MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_011852	GCG	2	6	2040653	2040658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872110
31002	NC_011852	GTC	2	6	2040700	2040705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872110
31003	NC_011852	TTGC	2	8	2040719	2040726	0 %	50 %	25 %	25 %	219872110
31004	NC_011852	ATC	2	6	2040878	2040883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872110
31005	NC_011852	T	6	6	2040944	2040949	0 %	100 %	0 %	0 %	219872110
31006	NC_011852	TTAT	2	8	2041010	2041017	25 %	75 %	0 %	0 %	219872110
31007	NC_011852	TGA	2	6	2041026	2041031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872110
31008	NC_011852	CTATCT	2	12	2041168	2041179	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219872110
31009	NC_011852	CTTG	2	8	2041192	2041199	0 %	50 %	25 %	25 %	219872110
31010	NC_011852	TTA	2	6	2041229	2041234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872110
31011	NC_011852	GAT	2	6	2041306	2041311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872110
31012	NC_011852	TGT	2	6	2041332	2041337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872110
31013	NC_011852	CT	3	6	2041418	2041423	0 %	50 %	0 %	50 %	219872111
31014	NC_011852	GCC	2	6	2041440	2041445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219872111
31015	NC_011852	ACA	2	6	2041456	2041461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872111
31016	NC_011852	CT	3	6	2041530	2041535	0 %	50 %	0 %	50 %	219872111
31017	NC_011852	CTT	2	6	2041669	2041674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872111
31018	NC_011852	CAT	2	6	2041684	2041689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872111
31019	NC_011852	GTT	2	6	2041760	2041765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872111
31020	NC_011852	AGTTA	2	10	2041922	2041931	40 %	40 %	20 %	0 %	219872111
31021	NC_011852	ACC	2	6	2041956	2041961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872111
31022	NC_011852	AGT	2	6	2042005	2042010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872111
31023	NC_011852	CAT	2	6	2042086	2042091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872111
31024	NC_011852	TAAC	2	8	2042104	2042111	50 %	25 %	0 %	25 %	219872111
31025	NC_011852	AAT	2	6	2042175	2042180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872111
31026	NC_011852	CGCAC	2	10	2042319	2042328	20 %	0 %	20 %	60 %	219872111
31027	NC_011852	ATT	2	6	2042411	2042416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872111
31028	NC_011852	GTG	2	6	2042428	2042433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872111
31029	NC_011852	CAAT	2	8	2042494	2042501	50 %	25 %	0 %	25 %	219872111
31030	NC_011852	CAAC	2	8	2042527	2042534	50 %	0 %	0 %	50 %	219872111
31031	NC_011852	TAA	2	6	2042543	2042548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872111
31032	NC_011852	GTC	2	6	2042558	2042563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872111
31033	NC_011852	TTC	2	6	2042645	2042650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872111
31034	NC_011852	TGT	2	6	2042662	2042667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872111
31035	NC_011852	GGT	2	6	2044491	2044496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872112
31036	NC_011852	ATT	2	6	2044526	2044531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872112
31037	NC_011852	GGT	2	6	2044562	2044567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872112
31038	NC_011852	TGAA	2	8	2044615	2044622	50 %	25 %	25 %	0 %	219872112
31039	NC_011852	AGA	2	6	2044715	2044720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872112
31040	NC_011852	A	6	6	2044725	2044730	100 %	0 %	0 %	0 %	219872112
31041	NC_011852	GAAA	2	8	2044742	2044749	75 %	0 %	25 %	0 %	219872112
31042	NC_011852	ACGGT	2	10	2044849	2044858	20 %	20 %	40 %	20 %	219872112
31043	NC_011852	CAG	2	6	2044888	2044893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872112
31044	NC_011852	GGTTG	2	10	2044920	2044929	0 %	40 %	60 %	0 %	219872112
31045	NC_011852	GAT	2	6	2044940	2044945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872112
31046	NC_011852	ATT	2	6	2045054	2045059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872112
31047	NC_011852	CGC	2	6	2045139	2045144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219872113
31048	NC_011852	TTG	2	6	2045290	2045295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872113
31049	NC_011852	CAC	2	6	2045336	2045341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872113
31050	NC_011852	CAG	2	6	2045369	2045374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872113
31051	NC_011852	CGG	2	6	2045405	2045410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872113
31052	NC_011852	CTT	2	6	2045411	2045416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872113
31053	NC_011852	A	6	6	2045641	2045646	100 %	0 %	0 %	0 %	219872114
31054	NC_011852	T	8	8	2045753	2045760	0 %	100 %	0 %	0 %	219872114
31055	NC_011852	TTG	2	6	2045794	2045799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872114
31056	NC_011852	TCA	2	6	2045909	2045914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872115
31057	NC_011852	ATTA	2	8	2045930	2045937	50 %	50 %	0 %	0 %	219872115
31058	NC_011852	CTAT	2	8	2045968	2045975	25 %	50 %	0 %	25 %	219872115
31059	NC_011852	ATC	2	6	2045983	2045988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872115
31060	NC_011852	AAT	2	6	2045991	2045996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872115
31061	NC_011852	GCG	2	6	2046015	2046020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872115
31062	NC_011852	CCT	2	6	2046027	2046032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219872115
31063	NC_011852	T	7	7	2046074	2046080	0 %	100 %	0 %	0 %	219872115
31064	NC_011852	GTA	2	6	2046130	2046135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872115
31065	NC_011852	ATT	2	6	2046168	2046173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872115
31066	NC_011852	CAA	2	6	2046307	2046312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872115
31067	NC_011852	TGGTG	2	10	2046347	2046356	0 %	40 %	60 %	0 %	219872115
31068	NC_011852	TCA	2	6	2046431	2046436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872115
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31071	NC_011852	CGT	2	6	2046566	2046571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872116
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31073	NC_011852	GTC	2	6	2046629	2046634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872116
31074	NC_011852	TAA	2	6	2046672	2046677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872116
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31083	NC_011852	AAG	2	6	2047381	2047386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872116
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31087	NC_011852	AATC	2	8	2047584	2047591	50 %	25 %	0 %	25 %	219872116
31088	NC_011852	A	7	7	2047629	2047635	100 %	0 %	0 %	0 %	219872116
31089	NC_011852	GGTT	2	8	2047674	2047681	0 %	50 %	50 %	0 %	219872116
31090	NC_011852	TGG	2	6	2047706	2047711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872116
31091	NC_011852	TTGGC	2	10	2047747	2047756	0 %	40 %	40 %	20 %	219872116
31092	NC_011852	AACC	2	8	2047775	2047782	50 %	0 %	0 %	50 %	219872116
31093	NC_011852	GTTA	2	8	2047797	2047804	25 %	50 %	25 %	0 %	219872116
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31097	NC_011852	TGA	3	9	2048130	2048138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872117
31098	NC_011852	A	7	7	2048155	2048161	100 %	0 %	0 %	0 %	219872117
31099	NC_011852	GAA	2	6	2048164	2048169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872117
31100	NC_011852	TGA	2	6	2048280	2048285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872117
31101	NC_011852	GAT	2	6	2048311	2048316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872117
31102	NC_011852	TTG	2	6	2048324	2048329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872117
31103	NC_011852	GTC	2	6	2048351	2048356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872117
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31105	NC_011852	GAAA	2	8	2048394	2048401	75 %	0 %	25 %	0 %	219872117
31106	NC_011852	ATC	2	6	2048491	2048496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872117
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31108	NC_011852	ATA	2	6	2048816	2048821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872117
31109	NC_011852	TGA	2	6	2048859	2048864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872117
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31111	NC_011852	AG	3	6	2048981	2048986	50 %	0 %	50 %	0 %	219872117
31112	NC_011852	CTT	3	9	2049454	2049462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872118
31113	NC_011852	TTA	2	6	2049534	2049539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872118
31114	NC_011852	AGC	2	6	2050171	2050176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872119
31115	NC_011852	CAA	2	6	2050179	2050184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872119
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31117	NC_011852	CTA	2	6	2050236	2050241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872119
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31236	NC_011852	A	6	6	2059366	2059371	100 %	0 %	0 %	0 %	219872124
31237	NC_011852	AT	3	6	2059379	2059384	50 %	50 %	0 %	0 %	219872124
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31245	NC_011852	A	6	6	2059702	2059707	100 %	0 %	0 %	0 %	219872124
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31352	NC_011852	AAAG	2	8	2066199	2066206	75 %	0 %	25 %	0 %	219872127
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31467	NC_011852	TTCTAT	2	12	2080266	2080277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219872136
31468	NC_011852	CAG	2	6	2080314	2080319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872136
31469	NC_011852	TCA	2	6	2080348	2080353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872136
31470	NC_011852	CTT	2	6	2080357	2080362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872136
31471	NC_011852	AAG	2	6	2080405	2080410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872136
31472	NC_011852	CGG	2	6	2080416	2080421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872136
31473	NC_011852	CAT	2	6	2080426	2080431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872136
31474	NC_011852	AAAGA	2	10	2080460	2080469	80 %	0 %	20 %	0 %	219872136
31475	NC_011852	GTTT	2	8	2080474	2080481	0 %	75 %	25 %	0 %	219872136
31476	NC_011852	ACG	2	6	2080514	2080519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872136
31477	NC_011852	TGA	2	6	2080573	2080578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872136
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31479	NC_011852	GAT	2	6	2080624	2080629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872136
31480	NC_011852	TCA	2	6	2080686	2080691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872136
31481	NC_011852	TTC	2	6	2080715	2080720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872136
31482	NC_011852	ATTC	2	8	2080757	2080764	25 %	50 %	0 %	25 %	219872136
31483	NC_011852	GTT	2	6	2080785	2080790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872136
31484	NC_011852	AG	3	6	2080863	2080868	50 %	0 %	50 %	0 %	219872136
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31486	NC_011852	TAC	2	6	2080979	2080984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872136
31487	NC_011852	TGC	2	6	2081003	2081008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872136
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31490	NC_011852	TTG	2	6	2081198	2081203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872136
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31492	NC_011852	T	6	6	2081350	2081355	0 %	100 %	0 %	0 %	219872137
31493	NC_011852	ATC	2	6	2081370	2081375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
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31495	NC_011852	A	6	6	2081472	2081477	100 %	0 %	0 %	0 %	219872137
31496	NC_011852	AAAT	2	8	2081521	2081528	75 %	25 %	0 %	0 %	219872137
31497	NC_011852	TCA	2	6	2081538	2081543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
31498	NC_011852	T	6	6	2081559	2081564	0 %	100 %	0 %	0 %	219872137
31499	NC_011852	CCT	2	6	2081565	2081570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219872137
31500	NC_011852	TC	3	6	2081583	2081588	0 %	50 %	0 %	50 %	219872137

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