MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21119	NC_011852	TAA	2	6	1353531	1353536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871526
21120	NC_011852	TGA	2	6	1353554	1353559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871526
21121	NC_011852	GTT	2	6	1353627	1353632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871526
21122	NC_011852	TAA	2	6	1353675	1353680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871526
21123	NC_011852	TCT	2	6	1354357	1354362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871527
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21130	NC_011852	TGT	2	6	1354627	1354632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871527
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21132	NC_011852	TGT	2	6	1354753	1354758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871527
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21343	NC_011852	A	7	7	1366948	1366954	100 %	0 %	0 %	0 %	219871536
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21353	NC_011852	GAATT	2	10	1367739	1367748	40 %	40 %	20 %	0 %	219871536
21354	NC_011852	GTTGCC	2	12	1367756	1367767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871536
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21468	NC_011852	GCTCAA	2	12	1375904	1375915	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219871547
21469	NC_011852	ACA	2	6	1375918	1375923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871547
21470	NC_011852	AATC	2	8	1375931	1375938	50 %	25 %	0 %	25 %	219871547
21471	NC_011852	GGT	2	6	1376048	1376053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871547
21472	NC_011852	CAG	2	6	1376190	1376195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871547
21473	NC_011852	CAG	2	6	1376217	1376222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871547
21474	NC_011852	G	8	8	1376452	1376459	0 %	0 %	100 %	0 %	219871547
21475	NC_011852	TCT	2	6	1376468	1376473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871547
21476	NC_011852	A	6	6	1376486	1376491	100 %	0 %	0 %	0 %	219871547
21477	NC_011852	TGA	2	6	1376500	1376505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871547
21478	NC_011852	ATT	2	6	1376565	1376570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871547
21479	NC_011852	AAT	2	6	1376606	1376611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871547
21480	NC_011852	TGGAC	2	10	1376711	1376720	20 %	20 %	40 %	20 %	219871547
21481	NC_011852	AGC	2	6	1376731	1376736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871547
21482	NC_011852	GTT	2	6	1376806	1376811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871547
21483	NC_011852	TTA	2	6	1376816	1376821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871547
21484	NC_011852	CATT	2	8	1376823	1376830	25 %	50 %	0 %	25 %	219871547
21485	NC_011852	TAT	2	6	1376860	1376865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871547
21486	NC_011852	GAC	2	6	1376984	1376989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871547
21487	NC_011852	GAT	2	6	1377010	1377015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871547
21488	NC_011852	AGA	2	6	1377028	1377033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871547
21489	NC_011852	GTT	2	6	1377054	1377059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871547
21490	NC_011852	TTC	3	9	1377066	1377074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871547
21491	NC_011852	TTC	2	6	1377140	1377145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871547
21492	NC_011852	TAC	2	6	1377179	1377184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871547
21493	NC_011852	GGT	2	6	1377203	1377208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871547
21494	NC_011852	A	6	6	1377225	1377230	100 %	0 %	0 %	0 %	219871547
21495	NC_011852	ACA	2	6	1377259	1377264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871547
21496	NC_011852	TGA	2	6	1377270	1377275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871547
21497	NC_011852	TTC	2	6	1377302	1377307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871547
21498	NC_011852	AGA	2	6	1377396	1377401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871547
21499	NC_011852	AC	3	6	1377409	1377414	50 %	0 %	0 %	50 %	219871547
21500	NC_011852	TGT	2	6	1377463	1377468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871548

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