MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23004	NC_011852	T	7	7	1485238	1485244	0 %	100 %	0 %	0 %	219871638
23005	NC_011852	CCA	2	6	1485250	1485255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871638
23006	NC_011852	ATC	2	6	1485269	1485274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871638
23007	NC_011852	ATC	2	6	1485284	1485289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871638
23008	NC_011852	GCC	2	6	1485306	1485311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871638
23009	NC_011852	T	6	6	1485313	1485318	0 %	100 %	0 %	0 %	219871638
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23011	NC_011852	CAT	2	6	1485662	1485667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871638
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23118	NC_011852	TGT	2	6	1499991	1499996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871647
23119	NC_011852	TAC	2	6	1500014	1500019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871647
23120	NC_011852	ATA	2	6	1500030	1500035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871647
23121	NC_011852	AAT	2	6	1500102	1500107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871647
23122	NC_011852	CAAC	2	8	1500118	1500125	50 %	0 %	0 %	50 %	219871647
23123	NC_011852	GTT	2	6	1500255	1500260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871648
23124	NC_011852	ACT	2	6	1500274	1500279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871648
23125	NC_011852	GT	3	6	1500335	1500340	0 %	50 %	50 %	0 %	219871648
23126	NC_011852	CCAAT	2	10	1500368	1500377	40 %	20 %	0 %	40 %	219871648
23127	NC_011852	TCT	2	6	1500452	1500457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871648
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23129	NC_011852	AAT	2	6	1500556	1500561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871648
23130	NC_011852	TTG	2	6	1500568	1500573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871648
23131	NC_011852	TTG	2	6	1500583	1500588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871648
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23145	NC_011852	CTT	2	6	1501662	1501667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871649
23146	NC_011852	CCTGTA	2	12	1501671	1501682	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219871649
23147	NC_011852	CTT	2	6	1501722	1501727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871649
23148	NC_011852	ATA	2	6	1501850	1501855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871649
23149	NC_011852	TGG	2	6	1501947	1501952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871649
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23152	NC_011852	GTGA	2	8	1502122	1502129	25 %	25 %	50 %	0 %	219871649
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23154	NC_011852	GTG	2	6	1502250	1502255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871649
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23229	NC_011852	ACTCA	2	10	1506244	1506253	40 %	20 %	0 %	40 %	219871655
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23232	NC_011852	GGT	2	6	1506433	1506438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871655
23233	NC_011852	AGC	2	6	1506447	1506452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871655
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23352	NC_011852	TGC	2	6	1514363	1514368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871661
23353	NC_011852	CAG	3	9	1514380	1514388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871661
23354	NC_011852	TAT	2	6	1514419	1514424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871661
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23469	NC_011852	CTT	2	6	1521005	1521010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871666
23470	NC_011852	GCG	2	6	1521037	1521042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871666
23471	NC_011852	T	6	6	1521074	1521079	0 %	100 %	0 %	0 %	219871666
23472	NC_011852	GCG	2	6	1521121	1521126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871666
23473	NC_011852	TCA	2	6	1521184	1521189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871666
23474	NC_011852	TAAA	2	8	1521192	1521199	75 %	25 %	0 %	0 %	219871666
23475	NC_011852	TC	3	6	1521216	1521221	0 %	50 %	0 %	50 %	219871666
23476	NC_011852	ATTTGG	2	12	1521390	1521401	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219871666
23477	NC_011852	TTC	2	6	1521447	1521452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871666
23478	NC_011852	AAT	2	6	1521461	1521466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871666
23479	NC_011852	TG	3	6	1521580	1521585	0 %	50 %	50 %	0 %	219871666
23480	NC_011852	TTC	2	6	1521655	1521660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871666
23481	NC_011852	T	6	6	1521696	1521701	0 %	100 %	0 %	0 %	219871666
23482	NC_011852	GCT	2	6	1521703	1521708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871666
23483	NC_011852	CTG	2	6	1521728	1521733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871666
23484	NC_011852	ACA	2	6	1521832	1521837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871666
23485	NC_011852	T	6	6	1521906	1521911	0 %	100 %	0 %	0 %	219871666
23486	NC_011852	CTA	2	6	1522031	1522036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871666
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23488	NC_011852	GCG	2	6	1522168	1522173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871667
23489	NC_011852	TTG	2	6	1522225	1522230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871667
23490	NC_011852	AC	3	6	1522298	1522303	50 %	0 %	0 %	50 %	219871667
23491	NC_011852	ACC	2	6	1522339	1522344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871667
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23493	NC_011852	TGC	2	6	1522507	1522512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871667
23494	NC_011852	ACC	2	6	1522522	1522527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871667
23495	NC_011852	CAG	2	6	1522683	1522688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871667
23496	NC_011852	GCA	2	6	1522700	1522705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871667
23497	NC_011852	AAT	2	6	1522714	1522719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871667
23498	NC_011852	CAT	2	6	1522720	1522725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871667
23499	NC_011852	ACC	2	6	1522753	1522758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871667
23500	NC_011852	CCA	2	6	1522772	1522777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871667

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