MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_011852	TGG	2	6	2111025	2111030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872165
32003	NC_011852	AAT	2	6	2111061	2111066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872165
32004	NC_011852	AAC	2	6	2111328	2111333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872165
32005	NC_011852	TGC	2	6	2111338	2111343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872165
32006	NC_011852	GAT	2	6	2111430	2111435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872165
32007	NC_011852	ATGGGA	2	12	2111460	2111471	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219872165
32008	NC_011852	AAAG	2	8	2111501	2111508	75 %	0 %	25 %	0 %	219872165
32009	NC_011852	A	6	6	2111583	2111588	100 %	0 %	0 %	0 %	219872165
32010	NC_011852	A	6	6	2111601	2111606	100 %	0 %	0 %	0 %	219872165
32011	NC_011852	TGA	2	6	2111621	2111626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872165
32012	NC_011852	GAC	2	6	2111732	2111737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872165
32013	NC_011852	GCT	2	6	2111752	2111757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872165
32014	NC_011852	TGC	2	6	2111770	2111775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872165
32015	NC_011852	CGA	2	6	2111782	2111787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872165
32016	NC_011852	TTC	2	6	2111790	2111795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872165
32017	NC_011852	TAC	2	6	2111841	2111846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872165
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32019	NC_011852	TGAC	2	8	2111897	2111904	25 %	25 %	25 %	25 %	219872165
32020	NC_011852	GA	3	6	2111927	2111932	50 %	0 %	50 %	0 %	219872165
32021	NC_011852	T	6	6	2111934	2111939	0 %	100 %	0 %	0 %	219872165
32022	NC_011852	GCT	2	6	2111942	2111947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872165
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32054	NC_011852	TTA	2	6	2113624	2113629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872167
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32118	NC_011852	AAT	2	6	2116534	2116539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872168
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32124	NC_011852	CTG	2	6	2116938	2116943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872168
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32228	NC_011852	GTC	2	6	2122772	2122777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872173
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32231	NC_011852	ATC	2	6	2122835	2122840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872173
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32234	NC_011852	CTAAGC	2	12	2123113	2123124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219872173
32235	NC_011852	GGT	2	6	2123244	2123249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872173
32236	NC_011852	TTA	2	6	2123268	2123273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872173
32237	NC_011852	GTT	2	6	2123296	2123301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872173
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32248	NC_011852	TTA	2	6	2124142	2124147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872174
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32252	NC_011852	GAT	2	6	2124284	2124289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872174
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32352	NC_011852	CAA	2	6	2131151	2131156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872181
32353	NC_011852	ATG	2	6	2131224	2131229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872181
32354	NC_011852	CAA	2	6	2131349	2131354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872181
32355	NC_011852	CAA	2	6	2131388	2131393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872181
32356	NC_011852	ATTG	2	8	2131496	2131503	25 %	50 %	25 %	0 %	219872181
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32383	NC_011852	CTTT	2	8	2134641	2134648	0 %	75 %	0 %	25 %	219872182
32384	NC_011852	ACA	2	6	2134652	2134657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872182
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32464	NC_011852	ATT	2	6	2139387	2139392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872186
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32468	NC_011852	CAGA	2	8	2139549	2139556	50 %	0 %	25 %	25 %	219872186
32469	NC_011852	T	6	6	2139587	2139592	0 %	100 %	0 %	0 %	219872186
32470	NC_011852	A	6	6	2139618	2139623	100 %	0 %	0 %	0 %	219872186
32471	NC_011852	T	7	7	2139660	2139666	0 %	100 %	0 %	0 %	219872186
32472	NC_011852	TTG	2	6	2139684	2139689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872186
32473	NC_011852	CTGC	2	8	2139713	2139720	0 %	25 %	25 %	50 %	219872186
32474	NC_011852	ATA	2	6	2139755	2139760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872186
32475	NC_011852	T	6	6	2139845	2139850	0 %	100 %	0 %	0 %	219872186
32476	NC_011852	T	7	7	2139886	2139892	0 %	100 %	0 %	0 %	219872186
32477	NC_011852	A	6	6	2139900	2139905	100 %	0 %	0 %	0 %	219872186
32478	NC_011852	GTT	2	6	2139910	2139915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872186
32479	NC_011852	TGT	2	6	2139997	2140002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872186
32480	NC_011852	CTG	2	6	2140023	2140028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872186
32481	NC_011852	GATC	2	8	2140034	2140041	25 %	25 %	25 %	25 %	219872186
32482	NC_011852	ATC	2	6	2140296	2140301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872187
32483	NC_011852	GT	3	6	2140336	2140341	0 %	50 %	50 %	0 %	219872187
32484	NC_011852	AGTG	2	8	2140420	2140427	25 %	25 %	50 %	0 %	219872187
32485	NC_011852	TTTG	2	8	2140539	2140546	0 %	75 %	25 %	0 %	219872187
32486	NC_011852	GA	4	8	2140641	2140648	50 %	0 %	50 %	0 %	219872187
32487	NC_011852	CT	4	8	2140656	2140663	0 %	50 %	0 %	50 %	219872187
32488	NC_011852	CAT	2	6	2140705	2140710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872187
32489	NC_011852	CGC	2	6	2140778	2140783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219872187
32490	NC_011852	TTAC	2	8	2140824	2140831	25 %	50 %	0 %	25 %	219872187
32491	NC_011852	TAT	2	6	2140837	2140842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872187
32492	NC_011852	TAT	2	6	2140924	2140929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872187
32493	NC_011852	TTG	2	6	2140954	2140959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872187
32494	NC_011852	GATG	2	8	2140976	2140983	25 %	25 %	50 %	0 %	219872187
32495	NC_011852	AAT	2	6	2141060	2141065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872187
32496	NC_011852	ATT	2	6	2141132	2141137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872187
32497	NC_011852	TAC	2	6	2141177	2141182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872187
32498	NC_011852	AGTTT	2	10	2141268	2141277	20 %	60 %	20 %	0 %	219872187
32499	NC_011852	GCT	2	6	2141302	2141307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872187
32500	NC_011852	ACT	2	6	2141393	2141398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872187

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