MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_011852	TCA	2	6	1760390	1760395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871870
27003	NC_011852	CCA	2	6	1760420	1760425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871870
27004	NC_011852	ATA	2	6	1760453	1760458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871870
27005	NC_011852	GTT	2	6	1760479	1760484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871870
27006	NC_011852	T	6	6	1760490	1760495	0 %	100 %	0 %	0 %	219871870
27007	NC_011852	CAG	2	6	1760527	1760532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871870
27008	NC_011852	AAG	2	6	1760666	1760671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871870
27009	NC_011852	TAA	2	6	1760677	1760682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871870
27010	NC_011852	TAAG	2	8	1760806	1760813	50 %	25 %	25 %	0 %	219871870
27011	NC_011852	CAA	2	6	1760850	1760855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871870
27012	NC_011852	CAA	2	6	1760860	1760865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871870
27013	NC_011852	GAG	2	6	1760913	1760918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219871870
27014	NC_011852	GAAG	2	8	1760919	1760926	50 %	0 %	50 %	0 %	219871870
27015	NC_011852	ACC	2	6	1760980	1760985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871870
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27017	NC_011852	CAC	2	6	1761022	1761027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871870
27018	NC_011852	A	6	6	1761040	1761045	100 %	0 %	0 %	0 %	219871870
27019	NC_011852	ATC	2	6	1761170	1761175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871870
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27021	NC_011852	TAA	2	6	1761280	1761285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871870
27022	NC_011852	AAT	2	6	1761292	1761297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871870
27023	NC_011852	ATC	2	6	1761332	1761337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871870
27024	NC_011852	AAT	2	6	1761349	1761354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871870
27025	NC_011852	ATC	2	6	1761362	1761367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871870
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27027	NC_011852	ATTG	2	8	1761671	1761678	25 %	50 %	25 %	0 %	219871871
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27031	NC_011852	TAT	2	6	1761815	1761820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871871
27032	NC_011852	A	7	7	1761837	1761843	100 %	0 %	0 %	0 %	219871871
27033	NC_011852	CAA	2	6	1761869	1761874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871871
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27035	NC_011852	TATTGA	2	12	1762025	1762036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219871871
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27038	NC_011852	TAA	2	6	1762213	1762218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871872
27039	NC_011852	CAT	2	6	1762252	1762257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871872
27040	NC_011852	ATC	2	6	1762340	1762345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871872
27041	NC_011852	GTT	2	6	1762399	1762404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871872
27042	NC_011852	TGC	2	6	1762583	1762588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871872
27043	NC_011852	TTG	2	6	1762613	1762618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871872
27044	NC_011852	ACT	2	6	1762631	1762636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871872
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27051	NC_011852	T	7	7	1763354	1763360	0 %	100 %	0 %	0 %	219871873
27052	NC_011852	TTG	2	6	1763414	1763419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871873
27053	NC_011852	AGT	2	6	1763610	1763615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871873
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27055	NC_011852	TCAT	2	8	1763645	1763652	25 %	50 %	0 %	25 %	219871873
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27062	NC_011852	TTGG	2	8	1764024	1764031	0 %	50 %	50 %	0 %	219871874
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27100	NC_011852	CGTGAC	2	12	1766522	1766533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219871877
27101	NC_011852	TCA	2	6	1766599	1766604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871877
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27104	NC_011852	TTG	2	6	1766805	1766810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871877
27105	NC_011852	ACG	2	6	1766826	1766831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871877
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27351	NC_011852	GTTT	2	8	1782980	1782987	0 %	75 %	25 %	0 %	219871895
27352	NC_011852	AGCC	2	8	1783028	1783035	25 %	0 %	25 %	50 %	219871895
27353	NC_011852	CAT	2	6	1783212	1783217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871895
27354	NC_011852	CAT	2	6	1783272	1783277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871895
27355	NC_011852	GAA	2	6	1783407	1783412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871895
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27357	NC_011852	CAA	2	6	1783479	1783484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871895
27358	NC_011852	CAA	2	6	1783530	1783535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871895
27359	NC_011852	AGTT	2	8	1783555	1783562	25 %	50 %	25 %	0 %	219871895
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