MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_011852	GGC	2	6	1694477	1694482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871814
26003	NC_011852	ATC	2	6	1694498	1694503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871814
26004	NC_011852	TCC	2	6	1694517	1694522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219871814
26005	NC_011852	CGG	2	6	1694566	1694571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871814
26006	NC_011852	CTT	2	6	1694641	1694646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871814
26007	NC_011852	CAT	2	6	1694671	1694676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871814
26008	NC_011852	ACG	2	6	1694708	1694713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871814
26009	NC_011852	GAT	2	6	1694776	1694781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871814
26010	NC_011852	CCTC	2	8	1694799	1694806	0 %	25 %	0 %	75 %	219871814
26011	NC_011852	TAA	2	6	1694814	1694819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871814
26012	NC_011852	CGT	2	6	1694845	1694850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871814
26013	NC_011852	GGT	2	6	1694903	1694908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871814
26014	NC_011852	TTC	2	6	1694954	1694959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871814
26015	NC_011852	AAT	2	6	1694985	1694990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871814
26016	NC_011852	TGA	2	6	1695021	1695026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871814
26017	NC_011852	TGG	2	6	1695105	1695110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871814
26018	NC_011852	TCT	2	6	1695222	1695227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871814
26019	NC_011852	CTT	2	6	1695235	1695240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871814
26020	NC_011852	TTC	2	6	1695254	1695259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871814
26021	NC_011852	CTA	2	6	1695289	1695294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871814
26022	NC_011852	ATT	2	6	1695320	1695325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871814
26023	NC_011852	TGAA	2	8	1695346	1695353	50 %	25 %	25 %	0 %	219871814
26024	NC_011852	TCA	3	9	1695457	1695465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871814
26025	NC_011852	TAAT	2	8	1695561	1695568	50 %	50 %	0 %	0 %	219871814
26026	NC_011852	A	6	6	1695606	1695611	100 %	0 %	0 %	0 %	219871814
26027	NC_011852	GTCT	2	8	1695617	1695624	0 %	50 %	25 %	25 %	219871814
26028	NC_011852	TGTT	2	8	1695636	1695643	0 %	75 %	25 %	0 %	219871814
26029	NC_011852	TTG	2	6	1695648	1695653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871814
26030	NC_011852	TAC	2	6	1695667	1695672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871814
26031	NC_011852	TGA	2	6	1695751	1695756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871814
26032	NC_011852	T	6	6	1695770	1695775	0 %	100 %	0 %	0 %	219871814
26033	NC_011852	AAC	2	6	1695809	1695814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871814
26034	NC_011852	GT	3	6	1695946	1695951	0 %	50 %	50 %	0 %	219871814
26035	NC_011852	AACG	2	8	1696057	1696064	50 %	0 %	25 %	25 %	219871814
26036	NC_011852	TCC	2	6	1696098	1696103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219871814
26037	NC_011852	TGTC	2	8	1696110	1696117	0 %	50 %	25 %	25 %	219871814
26038	NC_011852	TCT	2	6	1696125	1696130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871814
26039	NC_011852	TTA	2	6	1696162	1696167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871814
26040	NC_011852	TCA	2	6	1696198	1696203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871814
26041	NC_011852	TTA	2	6	1696560	1696565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871815
26042	NC_011852	A	7	7	1696602	1696608	100 %	0 %	0 %	0 %	219871815
26043	NC_011852	GAA	2	6	1696680	1696685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871815
26044	NC_011852	GCA	2	6	1696703	1696708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871815
26045	NC_011852	T	7	7	1696781	1696787	0 %	100 %	0 %	0 %	219871815
26046	NC_011852	GGT	2	6	1696799	1696804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871815
26047	NC_011852	GAC	2	6	1696815	1696820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871815
26048	NC_011852	CCA	2	6	1697457	1697462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871816
26049	NC_011852	TGT	2	6	1697573	1697578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871816
26050	NC_011852	CGG	2	6	1697621	1697626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871816
26051	NC_011852	TCA	2	6	1697652	1697657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871816
26052	NC_011852	ATC	2	6	1697663	1697668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871816
26053	NC_011852	ATA	2	6	1697730	1697735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871816
26054	NC_011852	A	6	6	1697920	1697925	100 %	0 %	0 %	0 %	219871817
26055	NC_011852	CAA	2	6	1697999	1698004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871817
26056	NC_011852	CAAA	2	8	1698034	1698041	75 %	0 %	0 %	25 %	219871817
26057	NC_011852	GCTT	2	8	1698106	1698113	0 %	50 %	25 %	25 %	219871817
26058	NC_011852	TTA	2	6	1699843	1699848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871818
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26061	NC_011852	CGGT	2	8	1700121	1700128	0 %	25 %	50 %	25 %	219871818
26062	NC_011852	CGC	2	6	1700146	1700151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871818
26063	NC_011852	AGT	2	6	1700217	1700222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871818
26064	NC_011852	CAA	2	6	1700229	1700234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871818
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26066	NC_011852	GCC	2	6	1700272	1700277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871818
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26070	NC_011852	CTG	2	6	1700484	1700489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871818
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26072	NC_011852	TACG	2	8	1700658	1700665	25 %	25 %	25 %	25 %	219871818
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26074	NC_011852	T	6	6	1700829	1700834	0 %	100 %	0 %	0 %	219871819
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26089	NC_011852	ACCGAT	2	12	1701651	1701662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219871819
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26107	NC_011852	CCAA	2	8	1702476	1702483	50 %	0 %	0 %	50 %	219871820
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26112	NC_011852	AC	3	6	1702766	1702771	50 %	0 %	0 %	50 %	219871820
26113	NC_011852	GCG	2	6	1702787	1702792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871820
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26468	NC_011852	TAT	2	6	1723165	1723170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871840
26469	NC_011852	A	6	6	1723172	1723177	100 %	0 %	0 %	0 %	219871840
26470	NC_011852	GCA	2	6	1723199	1723204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871840
26471	NC_011852	TCA	2	6	1723223	1723228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871840
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26483	NC_011852	TTA	2	6	1723824	1723829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871841
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