MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_011852	CTA	2	6	2169259	2169264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872210
33003	NC_011852	ATCCA	2	10	2169306	2169315	40 %	20 %	0 %	40 %	219872211
33004	NC_011852	TTA	2	6	2169500	2169505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872211
33005	NC_011852	CTT	2	6	2169510	2169515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872211
33006	NC_011852	CGT	2	6	2169553	2169558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872211
33007	NC_011852	TTC	2	6	2169568	2169573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872211
33008	NC_011852	T	6	6	2169613	2169618	0 %	100 %	0 %	0 %	219872211
33009	NC_011852	TAAT	2	8	2169660	2169667	50 %	50 %	0 %	0 %	219872211
33010	NC_011852	A	6	6	2169692	2169697	100 %	0 %	0 %	0 %	219872211
33011	NC_011852	GCA	2	6	2169698	2169703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872211
33012	NC_011852	CCA	2	6	2169773	2169778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872211
33013	NC_011852	ACT	2	6	2170365	2170370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872212
33014	NC_011852	CTG	2	6	2170376	2170381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872212
33015	NC_011852	AAGT	2	8	2170539	2170546	50 %	25 %	25 %	0 %	219872212
33016	NC_011852	TGTGAA	2	12	2170561	2170572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872212
33017	NC_011852	CAC	2	6	2170573	2170578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872212
33018	NC_011852	GAT	2	6	2170606	2170611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872212
33019	NC_011852	ATGA	2	8	2170621	2170628	50 %	25 %	25 %	0 %	219872212
33020	NC_011852	CAC	2	6	2170646	2170651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872212
33021	NC_011852	T	6	6	2170732	2170737	0 %	100 %	0 %	0 %	219872212
33022	NC_011852	TTGA	2	8	2170822	2170829	25 %	50 %	25 %	0 %	219872212
33023	NC_011852	TAT	3	9	2171548	2171556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872213
33024	NC_011852	CTT	2	6	2171559	2171564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872213
33025	NC_011852	A	6	6	2171572	2171577	100 %	0 %	0 %	0 %	219872213
33026	NC_011852	ATT	2	6	2171590	2171595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872213
33027	NC_011852	ATT	2	6	2171636	2171641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872213
33028	NC_011852	GAT	2	6	2171645	2171650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872213
33029	NC_011852	AGC	2	6	2171728	2171733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872213
33030	NC_011852	GAT	4	12	2171789	2171800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872213
33031	NC_011852	GAT	2	6	2171854	2171859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872213
33032	NC_011852	TTTA	2	8	2171864	2171871	25 %	75 %	0 %	0 %	219872213
33033	NC_011852	CTG	2	6	2171877	2171882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872213
33034	NC_011852	TG	3	6	2171885	2171890	0 %	50 %	50 %	0 %	219872213
33035	NC_011852	GAT	2	6	2171992	2171997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872213
33036	NC_011852	A	6	6	2172005	2172010	100 %	0 %	0 %	0 %	219872213
33037	NC_011852	AGA	2	6	2172058	2172063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872213
33038	NC_011852	ATTTT	2	10	2172069	2172078	20 %	80 %	0 %	0 %	219872213
33039	NC_011852	AAC	2	6	2172130	2172135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872213
33040	NC_011852	CAA	2	6	2172236	2172241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872213
33041	NC_011852	A	7	7	2172240	2172246	100 %	0 %	0 %	0 %	219872213
33042	NC_011852	TA	3	6	2172264	2172269	50 %	50 %	0 %	0 %	219872213
33043	NC_011852	TTA	2	6	2172316	2172321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872213
33044	NC_011852	ATTT	2	8	2172379	2172386	25 %	75 %	0 %	0 %	219872213
33045	NC_011852	CAAT	2	8	2172399	2172406	50 %	25 %	0 %	25 %	219872213
33046	NC_011852	TTTA	2	8	2172416	2172423	25 %	75 %	0 %	0 %	219872213
33047	NC_011852	A	6	6	2172498	2172503	100 %	0 %	0 %	0 %	219872214
33048	NC_011852	TTG	3	9	2172527	2172535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872214
33049	NC_011852	AATG	2	8	2172673	2172680	50 %	25 %	25 %	0 %	219872214
33050	NC_011852	ATT	2	6	2172766	2172771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872214
33051	NC_011852	TCG	2	6	2172825	2172830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872214
33052	NC_011852	A	7	7	2172908	2172914	100 %	0 %	0 %	0 %	219872214
33053	NC_011852	TGG	2	6	2172930	2172935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872214
33054	NC_011852	AAG	2	6	2172950	2172955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872214
33055	NC_011852	ATT	2	6	2172956	2172961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872214
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33059	NC_011852	TTAAA	2	10	2173097	2173106	60 %	40 %	0 %	0 %	219872214
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33061	NC_011852	CTTA	2	8	2173188	2173195	25 %	50 %	0 %	25 %	219872214
33062	NC_011852	TAAA	2	8	2173218	2173225	75 %	25 %	0 %	0 %	219872214
33063	NC_011852	ATT	2	6	2173356	2173361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872215
33064	NC_011852	CAT	2	6	2173386	2173391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872215
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33066	NC_011852	GTA	2	6	2173455	2173460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872215
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33070	NC_011852	CAT	2	6	2173920	2173925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872215
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33078	NC_011852	TAGC	2	8	2174453	2174460	25 %	25 %	25 %	25 %	219872215
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33083	NC_011852	GAC	2	6	2174696	2174701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872215
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33088	NC_011852	GCAACG	2	12	2174962	2174973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872215
33089	NC_011852	CAA	2	6	2175003	2175008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872215
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33093	NC_011852	A	7	7	2175151	2175157	100 %	0 %	0 %	0 %	219872215
33094	NC_011852	CAA	2	6	2175215	2175220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872215
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33097	NC_011852	GA	3	6	2175313	2175318	50 %	0 %	50 %	0 %	219872216
33098	NC_011852	TCA	2	6	2175597	2175602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872216
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33101	NC_011852	CAC	2	6	2175788	2175793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872216
33102	NC_011852	GAA	2	6	2176419	2176424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872217
33103	NC_011852	ATC	2	6	2176605	2176610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872217
33104	NC_011852	AGCA	2	8	2176659	2176666	50 %	0 %	25 %	25 %	219872217
33105	NC_011852	TG	3	6	2176747	2176752	0 %	50 %	50 %	0 %	219872217
33106	NC_011852	TTGTGC	2	12	2176770	2176781	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219872217
33107	NC_011852	TGA	2	6	2176805	2176810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872217
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33117	NC_011852	CCA	2	6	2177117	2177122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872217
33118	NC_011852	TCA	2	6	2177153	2177158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872217
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33220	NC_011852	AT	3	6	2182065	2182070	50 %	50 %	0 %	0 %	219872222
33221	NC_011852	TCT	2	6	2182091	2182096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872222
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33230	NC_011852	TC	3	6	2182854	2182859	0 %	50 %	0 %	50 %	219872223
33231	NC_011852	ACT	2	6	2183102	2183107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872223
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33471	NC_011852	TC	3	6	2196277	2196282	0 %	50 %	0 %	50 %	219872236
33472	NC_011852	AAAG	2	8	2196361	2196368	75 %	0 %	25 %	0 %	219872236
33473	NC_011852	TCA	3	9	2196379	2196387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872236
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33481	NC_011852	TAG	2	6	2196751	2196756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872236
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