MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011852	CGTAAA	2	12	86532	86543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219870354
1502	NC_011852	TTC	3	9	86562	86570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870354
1503	NC_011852	ATC	2	6	86739	86744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870354
1504	NC_011852	TTC	2	6	86780	86785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870354
1505	NC_011852	ATT	2	6	86873	86878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870355
1506	NC_011852	GAA	2	6	86945	86950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870355
1507	NC_011852	ATA	2	6	86980	86985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870355
1508	NC_011852	GCA	2	6	87060	87065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870355
1509	NC_011852	GCA	2	6	87133	87138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870355
1510	NC_011852	GT	3	6	87145	87150	0 %	50 %	50 %	0 %	219870355
1511	NC_011852	TTG	2	6	87153	87158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870355
1512	NC_011852	AAC	2	6	87160	87165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870355
1513	NC_011852	CAA	2	6	87184	87189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870355
1514	NC_011852	CTGGG	2	10	87243	87252	0 %	20 %	60 %	20 %	219870355
1515	NC_011852	TAG	2	6	87254	87259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870355
1516	NC_011852	GGT	2	6	87287	87292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870355
1517	NC_011852	AGG	2	6	87296	87301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219870355
1518	NC_011852	GCAA	2	8	87368	87375	50 %	0 %	25 %	25 %	219870355
1519	NC_011852	A	7	7	87386	87392	100 %	0 %	0 %	0 %	219870355
1520	NC_011852	TC	3	6	87437	87442	0 %	50 %	0 %	50 %	219870355
1521	NC_011852	A	7	7	87446	87452	100 %	0 %	0 %	0 %	219870355
1522	NC_011852	GAA	2	6	87782	87787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870356
1523	NC_011852	ATT	2	6	87884	87889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870356
1524	NC_011852	GAA	2	6	87890	87895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870356
1525	NC_011852	TTGA	2	8	87986	87993	25 %	50 %	25 %	0 %	219870356
1526	NC_011852	GCAA	2	8	88000	88007	50 %	0 %	25 %	25 %	219870356
1527	NC_011852	CTTTGC	2	12	88021	88032	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219870356
1528	NC_011852	T	6	6	88040	88045	0 %	100 %	0 %	0 %	219870356
1529	NC_011852	TAT	2	6	88072	88077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870356
1530	NC_011852	AATG	2	8	88079	88086	50 %	25 %	25 %	0 %	219870356
1531	NC_011852	GTTG	2	8	88098	88105	0 %	50 %	50 %	0 %	219870356
1532	NC_011852	CAT	2	6	88112	88117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870356
1533	NC_011852	ATC	2	6	88119	88124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870356
1534	NC_011852	CAA	2	6	88136	88141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870356
1535	NC_011852	TAC	2	6	88143	88148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870356
1536	NC_011852	GGT	2	6	88198	88203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870356
1537	NC_011852	CAA	2	6	88232	88237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870356
1538	NC_011852	TGA	2	6	88264	88269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870356
1539	NC_011852	AAG	2	6	88284	88289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870356
1540	NC_011852	GCG	2	6	88361	88366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219870356
1541	NC_011852	TGG	2	6	88404	88409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870356
1542	NC_011852	TGG	2	6	88419	88424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870356
1543	NC_011852	TGA	2	6	88515	88520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870356
1544	NC_011852	T	6	6	88573	88578	0 %	100 %	0 %	0 %	219870356
1545	NC_011852	CGCT	2	8	88645	88652	0 %	25 %	25 %	50 %	219870356
1546	NC_011852	GTC	2	6	88677	88682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870356
1547	NC_011852	GTG	2	6	88685	88690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870356
1548	NC_011852	CAA	2	6	88694	88699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870356
1549	NC_011852	TGT	2	6	88720	88725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870356
1550	NC_011852	GAA	2	6	88778	88783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870356
1551	NC_011852	AAT	2	6	88799	88804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870356
1552	NC_011852	CAA	2	6	89139	89144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870357
1553	NC_011852	GAA	2	6	89172	89177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870357
1554	NC_011852	AGA	2	6	89330	89335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870357
1555	NC_011852	TCG	2	6	89399	89404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870357
1556	NC_011852	GTTAT	2	10	89410	89419	20 %	60 %	20 %	0 %	219870357
1557	NC_011852	TAA	3	9	89423	89431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870357
1558	NC_011852	A	6	6	89491	89496	100 %	0 %	0 %	0 %	219870357
1559	NC_011852	GA	3	6	89524	89529	50 %	0 %	50 %	0 %	219870357
1560	NC_011852	TCA	2	6	89588	89593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870357
1561	NC_011852	TATAT	2	10	89619	89628	40 %	60 %	0 %	0 %	219870357
1562	NC_011852	CAC	2	6	89655	89660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870357
1563	NC_011852	TTGA	2	8	89685	89692	25 %	50 %	25 %	0 %	219870357
1564	NC_011852	TTAT	2	8	89803	89810	25 %	75 %	0 %	0 %	219870357
1565	NC_011852	TAT	2	6	89856	89861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870357
1566	NC_011852	ATT	2	6	89953	89958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870358
1567	NC_011852	GT	3	6	90006	90011	0 %	50 %	50 %	0 %	219870358
1568	NC_011852	AAG	2	6	90015	90020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870358
1569	NC_011852	TTG	2	6	90111	90116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870358
1570	NC_011852	TGA	2	6	90181	90186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870358
1571	NC_011852	TGT	2	6	90205	90210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870358
1572	NC_011852	GAC	2	6	90298	90303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870358
1573	NC_011852	ACATT	2	10	90306	90315	40 %	40 %	0 %	20 %	219870358
1574	NC_011852	GAA	3	9	90383	90391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870358
1575	NC_011852	TGA	2	6	90427	90432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870358
1576	NC_011852	GCT	2	6	90458	90463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870358
1577	NC_011852	AG	3	6	90478	90483	50 %	0 %	50 %	0 %	219870358
1578	NC_011852	CTTTA	2	10	90561	90570	20 %	60 %	0 %	20 %	219870358
1579	NC_011852	ATTC	2	8	90623	90630	25 %	50 %	0 %	25 %	219870358
1580	NC_011852	TA	3	6	90717	90722	50 %	50 %	0 %	0 %	219870358
1581	NC_011852	CAGA	2	8	90827	90834	50 %	0 %	25 %	25 %	219870358
1582	NC_011852	ACC	2	6	90842	90847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870358
1583	NC_011852	TAT	2	6	90967	90972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870358
1584	NC_011852	ATT	2	6	90974	90979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870358
1585	NC_011852	GAA	3	9	90998	91006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870358
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1587	NC_011852	TTC	2	6	91156	91161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870358
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1589	NC_011852	GTA	2	6	91262	91267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870358
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1591	NC_011852	TTGC	2	8	91319	91326	0 %	50 %	25 %	25 %	219870358
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1593	NC_011852	TAT	2	6	91376	91381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870358
1594	NC_011852	GTA	3	9	91400	91408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870358
1595	NC_011852	TGA	2	6	91571	91576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870359
1596	NC_011852	A	6	6	91576	91581	100 %	0 %	0 %	0 %	219870359
1597	NC_011852	AGA	2	6	91692	91697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870359
1598	NC_011852	ACAG	2	8	91707	91714	50 %	0 %	25 %	25 %	219870359
1599	NC_011852	TGG	2	6	91788	91793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870359
1600	NC_011852	ATG	2	6	91796	91801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870359
1601	NC_011852	ACT	2	6	91817	91822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870359
1602	NC_011852	TAAA	2	8	91910	91917	75 %	25 %	0 %	0 %	219870359
1603	NC_011852	AATA	2	8	91933	91940	75 %	25 %	0 %	0 %	219870359
1604	NC_011852	ATT	2	6	91953	91958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870359
1605	NC_011852	TGA	2	6	92064	92069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870359
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1607	NC_011852	CAG	2	6	92132	92137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870359
1608	NC_011852	TTA	2	6	92161	92166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870359
1609	NC_011852	ATTT	2	8	92217	92224	25 %	75 %	0 %	0 %	219870359
1610	NC_011852	A	6	6	92275	92280	100 %	0 %	0 %	0 %	219870359
1611	NC_011852	TAT	2	6	92324	92329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870359
1612	NC_011852	TTAA	2	8	92386	92393	50 %	50 %	0 %	0 %	219870359
1613	NC_011852	A	6	6	92531	92536	100 %	0 %	0 %	0 %	219870359
1614	NC_011852	GAT	2	6	92548	92553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870359
1615	NC_011852	ATT	2	6	92769	92774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870360
1616	NC_011852	AGC	2	6	92786	92791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870360
1617	NC_011852	TGGT	2	8	92801	92808	0 %	50 %	50 %	0 %	219870360
1618	NC_011852	CAA	2	6	92817	92822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870360
1619	NC_011852	GAT	2	6	92826	92831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870360
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1621	NC_011852	A	6	6	92852	92857	100 %	0 %	0 %	0 %	219870360
1622	NC_011852	GGAA	2	8	92858	92865	50 %	0 %	50 %	0 %	219870360
1623	NC_011852	TA	3	6	92874	92879	50 %	50 %	0 %	0 %	219870360
1624	NC_011852	AGA	2	6	92942	92947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870360
1625	NC_011852	ATTT	2	8	93001	93008	25 %	75 %	0 %	0 %	219870360
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1998	NC_011852	AGC	2	6	118186	118191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870381
1999	NC_011852	GGAAA	2	10	118247	118256	60 %	0 %	40 %	0 %	219870381
2000	NC_011852	TGG	2	6	118269	118274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870381

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