MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 51990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011899	CCA	2	6	164434	164439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931007
3002	NC_011899	ATT	2	6	164470	164475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931007
3003	NC_011899	GAA	3	9	164514	164522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931007
3004	NC_011899	TTG	2	6	164542	164547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931007
3005	NC_011899	ATT	2	6	164557	164562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931007
3006	NC_011899	A	7	7	164696	164702	100 %	0 %	0 %	0 %	220931007
3007	NC_011899	TCC	2	6	164723	164728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220931007
3008	NC_011899	ATT	2	6	164776	164781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931007
3009	NC_011899	AAT	2	6	164816	164821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931007
3010	NC_011899	GCA	2	6	164877	164882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220931007
3011	NC_011899	ATA	2	6	164972	164977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931008
3012	NC_011899	ATA	2	6	164988	164993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931008
3013	NC_011899	TCA	2	6	164999	165004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931008
3014	NC_011899	A	6	6	165014	165019	100 %	0 %	0 %	0 %	220931008
3015	NC_011899	GGT	2	6	165033	165038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931008
3016	NC_011899	TAG	2	6	165075	165080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931008
3017	NC_011899	TGA	2	6	165106	165111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931008
3018	NC_011899	CAG	2	6	165126	165131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220931008
3019	NC_011899	CAA	2	6	165160	165165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931008
3020	NC_011899	GAA	2	6	165176	165181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931008
3021	NC_011899	TAT	2	6	165185	165190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931008
3022	NC_011899	TAA	2	6	165201	165206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931008
3023	NC_011899	ATG	2	6	165216	165221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931008
3024	NC_011899	AT	3	6	165284	165289	50 %	50 %	0 %	0 %	220931008
3025	NC_011899	AGG	2	6	165355	165360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931008
3026	NC_011899	ATT	2	6	165376	165381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931008
3027	NC_011899	ATT	2	6	165384	165389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931008
3028	NC_011899	ATA	2	6	165390	165395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931008
3029	NC_011899	AAG	2	6	165454	165459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931008
3030	NC_011899	TAT	2	6	165463	165468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931008
3031	NC_011899	AAT	2	6	165590	165595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931008
3032	NC_011899	GAA	2	6	165863	165868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931008
3033	NC_011899	ACA	2	6	165871	165876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931008
3034	NC_011899	AAT	2	6	165917	165922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931008
3035	NC_011899	AAT	2	6	165926	165931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931008
3036	NC_011899	A	6	6	165975	165980	100 %	0 %	0 %	0 %	220931008
3037	NC_011899	AT	3	6	166033	166038	50 %	50 %	0 %	0 %	220931008
3038	NC_011899	GAT	2	6	166085	166090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931008
3039	NC_011899	CGC	2	6	166139	166144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220931008
3040	NC_011899	ATG	2	6	166178	166183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931008
3041	NC_011899	TTA	2	6	166263	166268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931008
3042	NC_011899	GGA	2	6	166285	166290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931008
3043	NC_011899	TCTT	2	8	166304	166311	0 %	75 %	0 %	25 %	220931008
3044	NC_011899	ATAAG	2	10	166326	166335	60 %	20 %	20 %	0 %	220931008
3045	NC_011899	AAT	2	6	166340	166345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931008
3046	NC_011899	ACC	2	6	166357	166362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931008
3047	NC_011899	AT	3	6	166424	166429	50 %	50 %	0 %	0 %	220931008
3048	NC_011899	AAT	2	6	166436	166441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931008
3049	NC_011899	TG	3	6	166484	166489	0 %	50 %	50 %	0 %	220931008
3050	NC_011899	GAA	2	6	166490	166495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931008
3051	NC_011899	CTGA	2	8	166500	166507	25 %	25 %	25 %	25 %	220931008
3052	NC_011899	AT	5	10	166604	166613	50 %	50 %	0 %	0 %	220931009
3053	NC_011899	ATT	2	6	166636	166641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931009
3054	NC_011899	AATG	2	8	166664	166671	50 %	25 %	25 %	0 %	220931009
3055	NC_011899	AGG	2	6	166696	166701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931009
3056	NC_011899	TAA	2	6	166703	166708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931009
3057	NC_011899	A	6	6	166887	166892	100 %	0 %	0 %	0 %	220931009
3058	NC_011899	GGAA	2	8	166948	166955	50 %	0 %	50 %	0 %	220931009
3059	NC_011899	TGGA	2	8	166989	166996	25 %	25 %	50 %	0 %	220931009
3060	NC_011899	A	6	6	166996	167001	100 %	0 %	0 %	0 %	220931009
3061	NC_011899	TGAAA	2	10	167042	167051	60 %	20 %	20 %	0 %	220931009
3062	NC_011899	ATG	2	6	167071	167076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931009
3063	NC_011899	TGA	2	6	167078	167083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931009
3064	NC_011899	CAGA	2	8	167213	167220	50 %	0 %	25 %	25 %	220931009
3065	NC_011899	ATT	2	6	167226	167231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931009
3066	NC_011899	AT	3	6	167252	167257	50 %	50 %	0 %	0 %	220931009
3067	NC_011899	GCC	2	6	167337	167342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220931009
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3069	NC_011899	TGC	2	6	167420	167425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931009
3070	NC_011899	TAT	2	6	167462	167467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931009
3071	NC_011899	GTT	2	6	167499	167504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931009
3072	NC_011899	CGG	2	6	167509	167514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220931009
3073	NC_011899	AGT	2	6	167531	167536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931009
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3080	NC_011899	ATA	2	6	167867	167872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931010
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3082	NC_011899	ATA	2	6	167904	167909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931010
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3087	NC_011899	ATA	2	6	168120	168125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931010
3088	NC_011899	AT	4	8	168147	168154	50 %	50 %	0 %	0 %	220931010
3089	NC_011899	TTA	2	6	168259	168264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931010
3090	NC_011899	AAT	2	6	168320	168325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931010
3091	NC_011899	AGG	2	6	168333	168338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931010
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3093	NC_011899	TC	3	6	168375	168380	0 %	50 %	0 %	50 %	220931010
3094	NC_011899	AT	5	10	169090	169099	50 %	50 %	0 %	0 %	220931011
3095	NC_011899	ATTTAA	2	12	169105	169116	50 %	50 %	0 %	0 %	220931011
3096	NC_011899	TTC	2	6	169117	169122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931011
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3098	NC_011899	A	7	7	169182	169188	100 %	0 %	0 %	0 %	220931011
3099	NC_011899	ACTT	2	8	169202	169209	25 %	50 %	0 %	25 %	220931011
3100	NC_011899	TGGG	2	8	169342	169349	0 %	25 %	75 %	0 %	220931011
3101	NC_011899	TAA	2	6	169515	169520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931012
3102	NC_011899	T	7	7	169549	169555	0 %	100 %	0 %	0 %	220931012
3103	NC_011899	AGA	2	6	169591	169596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931012
3104	NC_011899	GAAAA	2	10	169607	169616	80 %	0 %	20 %	0 %	220931012
3105	NC_011899	CTG	2	6	169628	169633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931012
3106	NC_011899	CT	3	6	169638	169643	0 %	50 %	0 %	50 %	220931012
3107	NC_011899	T	6	6	169643	169648	0 %	100 %	0 %	0 %	220931012
3108	NC_011899	ATTT	2	8	169704	169711	25 %	75 %	0 %	0 %	220931012
3109	NC_011899	T	7	7	169726	169732	0 %	100 %	0 %	0 %	220931012
3110	NC_011899	TCA	2	6	169746	169751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931012
3111	NC_011899	TGGT	2	8	169787	169794	0 %	50 %	50 %	0 %	220931012
3112	NC_011899	GGTA	2	8	169804	169811	25 %	25 %	50 %	0 %	220931012
3113	NC_011899	AGA	2	6	169842	169847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931012
3114	NC_011899	GA	3	6	169865	169870	50 %	0 %	50 %	0 %	220931012
3115	NC_011899	ATG	2	6	169931	169936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931012
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3117	NC_011899	A	6	6	169964	169969	100 %	0 %	0 %	0 %	220931012
3118	NC_011899	AGA	2	6	170073	170078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931012
3119	NC_011899	ACA	2	6	170191	170196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931012
3120	NC_011899	AG	3	6	170217	170222	50 %	0 %	50 %	0 %	220931012
3121	NC_011899	AAATAG	2	12	170226	170237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	220931012
3122	NC_011899	ACT	2	6	170270	170275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931012
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3496	NC_011899	GGA	2	6	189014	189019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931030
3497	NC_011899	TAA	2	6	189031	189036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931030
3498	NC_011899	CCG	2	6	189136	189141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220931030
3499	NC_011899	AC	3	6	189184	189189	50 %	0 %	0 %	50 %	220931030
3500	NC_011899	GAA	2	6	189197	189202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931030

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