MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 51990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011899	GAA	2	6	239149	239154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931081
4502	NC_011899	ATA	2	6	239297	239302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931081
4503	NC_011899	CCA	2	6	239306	239311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931081
4504	NC_011899	ACC	2	6	239323	239328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931081
4505	NC_011899	TTC	2	6	239331	239336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931081
4506	NC_011899	AAC	2	6	239347	239352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931081
4507	NC_011899	ATG	2	6	239366	239371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931081
4508	NC_011899	TGT	2	6	239376	239381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931081
4509	NC_011899	G	6	6	239400	239405	0 %	0 %	100 %	0 %	220931081
4510	NC_011899	GTG	2	6	239522	239527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931081
4511	NC_011899	GCA	2	6	239533	239538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220931081
4512	NC_011899	GGT	2	6	239584	239589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931081
4513	NC_011899	CAGC	2	8	239599	239606	25 %	0 %	25 %	50 %	220931081
4514	NC_011899	TGG	2	6	239666	239671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931081
4515	NC_011899	CTT	2	6	239678	239683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931081
4516	NC_011899	AGG	2	6	239792	239797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931081
4517	NC_011899	TAC	2	6	239802	239807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931081
4518	NC_011899	AGA	2	6	239940	239945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931081
4519	NC_011899	GCT	2	6	239977	239982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931081
4520	NC_011899	CAT	2	6	239988	239993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931081
4521	NC_011899	ATG	2	6	240029	240034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931081
4522	NC_011899	TGA	2	6	240114	240119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931081
4523	NC_011899	TAT	2	6	240166	240171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931081
4524	NC_011899	TTA	2	6	240209	240214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931081
4525	NC_011899	ATG	2	6	240245	240250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931081
4526	NC_011899	CAA	2	6	240263	240268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931081
4527	NC_011899	TAA	2	6	240396	240401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931081
4528	NC_011899	TTC	2	6	240452	240457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931081
4529	NC_011899	TAT	2	6	240557	240562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931082
4530	NC_011899	TAAA	2	8	240694	240701	75 %	25 %	0 %	0 %	220931082
4531	NC_011899	TAT	2	6	240719	240724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931082
4532	NC_011899	GGCC	2	8	240725	240732	0 %	0 %	50 %	50 %	220931082
4533	NC_011899	GAA	2	6	240776	240781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931082
4534	NC_011899	AGA	2	6	240869	240874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931082
4535	NC_011899	A	6	6	241067	241072	100 %	0 %	0 %	0 %	220931082
4536	NC_011899	AGG	2	6	241162	241167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931082
4537	NC_011899	AGT	2	6	241277	241282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931082
4538	NC_011899	GAA	2	6	241341	241346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931082
4539	NC_011899	ACCTG	2	10	241373	241382	20 %	20 %	20 %	40 %	220931082
4540	NC_011899	GGAA	2	8	241453	241460	50 %	0 %	50 %	0 %	220931082
4541	NC_011899	GCCT	2	8	241480	241487	0 %	25 %	25 %	50 %	220931082
4542	NC_011899	ATG	2	6	241492	241497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931082
4543	NC_011899	GTT	2	6	241545	241550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931082
4544	NC_011899	ATG	2	6	241558	241563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931082
4545	NC_011899	AGA	2	6	241616	241621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931082
4546	NC_011899	CAG	2	6	241700	241705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220931082
4547	NC_011899	A	6	6	241759	241764	100 %	0 %	0 %	0 %	220931082
4548	NC_011899	AGA	2	6	241769	241774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931082
4549	NC_011899	TGA	2	6	241796	241801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931082
4550	NC_011899	GGGA	2	8	241868	241875	25 %	0 %	75 %	0 %	220931082
4551	NC_011899	TGG	2	6	241897	241902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931082
4552	NC_011899	GAA	2	6	242343	242348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931083
4553	NC_011899	TG	3	6	242368	242373	0 %	50 %	50 %	0 %	220931083
4554	NC_011899	AGA	2	6	242411	242416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931083
4555	NC_011899	GA	3	6	242421	242426	50 %	0 %	50 %	0 %	220931083
4556	NC_011899	T	6	6	242536	242541	0 %	100 %	0 %	0 %	220931084
4557	NC_011899	TTCATT	2	12	242543	242554	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	220931084
4558	NC_011899	CTTC	2	8	242618	242625	0 %	50 %	0 %	50 %	220931084
4559	NC_011899	GAATT	2	10	242651	242660	40 %	40 %	20 %	0 %	220931084
4560	NC_011899	TA	3	6	242788	242793	50 %	50 %	0 %	0 %	220931084
4561	NC_011899	TTTC	2	8	242796	242803	0 %	75 %	0 %	25 %	220931084
4562	NC_011899	TAT	2	6	242821	242826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931084
4563	NC_011899	T	6	6	242878	242883	0 %	100 %	0 %	0 %	220931084
4564	NC_011899	GGT	2	6	242898	242903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931084
4565	NC_011899	GAA	2	6	242917	242922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931084
4566	NC_011899	T	6	6	242998	243003	0 %	100 %	0 %	0 %	220931084
4567	NC_011899	TAA	2	6	243102	243107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931084
4568	NC_011899	ATAAC	2	10	243112	243121	60 %	20 %	0 %	20 %	220931084
4569	NC_011899	AAAATA	2	12	243209	243220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	220931084
4570	NC_011899	T	6	6	243230	243235	0 %	100 %	0 %	0 %	220931084
4571	NC_011899	AGA	2	6	243445	243450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931085
4572	NC_011899	A	6	6	243468	243473	100 %	0 %	0 %	0 %	220931085
4573	NC_011899	AAG	2	6	243495	243500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931085
4574	NC_011899	ACC	3	9	243504	243512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931085
4575	NC_011899	GCT	2	6	243528	243533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931085
4576	NC_011899	T	6	6	243540	243545	0 %	100 %	0 %	0 %	220931085
4577	NC_011899	GGAAA	2	10	243554	243563	60 %	0 %	40 %	0 %	220931085
4578	NC_011899	GTAA	2	8	243582	243589	50 %	25 %	25 %	0 %	220931085
4579	NC_011899	CGA	2	6	243685	243690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220931085
4580	NC_011899	AGG	2	6	243798	243803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931085
4581	NC_011899	TTCC	2	8	243847	243854	0 %	50 %	0 %	50 %	220931085
4582	NC_011899	CCA	2	6	243883	243888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931085
4583	NC_011899	GAA	2	6	243908	243913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931085
4584	NC_011899	A	7	7	244032	244038	100 %	0 %	0 %	0 %	220931085
4585	NC_011899	TAA	3	9	244039	244047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931085
4586	NC_011899	T	8	8	244108	244115	0 %	100 %	0 %	0 %	220931085
4587	NC_011899	GAA	2	6	244177	244182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931086
4588	NC_011899	TAT	2	6	244197	244202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931086
4589	NC_011899	T	6	6	244232	244237	0 %	100 %	0 %	0 %	220931086
4590	NC_011899	GAT	2	6	244299	244304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931086
4591	NC_011899	TAA	2	6	244323	244328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931086
4592	NC_011899	GATT	2	8	244350	244357	25 %	50 %	25 %	0 %	220931086
4593	NC_011899	AGG	2	6	244409	244414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931086
4594	NC_011899	ACC	2	6	244418	244423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931086
4595	NC_011899	GGA	2	6	244452	244457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931086
4596	NC_011899	TGTT	2	8	244529	244536	0 %	75 %	25 %	0 %	220931086
4597	NC_011899	GTC	2	6	244551	244556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931086
4598	NC_011899	TTGG	2	8	244589	244596	0 %	50 %	50 %	0 %	220931086
4599	NC_011899	ATT	2	6	244628	244633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931086
4600	NC_011899	CTG	2	6	244697	244702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931086
4601	NC_011899	T	6	6	244859	244864	0 %	100 %	0 %	0 %	220931086
4602	NC_011899	AAG	2	6	244870	244875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931086
4603	NC_011899	T	6	6	245035	245040	0 %	100 %	0 %	0 %	220931086
4604	NC_011899	T	6	6	245048	245053	0 %	100 %	0 %	0 %	220931086
4605	NC_011899	CCA	2	6	245291	245296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220931087
4606	NC_011899	TGA	2	6	245469	245474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931087
4607	NC_011899	AGT	2	6	245484	245489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931087
4608	NC_011899	TGAT	2	8	245502	245509	25 %	50 %	25 %	0 %	220931087
4609	NC_011899	GGT	2	6	245567	245572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931088
4610	NC_011899	ATT	3	9	245630	245638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931088
4611	NC_011899	CTT	2	6	245720	245725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220931088
4612	NC_011899	GTCAGG	2	12	245768	245779	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220931088
4613	NC_011899	TAAA	2	8	245832	245839	75 %	25 %	0 %	0 %	220931088
4614	NC_011899	ATA	2	6	245964	245969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931088
4615	NC_011899	AAC	2	6	245990	245995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220931088
4616	NC_011899	GGT	2	6	246017	246022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931088
4617	NC_011899	ATC	2	6	246144	246149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220931088
4618	NC_011899	ATG	2	6	246180	246185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931088
4619	NC_011899	AGG	2	6	246208	246213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931088
4620	NC_011899	CTGGA	2	10	246312	246321	20 %	20 %	40 %	20 %	220931088
4621	NC_011899	GTG	2	6	246333	246338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931088
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4623	NC_011899	TA	4	8	246377	246384	50 %	50 %	0 %	0 %	220931088
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4999	NC_011899	GTT	2	6	266584	266589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931108
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