MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_011852	ATC	2	6	2259134	2259139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872293
34502	NC_011852	TTC	2	6	2259182	2259187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872293
34503	NC_011852	CTG	2	6	2259200	2259205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872293
34504	NC_011852	ATC	2	6	2259305	2259310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872293
34505	NC_011852	ATC	2	6	2259356	2259361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872293
34506	NC_011852	CGG	2	6	2259375	2259380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872293
34507	NC_011852	ACC	2	6	2259385	2259390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872293
34508	NC_011852	CAAAGG	2	12	2259435	2259446	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	219872293
34509	NC_011852	TTG	2	6	2259526	2259531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872293
34510	NC_011852	GCCA	2	8	2259540	2259547	25 %	0 %	25 %	50 %	219872293
34511	NC_011852	ACT	2	6	2259566	2259571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872293
34512	NC_011852	AGT	2	6	2259697	2259702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872293
34513	NC_011852	TGCGG	2	10	2259703	2259712	0 %	20 %	60 %	20 %	219872293
34514	NC_011852	CAC	2	6	2259743	2259748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872293
34515	NC_011852	GAA	2	6	2259832	2259837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872293
34516	NC_011852	CATTG	2	10	2259886	2259895	20 %	40 %	20 %	20 %	219872293
34517	NC_011852	TTAA	2	8	2259983	2259990	50 %	50 %	0 %	0 %	219872293
34518	NC_011852	TTG	2	6	2260107	2260112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872294
34519	NC_011852	T	6	6	2260137	2260142	0 %	100 %	0 %	0 %	219872294
34520	NC_011852	GAT	2	6	2260218	2260223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872294
34521	NC_011852	TTG	2	6	2260246	2260251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872294
34522	NC_011852	TCT	2	6	2260264	2260269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872294
34523	NC_011852	TAT	2	6	2260296	2260301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872294
34524	NC_011852	CTG	2	6	2260302	2260307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872294
34525	NC_011852	TGA	2	6	2260364	2260369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872294
34526	NC_011852	TGA	2	6	2260400	2260405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872294
34527	NC_011852	ATT	2	6	2260428	2260433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872294
34528	NC_011852	CT	3	6	2260435	2260440	0 %	50 %	0 %	50 %	219872294
34529	NC_011852	T	7	7	2260475	2260481	0 %	100 %	0 %	0 %	219872295
34530	NC_011852	T	6	6	2260518	2260523	0 %	100 %	0 %	0 %	219872295
34531	NC_011852	TTTG	2	8	2260620	2260627	0 %	75 %	25 %	0 %	219872295
34532	NC_011852	TAA	2	6	2260641	2260646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872295
34533	NC_011852	TGA	2	6	2260673	2260678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872295
34534	NC_011852	CAACAT	2	12	2260754	2260765	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219872295
34535	NC_011852	AAC	2	6	2260770	2260775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872295
34536	NC_011852	CAG	2	6	2260845	2260850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872295
34537	NC_011852	TC	3	6	2260875	2260880	0 %	50 %	0 %	50 %	219872295
34538	NC_011852	ACTT	2	8	2260892	2260899	25 %	50 %	0 %	25 %	219872295
34539	NC_011852	GCAGT	2	10	2260922	2260931	20 %	20 %	40 %	20 %	219872295
34540	NC_011852	TTTAT	2	10	2261032	2261041	20 %	80 %	0 %	0 %	219872295
34541	NC_011852	G	6	6	2261044	2261049	0 %	0 %	100 %	0 %	219872295
34542	NC_011852	TAT	2	6	2261458	2261463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872296
34543	NC_011852	GAT	2	6	2261517	2261522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872296
34544	NC_011852	TGA	2	6	2261570	2261575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872296
34545	NC_011852	CAG	2	6	2261580	2261585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872296
34546	NC_011852	CAG	2	6	2261590	2261595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872296
34547	NC_011852	GTA	2	6	2261608	2261613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872296
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34549	NC_011852	ATCT	2	8	2261695	2261702	25 %	50 %	0 %	25 %	219872296
34550	NC_011852	CAT	2	6	2263145	2263150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872297
34551	NC_011852	CT	3	6	2263177	2263182	0 %	50 %	0 %	50 %	219872297
34552	NC_011852	GATTT	2	10	2263272	2263281	20 %	60 %	20 %	0 %	219872297
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34554	NC_011852	CCG	2	6	2263342	2263347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219872297
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34556	NC_011852	TGT	2	6	2263368	2263373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872297
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34558	NC_011852	TTG	2	6	2263413	2263418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872297
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34564	NC_011852	CGGT	2	8	2264166	2264173	0 %	25 %	50 %	25 %	219872298
34565	NC_011852	GTC	2	6	2264264	2264269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872298
34566	NC_011852	TTC	2	6	2264288	2264293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872298
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34598	NC_011852	GA	3	6	2266167	2266172	50 %	0 %	50 %	0 %	219872298
34599	NC_011852	TCG	2	6	2266173	2266178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872298
34600	NC_011852	T	6	6	2266289	2266294	0 %	100 %	0 %	0 %	219872298
34601	NC_011852	A	7	7	2266331	2266337	100 %	0 %	0 %	0 %	219872298
34602	NC_011852	TCA	2	6	2266378	2266383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872298
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34604	NC_011852	GA	4	8	2266621	2266628	50 %	0 %	50 %	0 %	219872298
34605	NC_011852	CAA	2	6	2266630	2266635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872298
34606	NC_011852	TTG	2	6	2266641	2266646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872298
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34616	NC_011852	CTA	2	6	2267508	2267513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872299
34617	NC_011852	GT	3	6	2267553	2267558	0 %	50 %	50 %	0 %	219872299
34618	NC_011852	TGG	2	6	2267560	2267565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872299
34619	NC_011852	ATT	2	6	2267573	2267578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872299
34620	NC_011852	ATT	2	6	2267607	2267612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872299
34621	NC_011852	AACA	2	8	2267630	2267637	75 %	0 %	0 %	25 %	219872299
34622	NC_011852	AC	3	6	2267672	2267677	50 %	0 %	0 %	50 %	219872299
34623	NC_011852	TGC	2	6	2267737	2267742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872299
34624	NC_011852	TTC	2	6	2267853	2267858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872299
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34630	NC_011852	AC	3	6	2268145	2268150	50 %	0 %	0 %	50 %	219872299
34631	NC_011852	CTG	2	6	2268180	2268185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872299
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