MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_011852	ATA	2	6	2081601	2081606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872137
31502	NC_011852	AAT	2	6	2081641	2081646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872137
31503	NC_011852	AAT	2	6	2081729	2081734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872137
31504	NC_011852	CTA	2	6	2081745	2081750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
31505	NC_011852	TCA	2	6	2081763	2081768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
31506	NC_011852	CCA	2	6	2081771	2081776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872137
31507	NC_011852	GTT	2	6	2081833	2081838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872137
31508	NC_011852	TCA	2	6	2081853	2081858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
31509	NC_011852	AT	3	6	2081863	2081868	50 %	50 %	0 %	0 %	219872137
31510	NC_011852	TCC	2	6	2081990	2081995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219872137
31511	NC_011852	AC	3	6	2082027	2082032	50 %	0 %	0 %	50 %	219872137
31512	NC_011852	ATC	2	6	2082080	2082085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
31513	NC_011852	ATT	2	6	2082116	2082121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872137
31514	NC_011852	TCTG	2	8	2082143	2082150	0 %	50 %	25 %	25 %	219872137
31515	NC_011852	TAAA	2	8	2082172	2082179	75 %	25 %	0 %	0 %	219872137
31516	NC_011852	T	6	6	2082258	2082263	0 %	100 %	0 %	0 %	219872137
31517	NC_011852	TAA	2	6	2082287	2082292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872137
31518	NC_011852	GTA	2	6	2082327	2082332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872137
31519	NC_011852	GTC	2	6	2082422	2082427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872138
31520	NC_011852	CT	3	6	2082475	2082480	0 %	50 %	0 %	50 %	219872138
31521	NC_011852	AG	3	6	2082484	2082489	50 %	0 %	50 %	0 %	219872138
31522	NC_011852	CCT	2	6	2082490	2082495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219872138
31523	NC_011852	ATG	2	6	2082526	2082531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872138
31524	NC_011852	TTG	2	6	2082543	2082548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872138
31525	NC_011852	TTTTG	2	10	2082565	2082574	0 %	80 %	20 %	0 %	219872138
31526	NC_011852	TCA	2	6	2082644	2082649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872138
31527	NC_011852	AAAT	2	8	2082703	2082710	75 %	25 %	0 %	0 %	219872138
31528	NC_011852	GAAA	2	8	2082738	2082745	75 %	0 %	25 %	0 %	219872138
31529	NC_011852	ATT	2	6	2082779	2082784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872138
31530	NC_011852	ACA	2	6	2082959	2082964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872138
31531	NC_011852	AGCTA	2	10	2083021	2083030	40 %	20 %	20 %	20 %	219872138
31532	NC_011852	AAC	2	6	2083057	2083062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872138
31533	NC_011852	TAC	2	6	2083111	2083116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872138
31534	NC_011852	TTTA	2	8	2083210	2083217	25 %	75 %	0 %	0 %	219872138
31535	NC_011852	CTCCAG	2	12	2083254	2083265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219872138
31536	NC_011852	AT	3	6	2083298	2083303	50 %	50 %	0 %	0 %	219872138
31537	NC_011852	CAC	2	6	2083496	2083501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872139
31538	NC_011852	TAA	2	6	2083531	2083536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872139
31539	NC_011852	GTT	2	6	2083549	2083554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872139
31540	NC_011852	TAA	2	6	2083736	2083741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872139
31541	NC_011852	GTT	2	6	2083813	2083818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872139
31542	NC_011852	CACT	2	8	2083879	2083886	25 %	25 %	0 %	50 %	219872139
31543	NC_011852	AG	3	6	2083995	2084000	50 %	0 %	50 %	0 %	219872139
31544	NC_011852	TC	3	6	2084037	2084042	0 %	50 %	0 %	50 %	219872139
31545	NC_011852	CCA	2	6	2084050	2084055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872139
31546	NC_011852	GCAA	2	8	2084101	2084108	50 %	0 %	25 %	25 %	219872139
31547	NC_011852	CTG	2	6	2084183	2084188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872139
31548	NC_011852	CTG	2	6	2084209	2084214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872139
31549	NC_011852	TTG	2	6	2084221	2084226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872139
31550	NC_011852	GT	3	6	2084308	2084313	0 %	50 %	50 %	0 %	219872139
31551	NC_011852	ATTG	2	8	2084319	2084326	25 %	50 %	25 %	0 %	219872139
31552	NC_011852	C	6	6	2084346	2084351	0 %	0 %	0 %	100 %	219872139
31553	NC_011852	GAC	2	6	2084386	2084391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872139
31554	NC_011852	GGT	2	6	2084400	2084405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872139
31555	NC_011852	ATT	2	6	2084417	2084422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872140
31556	NC_011852	AAC	2	6	2084472	2084477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872140
31557	NC_011852	TAA	2	6	2084488	2084493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872140
31558	NC_011852	TCGTTA	2	12	2084536	2084547	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219872140
31559	NC_011852	GTTT	2	8	2084591	2084598	0 %	75 %	25 %	0 %	219872140
31560	NC_011852	TTC	2	6	2084652	2084657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872140
31561	NC_011852	TTC	2	6	2084679	2084684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872140
31562	NC_011852	TTGC	2	8	2084692	2084699	0 %	50 %	25 %	25 %	219872140
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31564	NC_011852	TGC	2	6	2084775	2084780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872140
31565	NC_011852	CTG	2	6	2084996	2085001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872140
31566	NC_011852	GTTG	2	8	2085004	2085011	0 %	50 %	50 %	0 %	219872140
31567	NC_011852	CCA	3	9	2085117	2085125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872140
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31570	NC_011852	CACG	2	8	2085323	2085330	25 %	0 %	25 %	50 %	219872140
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31574	NC_011852	T	6	6	2085451	2085456	0 %	100 %	0 %	0 %	219872140
31575	NC_011852	TGT	2	6	2085460	2085465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872140
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31577	NC_011852	GTCATT	2	12	2085490	2085501	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219872140
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31584	NC_011852	CAT	2	6	2085911	2085916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
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31587	NC_011852	TTCA	2	8	2086149	2086156	25 %	50 %	0 %	25 %	219872141
31588	NC_011852	T	6	6	2086164	2086169	0 %	100 %	0 %	0 %	219872141
31589	NC_011852	AGT	2	6	2086224	2086229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872141
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31593	NC_011852	AATT	2	8	2086350	2086357	50 %	50 %	0 %	0 %	219872141
31594	NC_011852	TAC	2	6	2086398	2086403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
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31598	NC_011852	TCAA	2	8	2086624	2086631	50 %	25 %	0 %	25 %	219872141
31599	NC_011852	CGTC	2	8	2086661	2086668	0 %	25 %	25 %	50 %	219872141
31600	NC_011852	CAT	2	6	2086697	2086702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
31601	NC_011852	CTG	2	6	2086792	2086797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872141
31602	NC_011852	ATC	2	6	2086857	2086862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
31603	NC_011852	AG	3	6	2086952	2086957	50 %	0 %	50 %	0 %	219872141
31604	NC_011852	AAT	2	6	2086961	2086966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872141
31605	NC_011852	CAA	2	6	2086982	2086987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872141
31606	NC_011852	TTG	3	9	2087037	2087045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872141
31607	NC_011852	AAG	2	6	2087123	2087128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872141
31608	NC_011852	T	6	6	2087177	2087182	0 %	100 %	0 %	0 %	219872141
31609	NC_011852	CAT	2	6	2087183	2087188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
31610	NC_011852	CTTT	2	8	2087195	2087202	0 %	75 %	0 %	25 %	219872141
31611	NC_011852	GCAC	2	8	2087206	2087213	25 %	0 %	25 %	50 %	219872141
31612	NC_011852	AGC	2	6	2087373	2087378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872141
31613	NC_011852	AAATA	2	10	2087421	2087430	80 %	20 %	0 %	0 %	219872141
31614	NC_011852	A	6	6	2087715	2087720	100 %	0 %	0 %	0 %	219872142
31615	NC_011852	TGA	2	6	2087746	2087751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872142
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31617	NC_011852	TGG	2	6	2087838	2087843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872142
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