MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 51990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_011899	AAAGTA	2	12	640349	640360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	220931429
12503	NC_011899	CCA	2	6	640361	640366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931429
12504	NC_011899	GATAT	2	10	640385	640394	40 %	40 %	20 %	0 %	220931429
12505	NC_011899	A	8	8	640436	640443	100 %	0 %	0 %	0 %	220931429
12506	NC_011899	TTA	2	6	640449	640454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931429
12507	NC_011899	ATGTT	2	10	640485	640494	20 %	60 %	20 %	0 %	220931429
12508	NC_011899	A	7	7	640514	640520	100 %	0 %	0 %	0 %	220931429
12509	NC_011899	AAT	2	6	640542	640547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931429
12510	NC_011899	T	7	7	640617	640623	0 %	100 %	0 %	0 %	220931430
12511	NC_011899	ATTA	2	8	640633	640640	50 %	50 %	0 %	0 %	220931430
12512	NC_011899	T	6	6	640642	640647	0 %	100 %	0 %	0 %	220931430
12513	NC_011899	TA	3	6	640673	640678	50 %	50 %	0 %	0 %	220931430
12514	NC_011899	GAA	4	12	640715	640726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931430
12515	NC_011899	AT	3	6	640729	640734	50 %	50 %	0 %	0 %	220931430
12516	NC_011899	GAA	2	6	640757	640762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931430
12517	NC_011899	AT	3	6	640770	640775	50 %	50 %	0 %	0 %	220931430
12518	NC_011899	A	6	6	640813	640818	100 %	0 %	0 %	0 %	220931430
12519	NC_011899	ATTA	2	8	640873	640880	50 %	50 %	0 %	0 %	220931430
12520	NC_011899	ATG	2	6	640896	640901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931430
12521	NC_011899	A	8	8	640906	640913	100 %	0 %	0 %	0 %	220931430
12522	NC_011899	TGC	2	6	640930	640935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931430
12523	NC_011899	A	7	7	640978	640984	100 %	0 %	0 %	0 %	220931430
12524	NC_011899	CCT	2	6	640999	641004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220931430
12525	NC_011899	CAA	2	6	641086	641091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931430
12526	NC_011899	A	6	6	641097	641102	100 %	0 %	0 %	0 %	220931430
12527	NC_011899	TGA	2	6	641107	641112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931430
12528	NC_011899	AAC	2	6	641115	641120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931430
12529	NC_011899	TAA	2	6	641125	641130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931430
12530	NC_011899	A	7	7	641262	641268	100 %	0 %	0 %	0 %	220931430
12531	NC_011899	TAT	2	6	641472	641477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931431
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12533	NC_011899	TGA	2	6	641606	641611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931431
12534	NC_011899	AG	3	6	641615	641620	50 %	0 %	50 %	0 %	220931431
12535	NC_011899	GGAT	2	8	641761	641768	25 %	25 %	50 %	0 %	220931431
12536	NC_011899	GTT	2	6	641798	641803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931431
12537	NC_011899	TAC	2	6	641837	641842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931431
12538	NC_011899	AG	3	6	641868	641873	50 %	0 %	50 %	0 %	220931431
12539	NC_011899	TAC	2	6	641879	641884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931431
12540	NC_011899	GTT	2	6	641909	641914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931431
12541	NC_011899	T	6	6	641913	641918	0 %	100 %	0 %	0 %	220931431
12542	NC_011899	TAA	2	6	641931	641936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931431
12543	NC_011899	GAAA	2	8	641958	641965	75 %	0 %	25 %	0 %	220931432
12544	NC_011899	A	6	6	641963	641968	100 %	0 %	0 %	0 %	220931432
12545	NC_011899	CTG	2	6	641989	641994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931432
12546	NC_011899	TATT	2	8	642005	642012	25 %	75 %	0 %	0 %	220931432
12547	NC_011899	TAT	2	6	642043	642048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931432
12548	NC_011899	A	6	6	642073	642078	100 %	0 %	0 %	0 %	220931432
12549	NC_011899	AGAT	2	8	642146	642153	50 %	25 %	25 %	0 %	220931432
12550	NC_011899	A	7	7	642200	642206	100 %	0 %	0 %	0 %	220931432
12551	NC_011899	GAT	2	6	642295	642300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931432
12552	NC_011899	CTT	2	6	642307	642312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931432
12553	NC_011899	AAGGT	2	10	642353	642362	40 %	20 %	40 %	0 %	220931432
12554	NC_011899	TTC	2	6	642431	642436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931432
12555	NC_011899	CAGTT	2	10	642445	642454	20 %	40 %	20 %	20 %	220931432
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12557	NC_011899	AGC	2	6	642513	642518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220931432
12558	NC_011899	CCTA	2	8	642535	642542	25 %	25 %	0 %	50 %	220931432
12559	NC_011899	CAA	2	6	642596	642601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931432
12560	NC_011899	CCTTT	2	10	642765	642774	0 %	60 %	0 %	40 %	220931433
12561	NC_011899	TCA	2	6	642788	642793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931433
12562	NC_011899	T	6	6	642840	642845	0 %	100 %	0 %	0 %	220931433
12563	NC_011899	CAT	2	6	642846	642851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931433
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12565	NC_011899	T	6	6	642874	642879	0 %	100 %	0 %	0 %	220931433
12566	NC_011899	TCC	2	6	642921	642926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220931433
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12573	NC_011899	A	8	8	643334	643341	100 %	0 %	0 %	0 %	220931434
12574	NC_011899	CAT	4	12	643464	643475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931434
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12592	NC_011899	A	6	6	644583	644588	100 %	0 %	0 %	0 %	220931436
12593	NC_011899	A	7	7	644606	644612	100 %	0 %	0 %	0 %	220931436
12594	NC_011899	TAC	2	6	644712	644717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931436
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12598	NC_011899	ATT	2	6	644779	644784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931436
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12604	NC_011899	TTG	2	6	645211	645216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931436
12605	NC_011899	ATT	2	6	645327	645332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931436
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12609	NC_011899	T	7	7	645398	645404	0 %	100 %	0 %	0 %	220931436
12610	NC_011899	GTA	2	6	645462	645467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931436
12611	NC_011899	TGGT	2	8	645472	645479	0 %	50 %	50 %	0 %	220931436
12612	NC_011899	T	7	7	645515	645521	0 %	100 %	0 %	0 %	220931436
12613	NC_011899	AGG	2	6	645522	645527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931436
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12615	NC_011899	ACA	2	6	645714	645719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931436
12616	NC_011899	AT	3	6	645722	645727	50 %	50 %	0 %	0 %	220931436
12617	NC_011899	ATA	2	6	645733	645738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931436
12618	NC_011899	TTA	2	6	645747	645752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931436
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12620	NC_011899	A	6	6	645989	645994	100 %	0 %	0 %	0 %	220931437
12621	NC_011899	TAT	2	6	646037	646042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931437
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