MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 51990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_011899	ATT	2	6	540842	540847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931342
10503	NC_011899	AAAGAA	2	12	540855	540866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	220931342
10504	NC_011899	CTGG	2	8	540872	540879	0 %	25 %	50 %	25 %	220931342
10505	NC_011899	TTC	2	6	541276	541281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931343
10506	NC_011899	AAGT	2	8	541295	541302	50 %	25 %	25 %	0 %	220931343
10507	NC_011899	ATC	2	6	541318	541323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931343
10508	NC_011899	ATA	2	6	541349	541354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931343
10509	NC_011899	T	6	6	541378	541383	0 %	100 %	0 %	0 %	220931343
10510	NC_011899	TTC	2	6	541423	541428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931343
10511	NC_011899	TTA	2	6	541514	541519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931343
10512	NC_011899	T	6	6	541534	541539	0 %	100 %	0 %	0 %	220931343
10513	NC_011899	ATT	2	6	541567	541572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931343
10514	NC_011899	GCT	2	6	541574	541579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931343
10515	NC_011899	TTTC	2	8	541599	541606	0 %	75 %	0 %	25 %	220931343
10516	NC_011899	TTA	2	6	541631	541636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931343
10517	NC_011899	C	7	7	541657	541663	0 %	0 %	0 %	100 %	220931343
10518	NC_011899	TTGT	2	8	541665	541672	0 %	75 %	25 %	0 %	220931343
10519	NC_011899	T	7	7	541675	541681	0 %	100 %	0 %	0 %	220931343
10520	NC_011899	A	6	6	541718	541723	100 %	0 %	0 %	0 %	220931343
10521	NC_011899	GGTT	2	8	541740	541747	0 %	50 %	50 %	0 %	220931343
10522	NC_011899	T	6	6	541820	541825	0 %	100 %	0 %	0 %	220931343
10523	NC_011899	TTG	2	6	541835	541840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931343
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10525	NC_011899	CTTT	2	8	541889	541896	0 %	75 %	0 %	25 %	220931343
10526	NC_011899	CAT	2	6	541914	541919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931343
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10533	NC_011899	T	7	7	542458	542464	0 %	100 %	0 %	0 %	220931344
10534	NC_011899	TTCT	2	8	542513	542520	0 %	75 %	0 %	25 %	220931344
10535	NC_011899	GCA	2	6	542523	542528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220931344
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10537	NC_011899	GA	3	6	542636	542641	50 %	0 %	50 %	0 %	220931344
10538	NC_011899	CTCC	2	8	542690	542697	0 %	25 %	0 %	75 %	220931344
10539	NC_011899	CTC	2	6	542708	542713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220931344
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10544	NC_011899	A	6	6	542886	542891	100 %	0 %	0 %	0 %	220931344
10545	NC_011899	TA	3	6	542896	542901	50 %	50 %	0 %	0 %	220931344
10546	NC_011899	GGA	2	6	543076	543081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931344
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10548	NC_011899	GCA	2	6	543123	543128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220931344
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10552	NC_011899	GTTC	2	8	543228	543235	0 %	50 %	25 %	25 %	220931344
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10555	NC_011899	G	6	6	543305	543310	0 %	0 %	100 %	0 %	220931344
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10559	NC_011899	TTA	2	6	543564	543569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931344
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10582	NC_011899	A	6	6	544718	544723	100 %	0 %	0 %	0 %	220931346
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10595	NC_011899	T	6	6	545294	545299	0 %	100 %	0 %	0 %	220931346
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10605	NC_011899	ATTT	2	8	546124	546131	25 %	75 %	0 %	0 %	220931347
10606	NC_011899	AAG	2	6	546175	546180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931347
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10988	NC_011899	AGC	3	9	564875	564883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220931362
10989	NC_011899	TAA	2	6	564974	564979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931362
10990	NC_011899	TA	3	6	565040	565045	50 %	50 %	0 %	0 %	220931362
10991	NC_011899	ATG	2	6	565063	565068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931362
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