MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_011852	A	6	6	2230158	2230163	100 %	0 %	0 %	0 %	219872266
34003	NC_011852	T	6	6	2230723	2230728	0 %	100 %	0 %	0 %	219872267
34004	NC_011852	TGG	2	6	2230890	2230895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872267
34005	NC_011852	ACA	2	6	2231002	2231007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872267
34006	NC_011852	ATG	2	6	2231078	2231083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872267
34007	NC_011852	CAC	2	6	2231104	2231109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872267
34008	NC_011852	AAC	3	9	2231550	2231558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872268
34009	NC_011852	GCTTT	2	10	2231632	2231641	0 %	60 %	20 %	20 %	219872268
34010	NC_011852	TGA	3	9	2231707	2231715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872268
34011	NC_011852	A	6	6	2231715	2231720	100 %	0 %	0 %	0 %	219872268
34012	NC_011852	TTAC	2	8	2231773	2231780	25 %	50 %	0 %	25 %	219872268
34013	NC_011852	AAG	2	6	2231790	2231795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872268
34014	NC_011852	GAA	2	6	2231822	2231827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872268
34015	NC_011852	GTT	2	6	2231834	2231839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872268
34016	NC_011852	AGC	2	6	2231887	2231892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872268
34017	NC_011852	CTTT	2	8	2231949	2231956	0 %	75 %	0 %	25 %	219872268
34018	NC_011852	A	6	6	2231984	2231989	100 %	0 %	0 %	0 %	219872268
34019	NC_011852	A	6	6	2232002	2232007	100 %	0 %	0 %	0 %	219872268
34020	NC_011852	ATA	2	6	2232106	2232111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872269
34021	NC_011852	CAC	2	6	2232116	2232121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872269
34022	NC_011852	TGC	2	6	2232164	2232169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872269
34023	NC_011852	AAAG	2	8	2232183	2232190	75 %	0 %	25 %	0 %	219872269
34024	NC_011852	AAC	2	6	2232217	2232222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872269
34025	NC_011852	GAT	2	6	2232288	2232293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872269
34026	NC_011852	ATTG	2	8	2232324	2232331	25 %	50 %	25 %	0 %	219872269
34027	NC_011852	TGA	2	6	2232371	2232376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872269
34028	NC_011852	GAA	2	6	2232408	2232413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872269
34029	NC_011852	CGT	2	6	2232468	2232473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872269
34030	NC_011852	CTTTGT	2	12	2232493	2232504	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	219872269
34031	NC_011852	TGA	2	6	2232590	2232595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872269
34032	NC_011852	A	6	6	2232614	2232619	100 %	0 %	0 %	0 %	219872269
34033	NC_011852	ATT	2	6	2232624	2232629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872269
34034	NC_011852	TCG	2	6	2232701	2232706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872269
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34037	NC_011852	GAT	2	6	2232870	2232875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872269
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34040	NC_011852	GTA	2	6	2232919	2232924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872269
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34042	NC_011852	GCA	2	6	2232933	2232938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872269
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34048	NC_011852	GGC	2	6	2233074	2233079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872269
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34052	NC_011852	A	6	6	2233248	2233253	100 %	0 %	0 %	0 %	219872269
34053	NC_011852	ATT	2	6	2233266	2233271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872269
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34071	NC_011852	TGA	2	6	2233940	2233945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872269
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34112	NC_011852	TTTA	2	8	2235614	2235621	25 %	75 %	0 %	0 %	219872270
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34234	NC_011852	ACA	2	6	2243927	2243932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872279
34235	NC_011852	TTG	2	6	2243942	2243947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872279
34236	NC_011852	TGA	2	6	2243955	2243960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872279
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34346	NC_011852	T	6	6	2250716	2250721	0 %	100 %	0 %	0 %	219872284
34347	NC_011852	TTC	2	6	2250746	2250751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872284
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34350	NC_011852	GCT	2	6	2250861	2250866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872284
34351	NC_011852	TCA	2	6	2250987	2250992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872284
34352	NC_011852	CCA	2	6	2250997	2251002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872284
34353	NC_011852	CAA	2	6	2251020	2251025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872284
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34355	NC_011852	A	6	6	2251097	2251102	100 %	0 %	0 %	0 %	219872284
34356	NC_011852	CACT	2	8	2251150	2251157	25 %	25 %	0 %	50 %	219872284
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34361	NC_011852	GGT	2	6	2251298	2251303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872284
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34381	NC_011852	T	6	6	2252473	2252478	0 %	100 %	0 %	0 %	219872286
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34466	NC_011852	A	6	6	2257100	2257105	100 %	0 %	0 %	0 %	219872290
34467	NC_011852	GATT	2	8	2257165	2257172	25 %	50 %	25 %	0 %	219872290
34468	NC_011852	GTTA	2	8	2257181	2257188	25 %	50 %	25 %	0 %	219872290
34469	NC_011852	ATTG	2	8	2257190	2257197	25 %	50 %	25 %	0 %	219872290
34470	NC_011852	A	6	6	2257200	2257205	100 %	0 %	0 %	0 %	219872290
34471	NC_011852	TAT	2	6	2257255	2257260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872291
34472	NC_011852	TTAT	2	8	2257264	2257271	25 %	75 %	0 %	0 %	219872291
34473	NC_011852	CAA	2	6	2257310	2257315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872291
34474	NC_011852	ATT	2	6	2257352	2257357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872291
34475	NC_011852	GGA	2	6	2257369	2257374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219872291
34476	NC_011852	A	6	6	2257417	2257422	100 %	0 %	0 %	0 %	219872291
34477	NC_011852	A	6	6	2257434	2257439	100 %	0 %	0 %	0 %	219872291
34478	NC_011852	TGA	2	6	2257447	2257452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872291
34479	NC_011852	A	7	7	2257492	2257498	100 %	0 %	0 %	0 %	219872291
34480	NC_011852	TCA	2	6	2257519	2257524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872291
34481	NC_011852	ACA	2	6	2257540	2257545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872291
34482	NC_011852	TAC	2	6	2257546	2257551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872291
34483	NC_011852	GGCAA	2	10	2257647	2257656	40 %	0 %	40 %	20 %	219872291
34484	NC_011852	TGA	2	6	2257687	2257692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872291
34485	NC_011852	CAG	2	6	2257813	2257818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872291
34486	NC_011852	ACA	2	6	2257828	2257833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872291
34487	NC_011852	GCGT	2	8	2257839	2257846	0 %	25 %	50 %	25 %	219872291
34488	NC_011852	CAA	2	6	2257918	2257923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872291
34489	NC_011852	TCCG	2	8	2257948	2257955	0 %	25 %	25 %	50 %	219872291
34490	NC_011852	AG	3	6	2258020	2258025	50 %	0 %	50 %	0 %	219872291
34491	NC_011852	A	6	6	2258075	2258080	100 %	0 %	0 %	0 %	219872291
34492	NC_011852	ATG	2	6	2258267	2258272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872291
34493	NC_011852	A	6	6	2258493	2258498	100 %	0 %	0 %	0 %	219872291
34494	NC_011852	CGT	3	9	2258615	2258623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872292
34495	NC_011852	GA	3	6	2258626	2258631	50 %	0 %	50 %	0 %	219872292
34496	NC_011852	CGGTA	2	10	2258758	2258767	20 %	20 %	40 %	20 %	219872292
34497	NC_011852	TGA	2	6	2258785	2258790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872292
34498	NC_011852	TTC	2	6	2258793	2258798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872292
34499	NC_011852	TTTGA	2	10	2259031	2259040	20 %	60 %	20 %	0 %	219872293
34500	NC_011852	GAT	2	6	2259103	2259108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872293

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