MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_011852	TTG	2	6	1962976	1962981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872043
30003	NC_011852	A	6	6	1963159	1963164	100 %	0 %	0 %	0 %	219872043
30004	NC_011852	CAAGG	2	10	1963168	1963177	40 %	0 %	40 %	20 %	219872043
30005	NC_011852	CAA	2	6	1963185	1963190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872043
30006	NC_011852	ATA	2	6	1963249	1963254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872043
30007	NC_011852	GA	3	6	1963294	1963299	50 %	0 %	50 %	0 %	219872043
30008	NC_011852	ATC	2	6	1963318	1963323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872043
30009	NC_011852	AAACAT	2	12	1963369	1963380	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219872043
30010	NC_011852	ACG	3	9	1964156	1964164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872044
30011	NC_011852	CCAA	2	8	1964208	1964215	50 %	0 %	0 %	50 %	219872044
30012	NC_011852	AGT	2	6	1964224	1964229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872044
30013	NC_011852	ACC	2	6	1964258	1964263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872044
30014	NC_011852	T	6	6	1964275	1964280	0 %	100 %	0 %	0 %	219872044
30015	NC_011852	ACGAAT	2	12	1964300	1964311	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219872044
30016	NC_011852	ACG	2	6	1964348	1964353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872044
30017	NC_011852	GGT	2	6	1964579	1964584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872044
30018	NC_011852	CTTC	2	8	1964679	1964686	0 %	50 %	0 %	50 %	219872044
30019	NC_011852	GTA	2	6	1964723	1964728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872044
30020	NC_011852	CTT	2	6	1964875	1964880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872044
30021	NC_011852	T	6	6	1964920	1964925	0 %	100 %	0 %	0 %	219872044
30022	NC_011852	CGA	2	6	1964938	1964943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872044
30023	NC_011852	CGGT	2	8	1964980	1964987	0 %	25 %	50 %	25 %	219872044
30024	NC_011852	T	7	7	1964996	1965002	0 %	100 %	0 %	0 %	219872044
30025	NC_011852	GTC	2	6	1965108	1965113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872044
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30027	NC_011852	TGT	2	6	1965358	1965363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872045
30028	NC_011852	ACC	2	6	1965382	1965387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872045
30029	NC_011852	AAT	2	6	1965391	1965396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872045
30030	NC_011852	TCA	2	6	1965431	1965436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872045
30031	NC_011852	ATT	2	6	1965529	1965534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872045
30032	NC_011852	ACG	2	6	1965574	1965579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872045
30033	NC_011852	GCAG	2	8	1965596	1965603	25 %	0 %	50 %	25 %	219872045
30034	NC_011852	ATT	2	6	1965628	1965633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872045
30035	NC_011852	GATT	2	8	1965650	1965657	25 %	50 %	25 %	0 %	219872045
30036	NC_011852	ACG	2	6	1965730	1965735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872045
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30038	NC_011852	TGA	2	6	1965831	1965836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872045
30039	NC_011852	ATTA	2	8	1965850	1965857	50 %	50 %	0 %	0 %	219872045
30040	NC_011852	GTT	2	6	1965861	1965866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872045
30041	NC_011852	AAT	2	6	1967136	1967141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872046
30042	NC_011852	TGC	2	6	1967152	1967157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872046
30043	NC_011852	ATC	2	6	1967202	1967207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872046
30044	NC_011852	TGT	2	6	1967395	1967400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872046
30045	NC_011852	GGTT	2	8	1967403	1967410	0 %	50 %	50 %	0 %	219872046
30046	NC_011852	TCTT	2	8	1967448	1967455	0 %	75 %	0 %	25 %	219872046
30047	NC_011852	TCA	2	6	1967491	1967496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872046
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30049	NC_011852	ATTA	2	8	1967730	1967737	50 %	50 %	0 %	0 %	219872047
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30052	NC_011852	TACGA	2	10	1967836	1967845	40 %	20 %	20 %	20 %	219872047
30053	NC_011852	TTA	2	6	1967852	1967857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872047
30054	NC_011852	TAT	2	6	1967912	1967917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872047
30055	NC_011852	TGA	2	6	1967963	1967968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872047
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30058	NC_011852	TGA	2	6	1968162	1968167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872047
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30060	NC_011852	CGT	2	6	1968238	1968243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872048
30061	NC_011852	TGA	2	6	1968300	1968305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872048
30062	NC_011852	TTAA	2	8	1968316	1968323	50 %	50 %	0 %	0 %	219872048
30063	NC_011852	ATTG	2	8	1968339	1968346	25 %	50 %	25 %	0 %	219872048
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30085	NC_011852	TTCA	2	8	1969592	1969599	25 %	50 %	0 %	25 %	219872049
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30100	NC_011852	GTT	2	6	1970569	1970574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872049
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30102	NC_011852	AG	3	6	1970628	1970633	50 %	0 %	50 %	0 %	219872049
30103	NC_011852	AAT	2	6	1970746	1970751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872050
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30105	NC_011852	TTTG	2	8	1970805	1970812	0 %	75 %	25 %	0 %	219872050
30106	NC_011852	A	6	6	1970819	1970824	100 %	0 %	0 %	0 %	219872050
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30114	NC_011852	TAA	2	6	1971000	1971005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872050
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30351	NC_011852	CGCC	2	8	1995107	1995114	0 %	0 %	25 %	75 %	219872063
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30467	NC_011852	TCG	2	6	2002990	2002995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872072
30468	NC_011852	AC	3	6	2003012	2003017	50 %	0 %	0 %	50 %	219872072
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30471	NC_011852	TGA	2	6	2003065	2003070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872072
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30475	NC_011852	ATG	2	6	2003455	2003460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872073
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30482	NC_011852	A	6	6	2003871	2003876	100 %	0 %	0 %	0 %	219872073
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