MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28350	NC_011852	AGCC	2	8	1856870	1856877	25 %	0 %	25 %	50 %	219871953
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28353	NC_011852	ACT	2	6	1857171	1857176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871954
28354	NC_011852	GAA	2	6	1857206	1857211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871954
28355	NC_011852	GTG	2	6	1857221	1857226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871954
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28383	NC_011852	A	6	6	1858751	1858756	100 %	0 %	0 %	0 %	219871954
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28461	NC_011852	TCAA	2	8	1863614	1863621	50 %	25 %	0 %	25 %	219871960
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28467	NC_011852	TTA	2	6	1864172	1864177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871960
28468	NC_011852	TA	3	6	1864204	1864209	50 %	50 %	0 %	0 %	219871960
28469	NC_011852	GT	3	6	1864240	1864245	0 %	50 %	50 %	0 %	219871960
28470	NC_011852	AGA	3	9	1864364	1864372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871960
28471	NC_011852	GAT	2	6	1864373	1864378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871960
28472	NC_011852	CT	3	6	1864389	1864394	0 %	50 %	0 %	50 %	219871960
28473	NC_011852	TTA	2	6	1864421	1864426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871960
28474	NC_011852	GAT	2	6	1864620	1864625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871961
28475	NC_011852	TCG	2	6	1864636	1864641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871961
28476	NC_011852	A	6	6	1864683	1864688	100 %	0 %	0 %	0 %	219871961
28477	NC_011852	TTA	2	6	1864696	1864701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871961
28478	NC_011852	CCATTT	2	12	1864743	1864754	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219871961
28479	NC_011852	AAG	2	6	1864762	1864767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871961
28480	NC_011852	GA	3	6	1864772	1864777	50 %	0 %	50 %	0 %	219871961
28481	NC_011852	TGG	2	6	1864798	1864803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871961
28482	NC_011852	GAT	2	6	1864806	1864811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871961
28483	NC_011852	CTT	2	6	1864856	1864861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871961
28484	NC_011852	TGC	2	6	1864943	1864948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871961
28485	NC_011852	TAC	2	6	1864950	1864955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871961
28486	NC_011852	T	7	7	1864957	1864963	0 %	100 %	0 %	0 %	219871961
28487	NC_011852	ATT	2	6	1865010	1865015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871961
28488	NC_011852	GCTG	2	8	1865016	1865023	0 %	25 %	50 %	25 %	219871961
28489	NC_011852	TAT	2	6	1865035	1865040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871961
28490	NC_011852	CGT	2	6	1865055	1865060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871961
28491	NC_011852	ATT	2	6	1865082	1865087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871961
28492	NC_011852	ATC	2	6	1865142	1865147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871961
28493	NC_011852	CAA	2	6	1865184	1865189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871961
28494	NC_011852	CAC	2	6	1865195	1865200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871961
28495	NC_011852	ACT	2	6	1865296	1865301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871961
28496	NC_011852	GGT	2	6	1865340	1865345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871961
28497	NC_011852	AGC	2	6	1865354	1865359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871961
28498	NC_011852	TCT	2	6	1865367	1865372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871961
28499	NC_011852	GAT	2	6	1865441	1865446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871961
28500	NC_011852	TCA	2	6	1865496	1865501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871961

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