MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_011852	GCTGTA	2	12	1377641	1377652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219871548
21503	NC_011852	TTG	2	6	1377657	1377662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871548
21504	NC_011852	TCG	2	6	1377679	1377684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871548
21505	NC_011852	GGT	2	6	1377695	1377700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871548
21506	NC_011852	ATT	2	6	1377755	1377760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871548
21507	NC_011852	CAG	2	6	1377768	1377773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871548
21508	NC_011852	TTTTG	2	10	1377790	1377799	0 %	80 %	20 %	0 %	219871548
21509	NC_011852	TTG	2	6	1377843	1377848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871548
21510	NC_011852	ATT	2	6	1377853	1377858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871548
21511	NC_011852	GA	3	6	1377910	1377915	50 %	0 %	50 %	0 %	219871548
21512	NC_011852	TGT	2	6	1377979	1377984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871548
21513	NC_011852	A	6	6	1378030	1378035	100 %	0 %	0 %	0 %	219871548
21514	NC_011852	CAA	2	6	1378052	1378057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871548
21515	NC_011852	TTGG	2	8	1378058	1378065	0 %	50 %	50 %	0 %	219871548
21516	NC_011852	GAT	2	6	1378082	1378087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871548
21517	NC_011852	AG	3	6	1378119	1378124	50 %	0 %	50 %	0 %	219871548
21518	NC_011852	ATT	2	6	1378150	1378155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871548
21519	NC_011852	A	6	6	1378193	1378198	100 %	0 %	0 %	0 %	219871548
21520	NC_011852	AT	4	8	1378209	1378216	50 %	50 %	0 %	0 %	219871548
21521	NC_011852	TAT	2	6	1378268	1378273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871549
21522	NC_011852	GTA	2	6	1378287	1378292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871549
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21526	NC_011852	AT	3	6	1378576	1378581	50 %	50 %	0 %	0 %	219871549
21527	NC_011852	TTAAA	2	10	1378591	1378600	60 %	40 %	0 %	0 %	219871549
21528	NC_011852	AAT	2	6	1378713	1378718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871549
21529	NC_011852	TTA	2	6	1385258	1385263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871550
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21539	NC_011852	ATA	2	6	1386153	1386158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871550
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21542	NC_011852	ATTG	2	8	1386284	1386291	25 %	50 %	25 %	0 %	219871551
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21552	NC_011852	GCT	2	6	1387002	1387007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871552
21553	NC_011852	CCA	2	6	1387050	1387055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871552
21554	NC_011852	T	7	7	1387081	1387087	0 %	100 %	0 %	0 %	219871552
21555	NC_011852	CTT	3	9	1387114	1387122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871552
21556	NC_011852	TGAA	2	8	1387199	1387206	50 %	25 %	25 %	0 %	219871553
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21558	NC_011852	ATC	2	6	1387224	1387229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871553
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21561	NC_011852	AT	3	6	1387314	1387319	50 %	50 %	0 %	0 %	219871553
21562	NC_011852	A	6	6	1387320	1387325	100 %	0 %	0 %	0 %	219871553
21563	NC_011852	T	6	6	1387408	1387413	0 %	100 %	0 %	0 %	219871553
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21566	NC_011852	AAAT	2	8	1387546	1387553	75 %	25 %	0 %	0 %	219871553
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21589	NC_011852	T	7	7	1388217	1388223	0 %	100 %	0 %	0 %	219871554
21590	NC_011852	A	6	6	1388278	1388283	100 %	0 %	0 %	0 %	219871554
21591	NC_011852	TCA	2	6	1388299	1388304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871554
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21603	NC_011852	CTG	2	6	1388664	1388669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871555
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21605	NC_011852	CTG	3	9	1388679	1388687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871555
21606	NC_011852	GCT	2	6	1388690	1388695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871555
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21610	NC_011852	TGCC	2	8	1388907	1388914	0 %	25 %	25 %	50 %	219871556
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