MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29970	NC_011852	GCTTA	2	10	1961193	1961202	20 %	40 %	20 %	20 %	219872042
29971	NC_011852	TCA	2	6	1961209	1961214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872042
29972	NC_011852	GAT	2	6	1961249	1961254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872042
29973	NC_011852	TTG	2	6	1961292	1961297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872042
29974	NC_011852	TTG	2	6	1961352	1961357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872042
29975	NC_011852	CTA	2	6	1961387	1961392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872042
29976	NC_011852	CAA	2	6	1961394	1961399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872042
29977	NC_011852	AAT	2	6	1961501	1961506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872042
29978	NC_011852	TTTGG	2	10	1961520	1961529	0 %	60 %	40 %	0 %	219872042
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29980	NC_011852	ATA	2	6	1962062	1962067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872043
29981	NC_011852	GAACAT	2	12	1962132	1962143	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219872043
29982	NC_011852	ACGC	2	8	1962190	1962197	25 %	0 %	25 %	50 %	219872043
29983	NC_011852	GTG	2	6	1962205	1962210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872043
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29988	NC_011852	TCT	2	6	1962326	1962331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872043
29989	NC_011852	GAT	2	6	1962408	1962413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872043
29990	NC_011852	AT	3	6	1962426	1962431	50 %	50 %	0 %	0 %	219872043
29991	NC_011852	ATAA	2	8	1962434	1962441	75 %	25 %	0 %	0 %	219872043
29992	NC_011852	CTTT	2	8	1962452	1962459	0 %	75 %	0 %	25 %	219872043
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29999	NC_011852	A	6	6	1962735	1962740	100 %	0 %	0 %	0 %	219872043
30000	NC_011852	AAT	2	6	1962867	1962872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872043

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