MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_011852	GA	3	6	1523195	1523200	50 %	0 %	50 %	0 %	219871668
23503	NC_011852	AAT	2	6	1523214	1523219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871668
23504	NC_011852	ATA	2	6	1523267	1523272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871668
23505	NC_011852	ATG	2	6	1523299	1523304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871668
23506	NC_011852	TGGT	2	8	1523375	1523382	0 %	50 %	50 %	0 %	219871668
23507	NC_011852	TTG	2	6	1523439	1523444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871668
23508	NC_011852	TCC	2	6	1523448	1523453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219871668
23509	NC_011852	TGA	2	6	1523468	1523473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871668
23510	NC_011852	ATA	2	6	1523599	1523604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871668
23511	NC_011852	GTT	2	6	1523682	1523687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871668
23512	NC_011852	T	6	6	1523697	1523702	0 %	100 %	0 %	0 %	219871668
23513	NC_011852	CAC	2	6	1523720	1523725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871668
23514	NC_011852	CAAA	2	8	1523744	1523751	75 %	0 %	0 %	25 %	219871668
23515	NC_011852	TCA	2	6	1523881	1523886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871668
23516	NC_011852	CAT	2	6	1523937	1523942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871668
23517	NC_011852	TTC	2	6	1523952	1523957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871668
23518	NC_011852	AGT	2	6	1523970	1523975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871668
23519	NC_011852	TCA	2	6	1524019	1524024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871668
23520	NC_011852	GA	3	6	1524053	1524058	50 %	0 %	50 %	0 %	219871668
23521	NC_011852	T	6	6	1524081	1524086	0 %	100 %	0 %	0 %	219871668
23522	NC_011852	TA	3	6	1524104	1524109	50 %	50 %	0 %	0 %	219871668
23523	NC_011852	GTT	2	6	1524110	1524115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871668
23524	NC_011852	GTT	2	6	1524139	1524144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871668
23525	NC_011852	ATG	2	6	1524157	1524162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871668
23526	NC_011852	CAT	2	6	1524170	1524175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871668
23527	NC_011852	TAGCAA	2	12	1524188	1524199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219871668
23528	NC_011852	AG	3	6	1524267	1524272	50 %	0 %	50 %	0 %	219871668
23529	NC_011852	CTG	2	6	1524278	1524283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871668
23530	NC_011852	TAA	2	6	1524309	1524314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871668
23531	NC_011852	GA	3	6	1524380	1524385	50 %	0 %	50 %	0 %	219871668
23532	NC_011852	ATC	2	6	1524453	1524458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871668
23533	NC_011852	AATT	2	8	1524462	1524469	50 %	50 %	0 %	0 %	219871668
23534	NC_011852	TCA	2	6	1524478	1524483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871668
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23540	NC_011852	T	7	7	1525079	1525085	0 %	100 %	0 %	0 %	219871669
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23552	NC_011852	TAT	2	6	1526067	1526072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871670
23553	NC_011852	AACG	2	8	1526112	1526119	50 %	0 %	25 %	25 %	219871670
23554	NC_011852	ACC	2	6	1526167	1526172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871670
23555	NC_011852	TGGAAT	2	12	1526197	1526208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871670
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23601	NC_011852	AT	3	6	1529207	1529212	50 %	50 %	0 %	0 %	219871672
23602	NC_011852	TTG	2	6	1529262	1529267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871672
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23610	NC_011852	CAT	2	6	1529709	1529714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871673
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23968	NC_011852	AACG	2	8	1551582	1551589	50 %	0 %	25 %	25 %	219871698
23969	NC_011852	GAT	2	6	1551735	1551740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871698
23970	NC_011852	CAC	2	6	1551798	1551803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871698
23971	NC_011852	CTA	2	6	1551822	1551827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871698
23972	NC_011852	GTA	2	6	1551864	1551869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871698
23973	NC_011852	CTT	2	6	1551891	1551896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871698
23974	NC_011852	AATA	2	8	1551976	1551983	75 %	25 %	0 %	0 %	219871698
23975	NC_011852	AT	3	6	1552058	1552063	50 %	50 %	0 %	0 %	219871698
23976	NC_011852	AG	3	6	1552255	1552260	50 %	0 %	50 %	0 %	219871698
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23997	NC_011852	GAAT	2	8	1553375	1553382	50 %	25 %	25 %	0 %	219871699
23998	NC_011852	C	6	6	1553455	1553460	0 %	0 %	0 %	100 %	219871700
23999	NC_011852	CAA	2	6	1553482	1553487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871700
24000	NC_011852	CAG	2	6	1553497	1553502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871700

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