2527	NC_012028	CGT	2	6	148144	148149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475811
2528	NC_012028	GT	3	6	148479	148484	0 %	50 %	50 %	0 %	222475812
2529	NC_012028	GCT	2	6	148598	148603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475812
2530	NC_012028	ACA	2	6	148628	148633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475812
2531	NC_012028	GGT	2	6	148647	148652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475812
2532	NC_012028	CGC	2	6	148678	148683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475812
2533	NC_012028	TTCTG	2	10	148703	148712	0 %	60 %	20 %	20 %	222475812
2534	NC_012028	ACC	2	6	148731	148736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475812
2535	NC_012028	TCG	2	6	148750	148755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475812
2536	NC_012028	TCG	2	6	148782	148787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475812
2537	NC_012028	CAA	2	6	148827	148832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475812
2538	NC_012028	GTC	2	6	148835	148840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475812
2539	NC_012028	TA	3	6	148866	148871	50 %	50 %	0 %	0 %	222475812
2540	NC_012028	AC	3	6	148968	148973	50 %	0 %	0 %	50 %	222475812
2541	NC_012028	CGT	2	6	149011	149016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475812
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2543	NC_012028	GCC	2	6	149141	149146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475812
2544	NC_012028	AC	3	6	149154	149159	50 %	0 %	0 %	50 %	222475812
2545	NC_012028	TGC	2	6	149206	149211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475812
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2547	NC_012028	GACC	2	8	149413	149420	25 %	0 %	25 %	50 %	222475812
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2549	NC_012028	GAG	2	6	149543	149548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475812
2550	NC_012028	GGC	2	6	149557	149562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475812
2551	NC_012028	GAC	2	6	149609	149614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475812
2552	NC_012028	TC	4	8	149678	149685	0 %	50 %	0 %	50 %	222475812
2553	NC_012028	GTCG	2	8	149686	149693	0 %	25 %	50 %	25 %	222475812
2554	NC_012028	GAT	2	6	149744	149749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475812
2555	NC_012028	CGG	2	6	149824	149829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475812
2556	NC_012028	CGA	2	6	149887	149892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475812
2557	NC_012028	GAG	2	6	149954	149959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475812
2558	NC_012028	GGT	2	6	150041	150046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475812
2559	NC_012028	TG	3	6	150298	150303	0 %	50 %	50 %	0 %	222475813
2560	NC_012028	TC	3	6	150399	150404	0 %	50 %	0 %	50 %	222475813
2561	NC_012028	GAC	2	6	150429	150434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475813
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2563	NC_012028	CTG	2	6	150471	150476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475813
2564	NC_012028	TCG	2	6	150732	150737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475814
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2567	NC_012028	GCT	2	6	150764	150769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475814
2568	NC_012028	AGA	2	6	150834	150839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475814
2569	NC_012028	TAC	2	6	150947	150952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475814
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2572	NC_012028	TCG	2	6	151053	151058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475814
2573	NC_012028	CTA	2	6	151075	151080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475814
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2579	NC_012028	GTC	2	6	151220	151225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475814
2580	NC_012028	TCC	2	6	151257	151262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475814
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2582	NC_012028	TAC	2	6	151307	151312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475814
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2584	NC_012028	AC	4	8	151599	151606	50 %	0 %	0 %	50 %	222475815
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2587	NC_012028	GCTC	2	8	151831	151838	0 %	25 %	25 %	50 %	222475815
2588	NC_012028	CGC	2	6	151859	151864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475815
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2593	NC_012028	GTGG	2	8	152292	152299	0 %	25 %	75 %	0 %	222475816
2594	NC_012028	CGA	2	6	152304	152309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475816
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2599	NC_012028	CCA	2	6	152410	152415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475816
2600	NC_012028	ACG	2	6	152427	152432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475816
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2602	NC_012028	CTC	2	6	152498	152503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475816
2603	NC_012028	GAG	2	6	152504	152509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475816
2604	NC_012028	TCG	2	6	152687	152692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475817
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2606	NC_012028	GTGA	2	8	152916	152923	25 %	25 %	50 %	0 %	222475817
2607	NC_012028	AGG	2	6	153063	153068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475818
2608	NC_012028	TCAC	2	8	153072	153079	25 %	25 %	0 %	50 %	222475818
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2610	NC_012028	CCTG	2	8	153232	153239	0 %	25 %	25 %	50 %	222475818
2611	NC_012028	GC	3	6	153248	153253	0 %	0 %	50 %	50 %	222475818
2612	NC_012028	TGG	2	6	153293	153298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475818
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2618	NC_012028	GAA	2	6	153690	153695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475819
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2620	NC_012028	CCAC	2	8	153714	153721	25 %	0 %	0 %	75 %	222475819
2621	NC_012028	GAA	2	6	153750	153755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475819
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2727	NC_012028	GT	3	6	158919	158924	0 %	50 %	50 %	0 %	222475827
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2861	NC_012028	AGA	2	6	173689	173694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475836
2862	NC_012028	CG	3	6	173708	173713	0 %	0 %	50 %	50 %	222475836
2863	NC_012028	CGG	2	6	173758	173763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475836
2864	NC_012028	GAC	2	6	173784	173789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475836
2865	NC_012028	GAC	2	6	173796	173801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475836
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2867	NC_012028	CGT	3	9	173882	173890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475836
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2875	NC_012028	G	6	6	174237	174242	0 %	0 %	100 %	0 %	222475837
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2972	NC_012028	CGA	2	6	179197	179202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475841
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2976	NC_012028	CGA	2	6	179966	179971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475842
2977	NC_012028	ACGG	2	8	180070	180077	25 %	0 %	50 %	25 %	222475842
2978	NC_012028	GAG	2	6	180301	180306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475843
2979	NC_012028	GTC	2	6	180369	180374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475843
2980	NC_012028	ATC	2	6	180378	180383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475843
2981	NC_012028	TG	3	6	180390	180395	0 %	50 %	50 %	0 %	222475843
2982	NC_012028	AGG	2	6	180475	180480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475843
2983	NC_012028	TTC	2	6	180544	180549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475843
2984	NC_012028	TC	3	6	180548	180553	0 %	50 %	0 %	50 %	222475843
2985	NC_012028	ATC	2	6	180573	180578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475843
2986	NC_012028	TTCT	2	8	180585	180592	0 %	75 %	0 %	25 %	222475843
2987	NC_012028	CT	3	6	180608	180613	0 %	50 %	0 %	50 %	222475843
2988	NC_012028	TGA	2	6	180616	180621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475843
2989	NC_012028	CGA	2	6	180635	180640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475843
2990	NC_012028	CTC	2	6	180693	180698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475843
2991	NC_012028	TCA	2	6	180763	180768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475843
2992	NC_012028	TGA	2	6	180772	180777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475843
2993	NC_012028	TTC	2	6	180850	180855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475843
2994	NC_012028	CGA	2	6	181530	181535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475844
2995	NC_012028	GTC	2	6	181594	181599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475844
2996	NC_012028	TCA	2	6	181634	181639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475844
2997	NC_012028	GAC	2	6	181683	181688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475844
2998	NC_012028	AAG	2	6	181702	181707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475844
2999	NC_012028	TTC	2	6	181780	181785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475844
3000	NC_012028	CCG	2	6	181823	181828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475844

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