MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011852	T	6	6	216361	216366	0 %	100 %	0 %	0 %	219870467
3502	NC_011852	GCA	2	6	216426	216431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870467
3503	NC_011852	TTGTC	2	10	216455	216464	0 %	60 %	20 %	20 %	219870467
3504	NC_011852	TTAACC	2	12	216595	216606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870467
3505	NC_011852	AGA	2	6	216608	216613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870467
3506	NC_011852	ATG	2	6	216616	216621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870467
3507	NC_011852	TA	3	6	216639	216644	50 %	50 %	0 %	0 %	219870467
3508	NC_011852	A	6	6	216650	216655	100 %	0 %	0 %	0 %	219870467
3509	NC_011852	TTG	2	6	216669	216674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870467
3510	NC_011852	T	6	6	217159	217164	0 %	100 %	0 %	0 %	219870468
3511	NC_011852	TA	3	6	217176	217181	50 %	50 %	0 %	0 %	219870468
3512	NC_011852	AAG	2	6	217188	217193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870468
3513	NC_011852	TGA	2	6	217207	217212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870468
3514	NC_011852	AGTG	2	8	217234	217241	25 %	25 %	50 %	0 %	219870468
3515	NC_011852	ATT	2	6	217315	217320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870468
3516	NC_011852	TTG	2	6	217344	217349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870468
3517	NC_011852	TTG	2	6	217359	217364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870468
3518	NC_011852	AGTG	2	8	217414	217421	25 %	25 %	50 %	0 %	219870468
3519	NC_011852	TTA	2	6	217552	217557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870469
3520	NC_011852	ATT	2	6	217584	217589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870469
3521	NC_011852	AAAG	2	8	217644	217651	75 %	0 %	25 %	0 %	219870469
3522	NC_011852	ATTGAT	2	12	217690	217701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219870469
3523	NC_011852	TAC	2	6	217737	217742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870469
3524	NC_011852	CCG	2	6	217746	217751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219870469
3525	NC_011852	CAC	2	6	217777	217782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870469
3526	NC_011852	CGGAA	2	10	217931	217940	40 %	0 %	40 %	20 %	219870469
3527	NC_011852	AGA	2	6	217965	217970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870469
3528	NC_011852	A	7	7	217995	218001	100 %	0 %	0 %	0 %	219870469
3529	NC_011852	TAT	2	6	218016	218021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870469
3530	NC_011852	GTG	2	6	218126	218131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870469
3531	NC_011852	GAA	2	6	218239	218244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870469
3532	NC_011852	GTG	2	6	218351	218356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870469
3533	NC_011852	GAC	2	6	218416	218421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870469
3534	NC_011852	CTG	2	6	218456	218461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870469
3535	NC_011852	GTT	2	6	218476	218481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870469
3536	NC_011852	TGA	2	6	218600	218605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870469
3537	NC_011852	A	8	8	218621	218628	100 %	0 %	0 %	0 %	219870469
3538	NC_011852	AGA	2	6	218637	218642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870469
3539	NC_011852	TGA	2	6	218682	218687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870469
3540	NC_011852	GAA	2	6	218710	218715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870469
3541	NC_011852	AGA	2	6	218730	218735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870469
3542	NC_011852	AGA	2	6	218781	218786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870469
3543	NC_011852	GAA	2	6	218800	218805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870469
3544	NC_011852	GTGC	2	8	218812	218819	0 %	25 %	50 %	25 %	219870469
3545	NC_011852	GAA	3	9	218851	218859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870469
3546	NC_011852	TAC	2	6	218949	218954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870469
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3549	NC_011852	AATT	2	8	219029	219036	50 %	50 %	0 %	0 %	219870469
3550	NC_011852	GCT	2	6	219040	219045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870469
3551	NC_011852	GAA	2	6	219119	219124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870470
3552	NC_011852	CGT	2	6	219138	219143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870470
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3554	NC_011852	AAG	2	6	219187	219192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870470
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3557	NC_011852	AAG	3	9	219250	219258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870470
3558	NC_011852	AAG	2	6	219274	219279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870470
3559	NC_011852	AGA	2	6	219296	219301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870470
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3561	NC_011852	GAA	2	6	219330	219335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870470
3562	NC_011852	A	7	7	219338	219344	100 %	0 %	0 %	0 %	219870470
3563	NC_011852	AAC	2	6	219376	219381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870470
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3565	NC_011852	CGT	2	6	219477	219482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870470
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3569	NC_011852	TCG	2	6	219587	219592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870470
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3612	NC_011852	CGT	2	6	221514	221519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870470
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3617	NC_011852	AGAA	2	8	221952	221959	75 %	0 %	25 %	0 %	219870471
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3741	NC_011852	GCG	2	6	235490	235495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219870478
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3990	NC_011852	GGC	2	6	250407	250412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219870488
3991	NC_011852	GGCT	2	8	250434	250441	0 %	25 %	50 %	25 %	219870488
3992	NC_011852	GCT	2	6	250501	250506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870488
3993	NC_011852	TC	4	8	250533	250540	0 %	50 %	0 %	50 %	219870488
3994	NC_011852	ACAG	2	8	250611	250618	50 %	0 %	25 %	25 %	219870488
3995	NC_011852	GAA	2	6	250639	250644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870488
3996	NC_011852	TTTC	2	8	250681	250688	0 %	75 %	0 %	25 %	219870488
3997	NC_011852	T	6	6	250705	250710	0 %	100 %	0 %	0 %	219870488
3998	NC_011852	T	7	7	250813	250819	0 %	100 %	0 %	0 %	219870488
3999	NC_011852	TAT	2	6	250870	250875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870488
4000	NC_011852	AGC	2	6	250884	250889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870488

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