MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_011852	ATC	2	6	1553548	1553553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871700
24003	NC_011852	TTG	2	6	1553590	1553595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871700
24004	NC_011852	T	6	6	1553621	1553626	0 %	100 %	0 %	0 %	219871700
24005	NC_011852	GTC	2	6	1553728	1553733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871700
24006	NC_011852	CTT	2	6	1553757	1553762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871700
24007	NC_011852	TGA	2	6	1553856	1553861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871700
24008	NC_011852	ATA	2	6	1553918	1553923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871700
24009	NC_011852	TGGC	2	8	1553956	1553963	0 %	25 %	50 %	25 %	219871700
24010	NC_011852	TTG	2	6	1553994	1553999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871700
24011	NC_011852	T	6	6	1554019	1554024	0 %	100 %	0 %	0 %	219871700
24012	NC_011852	TGA	2	6	1554101	1554106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871700
24013	NC_011852	CCG	2	6	1554168	1554173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871700
24014	NC_011852	GCCCA	2	10	1554180	1554189	20 %	0 %	20 %	60 %	219871700
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24016	NC_011852	GGA	2	6	1554281	1554286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219871700
24017	NC_011852	A	6	6	1554308	1554313	100 %	0 %	0 %	0 %	219871700
24018	NC_011852	TAA	2	6	1554544	1554549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871700
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24020	NC_011852	TGC	2	6	1555042	1555047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871701
24021	NC_011852	TATTGA	2	12	1555081	1555092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219871701
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24024	NC_011852	A	6	6	1555371	1555376	100 %	0 %	0 %	0 %	219871701
24025	NC_011852	A	6	6	1555388	1555393	100 %	0 %	0 %	0 %	219871701
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24028	NC_011852	ATT	2	6	1555571	1555576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871702
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24034	NC_011852	CTTT	2	8	1555754	1555761	0 %	75 %	0 %	25 %	219871702
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24040	NC_011852	ATTCC	2	10	1556209	1556218	20 %	40 %	0 %	40 %	219871702
24041	NC_011852	TGCG	2	8	1556273	1556280	0 %	25 %	50 %	25 %	219871702
24042	NC_011852	TTGC	2	8	1556471	1556478	0 %	50 %	25 %	25 %	219871703
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24044	NC_011852	TGA	2	6	1556585	1556590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871703
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24101	NC_011852	GTCT	2	8	1562342	1562349	0 %	50 %	25 %	25 %	219871708
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24105	NC_011852	TAG	2	6	1562645	1562650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871709
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24107	NC_011852	CTCC	2	8	1562840	1562847	0 %	25 %	0 %	75 %	219871710
24108	NC_011852	TGGTT	2	10	1562901	1562910	0 %	60 %	40 %	0 %	219871710
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24117	NC_011852	ATC	2	6	1563314	1563319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871711
24118	NC_011852	A	6	6	1563322	1563327	100 %	0 %	0 %	0 %	219871711
24119	NC_011852	TTC	2	6	1564014	1564019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871712
24120	NC_011852	AGT	2	6	1564064	1564069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871712
24121	NC_011852	GCTC	2	8	1564120	1564127	0 %	25 %	25 %	50 %	219871712
24122	NC_011852	TAA	2	6	1564220	1564225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871712
24123	NC_011852	TAC	2	6	1564314	1564319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871712
24124	NC_011852	CTTT	2	8	1564438	1564445	0 %	75 %	0 %	25 %	219871712
24125	NC_011852	TTTTGC	2	12	1564464	1564475	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	219871712
24126	NC_011852	TTA	2	6	1564660	1564665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871712
24127	NC_011852	CT	4	8	1564751	1564758	0 %	50 %	0 %	50 %	219871712
24128	NC_011852	GGA	2	6	1564826	1564831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219871712
24129	NC_011852	TAAA	2	8	1564841	1564848	75 %	25 %	0 %	0 %	219871712
24130	NC_011852	GTTC	2	8	1564867	1564874	0 %	50 %	25 %	25 %	219871712
24131	NC_011852	T	6	6	1564922	1564927	0 %	100 %	0 %	0 %	219871712
24132	NC_011852	CTTGCT	2	12	1564952	1564963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219871712
24133	NC_011852	CTTG	2	8	1565035	1565042	0 %	50 %	25 %	25 %	219871712
24134	NC_011852	AAAC	2	8	1565117	1565124	75 %	0 %	0 %	25 %	219871712
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24138	NC_011852	TCAAG	2	10	1565924	1565933	40 %	20 %	20 %	20 %	219871713
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24148	NC_011852	CGCAA	2	10	1566330	1566339	40 %	0 %	20 %	40 %	219871713
24149	NC_011852	GTGA	2	8	1566411	1566418	25 %	25 %	50 %	0 %	219871713
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24152	NC_011852	ACCT	2	8	1566508	1566515	25 %	25 %	0 %	50 %	219871713
24153	NC_011852	GCCGA	2	10	1566516	1566525	20 %	0 %	40 %	40 %	219871713
24154	NC_011852	CAA	2	6	1566531	1566536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871713
24155	NC_011852	ACT	2	6	1566581	1566586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871713
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24157	NC_011852	A	6	6	1566618	1566623	100 %	0 %	0 %	0 %	219871713
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24162	NC_011852	A	6	6	1566901	1566906	100 %	0 %	0 %	0 %	219871713
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24228	NC_011852	GTGCG	2	10	1571878	1571887	0 %	20 %	60 %	20 %	219871716
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24230	NC_011852	TCA	2	6	1571982	1571987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871716
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24233	NC_011852	AC	3	6	1572110	1572115	50 %	0 %	0 %	50 %	219871716
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24235	NC_011852	CAA	2	6	1572203	1572208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871716
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24469	NC_011852	CTT	2	6	1585971	1585976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871725
24470	NC_011852	ACCG	2	8	1586125	1586132	25 %	0 %	25 %	50 %	219871725
24471	NC_011852	ATA	2	6	1586173	1586178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871725
24472	NC_011852	GT	3	6	1586223	1586228	0 %	50 %	50 %	0 %	219871725
24473	NC_011852	TTGG	2	8	1586288	1586295	0 %	50 %	50 %	0 %	219871725
24474	NC_011852	ATC	2	6	1586309	1586314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871725
24475	NC_011852	TCA	2	6	1586559	1586564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871726
24476	NC_011852	CTT	3	9	1586599	1586607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871726
24477	NC_011852	TG	3	6	1586626	1586631	0 %	50 %	50 %	0 %	219871726
24478	NC_011852	ACGC	2	8	1586772	1586779	25 %	0 %	25 %	50 %	219871726
24479	NC_011852	TAA	2	6	1586786	1586791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871726
24480	NC_011852	AAG	2	6	1586805	1586810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871726
24481	NC_011852	TTTAC	2	10	1586937	1586946	20 %	60 %	0 %	20 %	219871726
24482	NC_011852	TGA	2	6	1586957	1586962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871726
24483	NC_011852	TAA	2	6	1587020	1587025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871726
24484	NC_011852	GT	3	6	1587101	1587106	0 %	50 %	50 %	0 %	219871726
24485	NC_011852	TTTGT	2	10	1587122	1587131	0 %	80 %	20 %	0 %	219871726
24486	NC_011852	TACC	2	8	1587214	1587221	25 %	25 %	0 %	50 %	219871726
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24490	NC_011852	TGC	3	9	1587383	1587391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871726
24491	NC_011852	T	6	6	1587406	1587411	0 %	100 %	0 %	0 %	219871726
24492	NC_011852	AAGG	2	8	1587427	1587434	50 %	0 %	50 %	0 %	219871726
24493	NC_011852	T	6	6	1587449	1587454	0 %	100 %	0 %	0 %	219871726
24494	NC_011852	GCA	2	6	1587459	1587464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871726
24495	NC_011852	CAT	3	9	1587514	1587522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871726
24496	NC_011852	AAT	2	6	1587530	1587535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871726
24497	NC_011852	ACC	2	6	1587554	1587559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871726
24498	NC_011852	TTCA	2	8	1587590	1587597	25 %	50 %	0 %	25 %	219871726
24499	NC_011852	TTTG	2	8	1587662	1587669	0 %	75 %	25 %	0 %	219871726
24500	NC_011852	CAG	2	6	1587712	1587717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871726

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