MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 51990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011899	A	6	6	289234	289239	100 %	0 %	0 %	0 %	220931133
5502	NC_011899	TGG	2	6	289242	289247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931133
5503	NC_011899	A	7	7	289269	289275	100 %	0 %	0 %	0 %	220931133
5504	NC_011899	TAT	2	6	289389	289394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931134
5505	NC_011899	GACA	2	8	289401	289408	50 %	0 %	25 %	25 %	220931134
5506	NC_011899	TA	3	6	289412	289417	50 %	50 %	0 %	0 %	220931134
5507	NC_011899	TGT	2	6	289458	289463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931134
5508	NC_011899	AG	3	6	289474	289479	50 %	0 %	50 %	0 %	220931134
5509	NC_011899	AGA	2	6	289491	289496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931134
5510	NC_011899	CTG	2	6	289502	289507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931134
5511	NC_011899	T	6	6	289511	289516	0 %	100 %	0 %	0 %	220931134
5512	NC_011899	ATT	2	6	289519	289524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931134
5513	NC_011899	A	6	6	289528	289533	100 %	0 %	0 %	0 %	220931134
5514	NC_011899	GGTTGA	2	12	289543	289554	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220931134
5515	NC_011899	ATG	2	6	289563	289568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931134
5516	NC_011899	AAC	2	6	289581	289586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931134
5517	NC_011899	ATAG	2	8	289622	289629	50 %	25 %	25 %	0 %	220931134
5518	NC_011899	TAT	2	6	289637	289642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931134
5519	NC_011899	ATA	2	6	289662	289667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931134
5520	NC_011899	TTG	2	6	289686	289691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931134
5521	NC_011899	GGA	2	6	289710	289715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931134
5522	NC_011899	A	6	6	289715	289720	100 %	0 %	0 %	0 %	220931134
5523	NC_011899	TAT	2	6	289729	289734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931134
5524	NC_011899	A	6	6	289767	289772	100 %	0 %	0 %	0 %	220931134
5525	NC_011899	TACC	2	8	289890	289897	25 %	25 %	0 %	50 %	220931134
5526	NC_011899	TATG	2	8	289985	289992	25 %	50 %	25 %	0 %	220931134
5527	NC_011899	AT	3	6	290147	290152	50 %	50 %	0 %	0 %	220931134
5528	NC_011899	GTT	2	6	290153	290158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931134
5529	NC_011899	GTT	2	6	290309	290314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931134
5530	NC_011899	TGG	2	6	290346	290351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931134
5531	NC_011899	ATT	2	6	290370	290375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931134
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5533	NC_011899	GAA	2	6	290386	290391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931134
5534	NC_011899	CCT	2	6	290413	290418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220931134
5535	NC_011899	CCAT	2	8	290442	290449	25 %	25 %	0 %	50 %	220931134
5536	NC_011899	GAAA	2	8	290481	290488	75 %	0 %	25 %	0 %	220931134
5537	NC_011899	ATG	2	6	290619	290624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931134
5538	NC_011899	AAGGT	2	10	290625	290634	40 %	20 %	40 %	0 %	220931134
5539	NC_011899	TGA	2	6	290674	290679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931134
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5541	NC_011899	TTA	2	6	290754	290759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931134
5542	NC_011899	GACC	2	8	290790	290797	25 %	0 %	25 %	50 %	220931134
5543	NC_011899	GAA	2	6	290831	290836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931134
5544	NC_011899	TGA	2	6	290842	290847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931134
5545	NC_011899	TGA	2	6	290878	290883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931134
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5548	NC_011899	ACC	2	6	291026	291031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931134
5549	NC_011899	ATG	2	6	291032	291037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931134
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5551	NC_011899	GGC	2	6	291112	291117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220931134
5552	NC_011899	T	6	6	291470	291475	0 %	100 %	0 %	0 %	220931135
5553	NC_011899	TCA	2	6	291508	291513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931135
5554	NC_011899	ATT	2	6	291514	291519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931135
5555	NC_011899	AT	3	6	291564	291569	50 %	50 %	0 %	0 %	220931135
5556	NC_011899	CTT	2	6	291635	291640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931135
5557	NC_011899	TCC	2	6	291675	291680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220931135
5558	NC_011899	CTT	2	6	291722	291727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931135
5559	NC_011899	TCA	2	6	291733	291738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931135
5560	NC_011899	T	6	6	291754	291759	0 %	100 %	0 %	0 %	220931135
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5562	NC_011899	CCT	2	6	291868	291873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220931135
5563	NC_011899	TAT	2	6	291890	291895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931135
5564	NC_011899	TCA	2	6	291949	291954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931135
5565	NC_011899	T	6	6	292008	292013	0 %	100 %	0 %	0 %	220931135
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5570	NC_011899	CGTC	2	8	292471	292478	0 %	25 %	25 %	50 %	220931135
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5574	NC_011899	CTT	2	6	292598	292603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931135
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5577	NC_011899	T	6	6	292648	292653	0 %	100 %	0 %	0 %	220931135
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5589	NC_011899	TCCT	2	8	293811	293818	0 %	50 %	0 %	50 %	220931136
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5599	NC_011899	TAA	2	6	294473	294478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931137
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5607	NC_011899	TA	3	6	294681	294686	50 %	50 %	0 %	0 %	220931137
5608	NC_011899	ATA	2	6	294693	294698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931137
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5610	NC_011899	CTG	2	6	294807	294812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931137
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5619	NC_011899	TGT	2	6	295520	295525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931137
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5996	NC_011899	TAA	2	6	314475	314480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931151
5997	NC_011899	ATA	2	6	314517	314522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931151
5998	NC_011899	TA	3	6	314556	314561	50 %	50 %	0 %	0 %	220931151
5999	NC_011899	CTG	2	6	314564	314569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931151
6000	NC_011899	A	6	6	314908	314913	100 %	0 %	0 %	0 %	220931152

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