MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_011852	CAG	2	6	2197921	2197926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872237
33502	NC_011852	TGAG	2	8	2198018	2198025	25 %	25 %	50 %	0 %	219872237
33503	NC_011852	GAT	2	6	2198067	2198072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872237
33504	NC_011852	TTTC	2	8	2198079	2198086	0 %	75 %	0 %	25 %	219872237
33505	NC_011852	TTG	2	6	2198119	2198124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872237
33506	NC_011852	TCA	2	6	2198136	2198141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872237
33507	NC_011852	TGA	2	6	2198187	2198192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872237
33508	NC_011852	GTA	2	6	2198225	2198230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872237
33509	NC_011852	CAA	2	6	2198248	2198253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872237
33510	NC_011852	TCT	2	6	2198276	2198281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872237
33511	NC_011852	TG	3	6	2198366	2198371	0 %	50 %	50 %	0 %	219872237
33512	NC_011852	CTTA	2	8	2198471	2198478	25 %	50 %	0 %	25 %	219872237
33513	NC_011852	TGT	2	6	2198614	2198619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872237
33514	NC_011852	CCGT	2	8	2198643	2198650	0 %	25 %	25 %	50 %	219872237
33515	NC_011852	AG	3	6	2198692	2198697	50 %	0 %	50 %	0 %	219872237
33516	NC_011852	TGGT	2	8	2198785	2198792	0 %	50 %	50 %	0 %	219872237
33517	NC_011852	GCT	2	6	2198896	2198901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872237
33518	NC_011852	CAG	2	6	2199001	2199006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872237
33519	NC_011852	ATC	2	6	2199035	2199040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872237
33520	NC_011852	A	6	6	2199107	2199112	100 %	0 %	0 %	0 %	219872237
33521	NC_011852	TCCTG	2	10	2199136	2199145	0 %	40 %	20 %	40 %	219872237
33522	NC_011852	ATT	2	6	2199197	2199202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872237
33523	NC_011852	AGA	2	6	2199326	2199331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872237
33524	NC_011852	TAT	2	6	2199393	2199398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872237
33525	NC_011852	GAT	2	6	2199424	2199429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872237
33526	NC_011852	CTTG	2	8	2199468	2199475	0 %	50 %	25 %	25 %	219872237
33527	NC_011852	A	6	6	2199505	2199510	100 %	0 %	0 %	0 %	219872237
33528	NC_011852	T	6	6	2199552	2199557	0 %	100 %	0 %	0 %	219872237
33529	NC_011852	GTT	2	6	2199615	2199620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872237
33530	NC_011852	GGA	2	6	2199699	2199704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219872237
33531	NC_011852	T	7	7	2199705	2199711	0 %	100 %	0 %	0 %	219872237
33532	NC_011852	GTG	2	6	2199712	2199717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872237
33533	NC_011852	GGA	2	6	2199744	2199749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219872237
33534	NC_011852	ACA	2	6	2199768	2199773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872237
33535	NC_011852	TTG	2	6	2199775	2199780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872237
33536	NC_011852	AGAAT	2	10	2199795	2199804	60 %	20 %	20 %	0 %	219872237
33537	NC_011852	T	8	8	2200012	2200019	0 %	100 %	0 %	0 %	219872238
33538	NC_011852	GGAAT	2	10	2200062	2200071	40 %	20 %	40 %	0 %	219872238
33539	NC_011852	CCA	2	6	2200077	2200082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872238
33540	NC_011852	T	7	7	2200112	2200118	0 %	100 %	0 %	0 %	219872238
33541	NC_011852	CTA	2	6	2200169	2200174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872238
33542	NC_011852	TTTA	2	8	2200298	2200305	25 %	75 %	0 %	0 %	219872238
33543	NC_011852	CAT	3	9	2200325	2200333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872238
33544	NC_011852	TC	4	8	2200351	2200358	0 %	50 %	0 %	50 %	219872238
33545	NC_011852	GA	3	6	2200442	2200447	50 %	0 %	50 %	0 %	219872238
33546	NC_011852	TCA	2	6	2200453	2200458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872238
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33548	NC_011852	AATT	2	8	2200654	2200661	50 %	50 %	0 %	0 %	219872238
33549	NC_011852	TTC	2	6	2200684	2200689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872238
33550	NC_011852	TTA	2	6	2200769	2200774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872238
33551	NC_011852	GGGAA	2	10	2200775	2200784	40 %	0 %	60 %	0 %	219872238
33552	NC_011852	ATA	2	6	2200858	2200863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872239
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33554	NC_011852	TGGT	2	8	2201044	2201051	0 %	50 %	50 %	0 %	219872239
33555	NC_011852	CT	3	6	2201082	2201087	0 %	50 %	0 %	50 %	219872239
33556	NC_011852	GTG	2	6	2201150	2201155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872239
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33558	NC_011852	TGC	2	6	2201194	2201199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872239
33559	NC_011852	TGA	2	6	2201278	2201283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872239
33560	NC_011852	AACC	2	8	2201329	2201336	50 %	0 %	0 %	50 %	219872239
33561	NC_011852	GCTT	2	8	2201374	2201381	0 %	50 %	25 %	25 %	219872239
33562	NC_011852	TAT	2	6	2201411	2201416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872239
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33564	NC_011852	TAC	2	6	2201548	2201553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872239
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33589	NC_011852	CAG	3	9	2203209	2203217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872240
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33600	NC_011852	TTA	2	6	2204064	2204069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872241
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33603	NC_011852	TGAT	2	8	2204212	2204219	25 %	50 %	25 %	0 %	219872241
33604	NC_011852	TGA	2	6	2204359	2204364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872242
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33617	NC_011852	TTTA	2	8	2205196	2205203	25 %	75 %	0 %	0 %	219872242
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33853	NC_011852	TGA	2	6	2220349	2220354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872255
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33970	NC_011852	ACC	2	6	2227770	2227775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872265
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33973	NC_011852	A	6	6	2227966	2227971	100 %	0 %	0 %	0 %	219872265
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